MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-9

Total Repeats: 436

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017402	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017402	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017402	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017402	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017402	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017402	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017402	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017402	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017402	AAT	2	6	718	723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017402	TCT	2	6	745	750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017402	TTA	2	6	817	822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017402	AAT	2	6	856	861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017402	TTA	2	6	905	910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017402	AGG	2	6	932	937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017402	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017402	ATT	2	6	1049	1054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017402	GAA	2	6	1162	1167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017402	AGT	2	6	1231	1236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017402	TAA	2	6	1242	1247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017402	GAG	2	6	1249	1254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017402	ATT	2	6	1275	1280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017402	AGA	2	6	1318	1323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827868
23	NC_017402	AGA	2	6	1327	1332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827868
24	NC_017402	AGA	2	6	1351	1356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827868
25	NC_017402	GCA	2	6	1357	1362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827868
26	NC_017402	ATT	2	6	1531	1536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827868
27	NC_017402	AGG	2	6	1605	1610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827868
28	NC_017402	TTC	3	9	1810	1818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827868
29	NC_017402	AGA	2	6	1855	1860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827868
30	NC_017402	AGA	2	6	2037	2042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827869
31	NC_017402	TAG	2	6	2172	2177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827869
32	NC_017402	ACA	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827869
33	NC_017402	TGG	3	9	2280	2288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827869
34	NC_017402	TGA	2	6	2619	2624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827870
35	NC_017402	TGA	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827870
36	NC_017402	AGA	2	6	2892	2897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827870
37	NC_017402	TAG	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827870
38	NC_017402	TTA	2	6	3140	3145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827870
39	NC_017402	TGG	3	9	3153	3161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827870
40	NC_017402	CCA	2	6	3163	3168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827870
41	NC_017402	TGG	2	6	3336	3341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827870
42	NC_017402	ATC	2	6	3556	3561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017402	TGG	2	6	3653	3658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017402	GAT	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017402	AAT	2	6	3732	3737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017402	TAG	2	6	3751	3756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017402	TAA	2	6	3797	3802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017402	GGA	2	6	3957	3962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017402	ATT	2	6	3974	3979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
50	NC_017402	TGA	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827871
51	NC_017402	ATT	2	6	3988	3993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
52	NC_017402	TAT	2	6	4037	4042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
53	NC_017402	CCA	2	6	4094	4099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827871
54	NC_017402	ACA	2	6	4140	4145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827871
55	NC_017402	ATT	2	6	4207	4212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
56	NC_017402	TAA	3	9	4292	4300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827871
57	NC_017402	AGT	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827871
58	NC_017402	TTA	2	6	4354	4359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
59	NC_017402	ACT	2	6	4439	4444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827871
60	NC_017402	AGA	2	6	4466	4471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827871
61	NC_017402	GTG	2	6	4480	4485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827871
62	NC_017402	CGA	2	6	4550	4555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827871
63	NC_017402	GAT	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827871
64	NC_017402	CAG	2	6	4621	4626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827871
65	NC_017402	AGT	2	6	4641	4646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827871
66	NC_017402	TAA	2	6	4691	4696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827871
67	NC_017402	AGA	2	6	4700	4705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827871
68	NC_017402	TTA	2	6	4771	4776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
69	NC_017402	GGT	2	6	4872	4877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827871
70	NC_017402	CTA	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827871
71	NC_017402	GAA	3	9	4987	4995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827872
72	NC_017402	GTT	2	6	5200	5205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827872
73	NC_017402	ATT	2	6	5261	5266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827872
74	NC_017402	TAG	2	6	5271	5276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827872
75	NC_017402	GAA	2	6	5287	5292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827872
76	NC_017402	GGC	2	6	5293	5298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387827872
77	NC_017402	TGT	2	6	5495	5500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827873
78	NC_017402	TTC	2	6	5516	5521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827873
79	NC_017402	TTA	2	6	5569	5574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827873
80	NC_017402	TGG	2	6	5818	5823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827874
81	NC_017402	TAG	2	6	5899	5904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827874
82	NC_017402	AAT	2	6	5927	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827874
83	NC_017402	CTA	2	6	6020	6025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827874
84	NC_017402	GTA	2	6	6084	6089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827874
85	NC_017402	GCA	2	6	6095	6100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827874
86	NC_017402	TTG	2	6	6108	6113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827874
87	NC_017402	AAT	2	6	6235	6240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827875
88	NC_017402	ATC	2	6	6269	6274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827875
89	NC_017402	GCT	2	6	6295	6300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827875
90	NC_017402	ATA	2	6	6310	6315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827875
91	NC_017402	TAA	2	6	6552	6557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827875
92	NC_017402	AGG	2	6	6692	6697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827875
93	NC_017402	TAG	2	6	6757	6762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017402	ATT	2	6	6768	6773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017402	TAA	2	6	6814	6819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017402	TGC	2	6	6823	6828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017402	TAA	2	6	6856	6861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017402	GAA	2	6	6974	6979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017402	TGT	2	6	7063	7068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017402	TTA	2	6	7071	7076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017402	GAT	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017402	GAT	2	6	7121	7126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017402	TAA	3	9	7245	7253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017402	TTG	2	6	7352	7357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017402	CTT	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017402	AAG	2	6	7448	7453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017402	ATT	2	6	7519	7524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017402	TTA	2	6	7529	7534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017402	ATA	2	6	7660	7665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017402	TAC	2	6	7773	7778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017402	TGG	2	6	7872	7877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827876
112	NC_017402	CAA	2	6	7922	7927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827876
113	NC_017402	TAG	2	6	7938	7943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827876
114	NC_017402	TAA	2	6	7964	7969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827876
115	NC_017402	TGA	2	6	8058	8063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827876
116	NC_017402	ACA	2	6	8072	8077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827876
117	NC_017402	ATT	2	6	8140	8145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827876
118	NC_017402	AAG	2	6	8178	8183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827876
119	NC_017402	CTG	2	6	8189	8194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827876
120	NC_017402	ACA	2	6	8252	8257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827876
121	NC_017402	TTA	2	6	8508	8513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017402	TTG	2	6	8525	8530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017402	AAT	2	6	8532	8537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017402	AAT	2	6	8617	8622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017402	TCA	2	6	8692	8697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017402	TGC	2	6	9018	9023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827878
127	NC_017402	GTA	2	6	9095	9100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827878
128	NC_017402	AAT	2	6	9118	9123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827878
129	NC_017402	GAC	2	6	9296	9301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827878
130	NC_017402	AGC	2	6	9351	9356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827878
131	NC_017402	TTG	2	6	9374	9379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827878
132	NC_017402	CGG	2	6	9438	9443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387827878
133	NC_017402	TTA	2	6	9458	9463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827878
134	NC_017402	ACA	2	6	9538	9543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827878
135	NC_017402	AAC	2	6	9545	9550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827878
136	NC_017402	AGA	2	6	9633	9638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827878
137	NC_017402	GCA	2	6	9772	9777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827878
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258	NC_017402	TCC	2	6	18770	18775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
259	NC_017402	TAA	2	6	18788	18793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_017402	CTT	2	6	18827	18832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_017402	TAC	2	6	18953	18958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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422	NC_017402	ATA	2	6	29943	29948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.