MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-9

Total Repeats: 318

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017402	AGA	2	6	1318	1323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827868
2	NC_017402	AGA	2	6	1327	1332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827868
3	NC_017402	AGA	2	6	1351	1356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827868
4	NC_017402	GCA	2	6	1357	1362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827868
5	NC_017402	ATT	2	6	1531	1536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827868
6	NC_017402	AGG	2	6	1605	1610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827868
7	NC_017402	TTC	3	9	1810	1818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827868
8	NC_017402	AGA	2	6	1855	1860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827868
9	NC_017402	AGA	2	6	2037	2042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827869
10	NC_017402	TAG	2	6	2172	2177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827869
11	NC_017402	ACA	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827869
12	NC_017402	TGG	3	9	2280	2288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827869
13	NC_017402	TGA	2	6	2619	2624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827870
14	NC_017402	TGA	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827870
15	NC_017402	AGA	2	6	2892	2897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827870
16	NC_017402	TAG	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827870
17	NC_017402	TTA	2	6	3140	3145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827870
18	NC_017402	TGG	3	9	3153	3161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827870
19	NC_017402	CCA	2	6	3163	3168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827870
20	NC_017402	TGG	2	6	3336	3341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827870
21	NC_017402	ATT	2	6	3974	3979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
22	NC_017402	TGA	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827871
23	NC_017402	ATT	2	6	3988	3993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
24	NC_017402	TAT	2	6	4037	4042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
25	NC_017402	CCA	2	6	4094	4099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827871
26	NC_017402	ACA	2	6	4140	4145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827871
27	NC_017402	ATT	2	6	4207	4212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
28	NC_017402	TAA	3	9	4292	4300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827871
29	NC_017402	AGT	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827871
30	NC_017402	TTA	2	6	4354	4359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
31	NC_017402	ACT	2	6	4439	4444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827871
32	NC_017402	AGA	2	6	4466	4471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827871
33	NC_017402	GTG	2	6	4480	4485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827871
34	NC_017402	CGA	2	6	4550	4555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827871
35	NC_017402	GAT	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827871
36	NC_017402	CAG	2	6	4621	4626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827871
37	NC_017402	AGT	2	6	4641	4646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827871
38	NC_017402	TAA	2	6	4691	4696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827871
39	NC_017402	AGA	2	6	4700	4705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827871
40	NC_017402	TTA	2	6	4771	4776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
41	NC_017402	GGT	2	6	4872	4877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827871
42	NC_017402	CTA	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827871
43	NC_017402	GAA	3	9	4987	4995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827872
44	NC_017402	GTT	2	6	5200	5205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827872
45	NC_017402	ATT	2	6	5261	5266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827872
46	NC_017402	TAG	2	6	5271	5276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827872
47	NC_017402	GAA	2	6	5287	5292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827872
48	NC_017402	GGC	2	6	5293	5298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387827872
49	NC_017402	TGT	2	6	5495	5500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827873
50	NC_017402	TTC	2	6	5516	5521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827873
51	NC_017402	TTA	2	6	5569	5574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827873
52	NC_017402	TGG	2	6	5818	5823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827874
53	NC_017402	TAG	2	6	5899	5904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827874
54	NC_017402	AAT	2	6	5927	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827874
55	NC_017402	CTA	2	6	6020	6025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827874
56	NC_017402	GTA	2	6	6084	6089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827874
57	NC_017402	GCA	2	6	6095	6100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827874
58	NC_017402	TTG	2	6	6108	6113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827874
59	NC_017402	AAT	2	6	6235	6240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827875
60	NC_017402	ATC	2	6	6269	6274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827875
61	NC_017402	GCT	2	6	6295	6300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827875
62	NC_017402	ATA	2	6	6310	6315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827875
63	NC_017402	TAA	2	6	6552	6557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827875
64	NC_017402	AGG	2	6	6692	6697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827875
65	NC_017402	TGG	2	6	7872	7877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827876
66	NC_017402	CAA	2	6	7922	7927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827876
67	NC_017402	TAG	2	6	7938	7943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827876
68	NC_017402	TAA	2	6	7964	7969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827876
69	NC_017402	TGA	2	6	8058	8063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827876
70	NC_017402	ACA	2	6	8072	8077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827876
71	NC_017402	ATT	2	6	8140	8145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827876
72	NC_017402	AAG	2	6	8178	8183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827876
73	NC_017402	CTG	2	6	8189	8194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827876
74	NC_017402	ACA	2	6	8252	8257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827876
75	NC_017402	TGC	2	6	9018	9023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827878
76	NC_017402	GTA	2	6	9095	9100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827878
77	NC_017402	AAT	2	6	9118	9123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827878
78	NC_017402	GAC	2	6	9296	9301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827878
79	NC_017402	AGC	2	6	9351	9356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827878
80	NC_017402	TTG	2	6	9374	9379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827878
81	NC_017402	CGG	2	6	9438	9443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387827878
82	NC_017402	TTA	2	6	9458	9463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827878
83	NC_017402	ACA	2	6	9538	9543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827878
84	NC_017402	AAC	2	6	9545	9550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827878
85	NC_017402	AGA	2	6	9633	9638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827878
86	NC_017402	GCA	2	6	9772	9777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827878
87	NC_017402	TGA	2	6	9783	9788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827878
88	NC_017402	CTG	2	6	10037	10042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827878
89	NC_017402	AAT	2	6	10077	10082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827878
90	NC_017402	AAG	2	6	10115	10120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827878
91	NC_017402	AAT	2	6	10325	10330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827879
92	NC_017402	AAC	2	6	10384	10389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827879
93	NC_017402	GTT	2	6	10527	10532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827879
94	NC_017402	TAT	2	6	10553	10558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827879
95	NC_017402	CTA	2	6	10691	10696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827879
96	NC_017402	AAC	2	6	10722	10727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827879
97	NC_017402	TGA	2	6	10837	10842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827879
98	NC_017402	CTA	2	6	10916	10921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827880
99	NC_017402	TCA	2	6	11066	11071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827880
100	NC_017402	AAG	2	6	11148	11153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827880
101	NC_017402	AAG	2	6	11355	11360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827880
102	NC_017402	TAA	2	6	11502	11507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827880
103	NC_017402	TAC	2	6	11585	11590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827880
104	NC_017402	AGA	2	6	11599	11604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827880
105	NC_017402	CAA	2	6	11627	11632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827880
106	NC_017402	GTA	2	6	11857	11862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827880
107	NC_017402	ACA	2	6	12005	12010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827881
108	NC_017402	AAG	2	6	12016	12021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827881
109	NC_017402	AAT	2	6	12252	12257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827881
110	NC_017402	AAC	2	6	12275	12280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827881
111	NC_017402	AGG	2	6	12347	12352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827881
112	NC_017402	ATA	2	6	12894	12899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827882
113	NC_017402	ATT	2	6	12920	12925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827882
114	NC_017402	TCT	2	6	12929	12934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827882
115	NC_017402	GAA	3	9	12947	12955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827882
116	NC_017402	GCT	2	6	13013	13018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827882
117	NC_017402	GAA	2	6	13022	13027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827882
118	NC_017402	TCT	2	6	13034	13039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827882
119	NC_017402	AAC	2	6	13228	13233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827882
120	NC_017402	ATT	2	6	13421	13426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827882
121	NC_017402	TGA	2	6	13606	13611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827882
122	NC_017402	TAC	2	6	13630	13635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827882
123	NC_017402	TAC	2	6	13990	13995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827883
124	NC_017402	TAA	2	6	14034	14039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827883
125	NC_017402	TAC	2	6	14050	14055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827883
126	NC_017402	AAG	2	6	14114	14119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827883
127	NC_017402	TGC	2	6	14128	14133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827883
128	NC_017402	TTA	2	6	14196	14201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827883
129	NC_017402	ATT	2	6	14207	14212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827883
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134	NC_017402	AGA	2	6	14323	14328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827884
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.