MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-9

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017402	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017402	ATTAA	2	10	1781	1790	60 %	40 %	0 %	0 %	387827868
3	NC_017402	TGGCA	2	10	2331	2340	20 %	20 %	40 %	20 %	387827869
4	NC_017402	AATTA	2	10	2569	2578	60 %	40 %	0 %	0 %	387827869
5	NC_017402	ACAAG	2	10	2683	2692	60 %	0 %	20 %	20 %	387827870
6	NC_017402	AAGAG	2	10	3409	3418	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017402	GAAAA	2	10	6921	6930	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017402	AATCT	2	10	12216	12225	40 %	40 %	0 %	20 %	387827881
9	NC_017402	GGACT	2	10	12599	12608	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017402	AACTT	2	10	12684	12693	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017402	TACTT	2	10	13243	13252	20 %	60 %	0 %	20 %	387827882
12	NC_017402	GAAAA	2	10	13321	13330	80 %	0 %	20 %	0 %	387827882
13	NC_017402	AAAGT	2	10	13343	13352	60 %	20 %	20 %	0 %	387827882
14	NC_017402	ATTCA	2	10	14152	14161	40 %	40 %	0 %	20 %	387827883
15	NC_017402	ATTAA	2	10	15186	15195	60 %	40 %	0 %	0 %	387827885
16	NC_017402	AGTAA	2	10	15823	15832	60 %	20 %	20 %	0 %	387827887
17	NC_017402	TCACT	2	10	15980	15989	20 %	40 %	0 %	40 %	387827887
18	NC_017402	TTGCT	2	10	16077	16086	0 %	60 %	20 %	20 %	387827888
19	NC_017402	TATGT	2	10	16187	16196	20 %	60 %	20 %	0 %	387827888
20	NC_017402	CACTA	2	10	19318	19327	40 %	20 %	0 %	40 %	387827892
21	NC_017402	TTAAA	2	10	20961	20970	60 %	40 %	0 %	0 %	387827894
22	NC_017402	AAATA	2	10	21555	21564	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017402	TTTTA	2	10	22830	22839	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017402	GAGTT	2	10	24156	24165	20 %	40 %	40 %	0 %	387827897
25	NC_017402	ATAAA	2	10	24601	24610	80 %	20 %	0 %	0 %	387827898
26	NC_017402	ACTTG	2	10	24950	24959	20 %	40 %	20 %	20 %	387827898
27	NC_017402	ATTTT	2	10	25698	25707	20 %	80 %	0 %	0 %	387827899
28	NC_017402	AATTT	2	10	26049	26058	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017402	AAGCA	2	10	26355	26364	60 %	0 %	20 %	20 %	387827900
30	NC_017402	AAGAA	2	10	26471	26480	80 %	0 %	20 %	0 %	387827900
31	NC_017402	ATAAA	2	10	27403	27412	80 %	20 %	0 %	0 %	387827901
32	NC_017402	TAAAT	2	10	27623	27632	60 %	40 %	0 %	0 %	387827901
33	NC_017402	GAAAA	2	10	28242	28251	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017402	ATTTT	2	10	28447	28456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017402	TTACA	2	10	30490	30499	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.