MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-9

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017402	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017402	ATTA	2	8	945	952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017402	AGCA	2	8	1425	1432	50 %	0 %	25 %	25 %	387827868
4	NC_017402	TTGC	2	8	1613	1620	0 %	50 %	25 %	25 %	387827868
5	NC_017402	GTTC	2	8	1678	1685	0 %	50 %	25 %	25 %	387827868
6	NC_017402	TGCT	2	8	2531	2538	0 %	50 %	25 %	25 %	387827869
7	NC_017402	ATGT	2	8	3017	3024	25 %	50 %	25 %	0 %	387827870
8	NC_017402	GTAT	2	8	3042	3049	25 %	50 %	25 %	0 %	387827870
9	NC_017402	ATAA	2	8	3124	3131	75 %	25 %	0 %	0 %	387827870
10	NC_017402	TAAT	2	8	3173	3180	50 %	50 %	0 %	0 %	387827870
11	NC_017402	CAAT	2	8	3206	3213	50 %	25 %	0 %	25 %	387827870
12	NC_017402	TTTA	2	8	3895	3902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017402	GTAA	2	8	3933	3940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017402	AGTA	2	8	4788	4795	50 %	25 %	25 %	0 %	387827871
15	NC_017402	CTAC	2	8	4800	4807	25 %	25 %	0 %	50 %	387827871
16	NC_017402	TCAT	2	8	4847	4854	25 %	50 %	0 %	25 %	387827871
17	NC_017402	TTAC	2	8	5155	5162	25 %	50 %	0 %	25 %	387827872
18	NC_017402	AATG	2	8	5402	5409	50 %	25 %	25 %	0 %	387827872
19	NC_017402	AAGT	2	8	6067	6074	50 %	25 %	25 %	0 %	387827874
20	NC_017402	TTTA	2	8	7001	7008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017402	AGAA	2	8	7221	7228	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017402	GCTG	2	8	7335	7342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017402	GTTT	2	8	7858	7865	0 %	75 %	25 %	0 %	387827876
24	NC_017402	ATTT	2	8	8499	8506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017402	TGAG	2	8	8603	8610	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017402	CTTG	2	8	8801	8808	0 %	50 %	25 %	25 %	387827877
27	NC_017402	AATT	2	8	8947	8954	50 %	50 %	0 %	0 %	387827877
28	NC_017402	GTAA	2	8	9427	9434	50 %	25 %	25 %	0 %	387827878
29	NC_017402	GGTA	2	8	9828	9835	25 %	25 %	50 %	0 %	387827878
30	NC_017402	TTGA	2	8	10263	10270	25 %	50 %	25 %	0 %	387827878
31	NC_017402	CAAT	2	8	11013	11020	50 %	25 %	0 %	25 %	387827880
32	NC_017402	GGCA	2	8	11215	11222	25 %	0 %	50 %	25 %	387827880
33	NC_017402	ACAA	2	8	11562	11569	75 %	0 %	0 %	25 %	387827880
34	NC_017402	TTTC	2	8	11724	11731	0 %	75 %	0 %	25 %	387827880
35	NC_017402	TCAA	2	8	12122	12129	50 %	25 %	0 %	25 %	387827881
36	NC_017402	AATT	2	8	12395	12402	50 %	50 %	0 %	0 %	387827881
37	NC_017402	GTTT	2	8	12415	12422	0 %	75 %	25 %	0 %	387827881
38	NC_017402	TAAT	2	8	12957	12964	50 %	50 %	0 %	0 %	387827882
39	NC_017402	TATC	2	8	13848	13855	25 %	50 %	0 %	25 %	387827883
40	NC_017402	AAAC	2	8	14040	14047	75 %	0 %	0 %	25 %	387827883
41	NC_017402	ATTT	2	8	14056	14063	25 %	75 %	0 %	0 %	387827883
42	NC_017402	TAAA	2	8	14349	14356	75 %	25 %	0 %	0 %	387827884
43	NC_017402	GAAT	2	8	14584	14591	50 %	25 %	25 %	0 %	387827884
44	NC_017402	TATT	2	8	14974	14981	25 %	75 %	0 %	0 %	387827884
45	NC_017402	TCAA	2	8	15613	15620	50 %	25 %	0 %	25 %	387827886
46	NC_017402	AGGA	2	8	15685	15692	50 %	0 %	50 %	0 %	387827886
47	NC_017402	CTAT	2	8	15697	15704	25 %	50 %	0 %	25 %	387827886
48	NC_017402	AACA	2	8	15713	15720	75 %	0 %	0 %	25 %	387827886
49	NC_017402	TAAC	2	8	15767	15774	50 %	25 %	0 %	25 %	387827887
50	NC_017402	ATAG	2	8	16798	16805	50 %	25 %	25 %	0 %	387827889
51	NC_017402	AGAT	2	8	16817	16824	50 %	25 %	25 %	0 %	387827889
52	NC_017402	ATAG	2	8	16852	16859	50 %	25 %	25 %	0 %	387827889
53	NC_017402	TCTT	2	8	17841	17848	0 %	75 %	0 %	25 %	387827891
54	NC_017402	CTTG	2	8	18245	18252	0 %	50 %	25 %	25 %	387827891
55	NC_017402	AAGA	3	12	19602	19613	75 %	0 %	25 %	0 %	387827892
56	NC_017402	AATA	2	8	19729	19736	75 %	25 %	0 %	0 %	387827892
57	NC_017402	GAAA	2	8	19795	19802	75 %	0 %	25 %	0 %	387827892
58	NC_017402	AAAT	2	8	19881	19888	75 %	25 %	0 %	0 %	387827892
59	NC_017402	GAAA	2	8	19994	20001	75 %	0 %	25 %	0 %	387827892
60	NC_017402	AAAT	2	8	20569	20576	75 %	25 %	0 %	0 %	387827893
61	NC_017402	TTTA	2	8	20714	20721	25 %	75 %	0 %	0 %	387827893
62	NC_017402	TCAA	2	8	20834	20841	50 %	25 %	0 %	25 %	387827894
63	NC_017402	AAAG	2	8	20894	20901	75 %	0 %	25 %	0 %	387827894
64	NC_017402	AATT	2	8	21256	21263	50 %	50 %	0 %	0 %	387827894
65	NC_017402	AATA	2	8	21307	21314	75 %	25 %	0 %	0 %	387827894
66	NC_017402	AGAT	2	8	22355	22362	50 %	25 %	25 %	0 %	387827896
67	NC_017402	AGAT	2	8	22388	22395	50 %	25 %	25 %	0 %	387827896
68	NC_017402	ATAG	2	8	22456	22463	50 %	25 %	25 %	0 %	387827896
69	NC_017402	ATAG	2	8	22489	22496	50 %	25 %	25 %	0 %	387827896
70	NC_017402	AGAT	2	8	22508	22515	50 %	25 %	25 %	0 %	387827896
71	NC_017402	ATAG	2	8	22564	22571	50 %	25 %	25 %	0 %	387827896
72	NC_017402	AAAT	2	8	22616	22623	75 %	25 %	0 %	0 %	387827896
73	NC_017402	AAAT	2	8	22903	22910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017402	TATT	2	8	22967	22974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017402	TATT	2	8	23181	23188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017402	AATC	2	8	24224	24231	50 %	25 %	0 %	25 %	387827897
77	NC_017402	AGAT	2	8	24448	24455	50 %	25 %	25 %	0 %	387827897
78	NC_017402	AAAT	3	12	25171	25182	75 %	25 %	0 %	0 %	387827899
79	NC_017402	TTTA	2	8	25202	25209	25 %	75 %	0 %	0 %	387827899
80	NC_017402	ACCA	2	8	25555	25562	50 %	0 %	0 %	50 %	387827899
81	NC_017402	AATT	2	8	25604	25611	50 %	50 %	0 %	0 %	387827899
82	NC_017402	TTTA	2	8	25727	25734	25 %	75 %	0 %	0 %	387827899
83	NC_017402	TGCA	2	8	25937	25944	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017402	AAGA	2	8	26005	26012	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017402	TTGT	2	8	26266	26273	0 %	75 %	25 %	0 %	387827900
86	NC_017402	TATG	2	8	26318	26325	25 %	50 %	25 %	0 %	387827900
87	NC_017402	AAAG	2	8	27368	27375	75 %	0 %	25 %	0 %	387827901
88	NC_017402	TTTA	2	8	27997	28004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017402	AAGG	2	8	28297	28304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017402	TTTG	2	8	28363	28370	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017402	ATGA	2	8	28504	28511	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017402	TAAA	2	8	29113	29120	75 %	25 %	0 %	0 %	387827902
93	NC_017402	AATT	2	8	29159	29166	50 %	50 %	0 %	0 %	387827902
94	NC_017402	CAAA	2	8	29318	29325	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017402	AAAT	2	8	29356	29363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017402	AATT	2	8	29407	29414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017402	TGAT	2	8	29721	29728	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017402	AGCA	2	8	30082	30089	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017402	AAAT	2	8	30108	30115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.