MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-9

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017402	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017402	ATTA	2	8	945	952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017402	TTTA	2	8	3895	3902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017402	GTAA	2	8	3933	3940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017402	TTTA	2	8	7001	7008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017402	AGAA	2	8	7221	7228	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017402	GCTG	2	8	7335	7342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017402	ATTT	2	8	8499	8506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017402	TGAG	2	8	8603	8610	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017402	AAAT	2	8	22903	22910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017402	TATT	2	8	22967	22974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017402	TATT	2	8	23181	23188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017402	TGCA	2	8	25937	25944	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017402	AAGA	2	8	26005	26012	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017402	TTTA	2	8	27997	28004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017402	AAGG	2	8	28297	28304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017402	TTTG	2	8	28363	28370	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017402	ATGA	2	8	28504	28511	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017402	CAAA	2	8	29318	29325	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017402	AAAT	2	8	29356	29363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017402	AATT	2	8	29407	29414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017402	TGAT	2	8	29721	29728	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017402	AGCA	2	8	30082	30089	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017402	AAAT	2	8	30108	30115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.