MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-9

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017402	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017402	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017402	CT	3	6	675	680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017402	GA	3	6	1740	1745	50 %	0 %	50 %	0 %	387827868
5	NC_017402	TA	3	6	2967	2972	50 %	50 %	0 %	0 %	387827870
6	NC_017402	CT	3	6	3190	3195	0 %	50 %	0 %	50 %	387827870
7	NC_017402	AT	3	6	4277	4282	50 %	50 %	0 %	0 %	387827871
8	NC_017402	TC	3	6	4312	4317	0 %	50 %	0 %	50 %	387827871
9	NC_017402	TA	3	6	5136	5141	50 %	50 %	0 %	0 %	387827872
10	NC_017402	TG	3	6	5386	5391	0 %	50 %	50 %	0 %	387827872
11	NC_017402	AG	3	6	5527	5532	50 %	0 %	50 %	0 %	387827873
12	NC_017402	AT	3	6	5920	5925	50 %	50 %	0 %	0 %	387827874
13	NC_017402	TA	3	6	5936	5941	50 %	50 %	0 %	0 %	387827874
14	NC_017402	AT	4	8	6412	6419	50 %	50 %	0 %	0 %	387827875
15	NC_017402	AC	3	6	7054	7059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017402	TA	3	6	7501	7506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017402	AG	3	6	9175	9180	50 %	0 %	50 %	0 %	387827878
18	NC_017402	GA	3	6	9977	9982	50 %	0 %	50 %	0 %	387827878
19	NC_017402	AT	3	6	10608	10613	50 %	50 %	0 %	0 %	387827879
20	NC_017402	TA	3	6	10641	10646	50 %	50 %	0 %	0 %	387827879
21	NC_017402	TA	4	8	10762	10769	50 %	50 %	0 %	0 %	387827879
22	NC_017402	AT	3	6	11168	11173	50 %	50 %	0 %	0 %	387827880
23	NC_017402	TA	3	6	11668	11673	50 %	50 %	0 %	0 %	387827880
24	NC_017402	CA	3	6	11695	11700	50 %	0 %	0 %	50 %	387827880
25	NC_017402	CA	3	6	12060	12065	50 %	0 %	0 %	50 %	387827881
26	NC_017402	TA	3	6	12183	12188	50 %	50 %	0 %	0 %	387827881
27	NC_017402	CA	3	6	12341	12346	50 %	0 %	0 %	50 %	387827881
28	NC_017402	CA	3	6	12735	12740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017402	AT	3	6	13133	13138	50 %	50 %	0 %	0 %	387827882
30	NC_017402	AT	3	6	13819	13824	50 %	50 %	0 %	0 %	387827883
31	NC_017402	TA	3	6	15027	15032	50 %	50 %	0 %	0 %	387827884
32	NC_017402	TA	3	6	15128	15133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017402	AT	3	6	15442	15447	50 %	50 %	0 %	0 %	387827886
34	NC_017402	AT	3	6	15852	15857	50 %	50 %	0 %	0 %	387827887
35	NC_017402	AT	3	6	16020	16025	50 %	50 %	0 %	0 %	387827887
36	NC_017402	AT	3	6	16325	16330	50 %	50 %	0 %	0 %	387827888
37	NC_017402	AT	3	6	16552	16557	50 %	50 %	0 %	0 %	387827889
38	NC_017402	AT	3	6	17025	17030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017402	CA	3	6	17748	17753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017402	AT	3	6	17825	17830	50 %	50 %	0 %	0 %	387827891
41	NC_017402	TA	3	6	18801	18806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017402	AC	3	6	19257	19262	50 %	0 %	0 %	50 %	387827892
43	NC_017402	TA	3	6	20749	20754	50 %	50 %	0 %	0 %	387827893
44	NC_017402	AT	3	6	21028	21033	50 %	50 %	0 %	0 %	387827894
45	NC_017402	AG	3	6	21364	21369	50 %	0 %	50 %	0 %	387827894
46	NC_017402	AT	3	6	21867	21872	50 %	50 %	0 %	0 %	387827895
47	NC_017402	AT	3	6	22541	22546	50 %	50 %	0 %	0 %	387827896
48	NC_017402	AT	3	6	22595	22600	50 %	50 %	0 %	0 %	387827896
49	NC_017402	TA	3	6	22771	22776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017402	TA	3	6	23565	23570	50 %	50 %	0 %	0 %	387827897
51	NC_017402	AG	3	6	24062	24067	50 %	0 %	50 %	0 %	387827897
52	NC_017402	AT	3	6	24755	24760	50 %	50 %	0 %	0 %	387827898
53	NC_017402	GA	3	6	25196	25201	50 %	0 %	50 %	0 %	387827899
54	NC_017402	TA	3	6	25450	25455	50 %	50 %	0 %	0 %	387827899
55	NC_017402	AT	3	6	26029	26034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017402	GA	3	6	26104	26109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017402	TA	3	6	26176	26181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017402	AT	3	6	26699	26704	50 %	50 %	0 %	0 %	387827900
59	NC_017402	AG	3	6	27185	27190	50 %	0 %	50 %	0 %	387827901
60	NC_017402	AG	3	6	27242	27247	50 %	0 %	50 %	0 %	387827901
61	NC_017402	AT	3	6	27495	27500	50 %	50 %	0 %	0 %	387827901
62	NC_017402	AT	3	6	27647	27652	50 %	50 %	0 %	0 %	387827901
63	NC_017402	TA	3	6	28003	28008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017402	TA	3	6	28061	28066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017402	TG	3	6	28847	28852	0 %	50 %	50 %	0 %	387827902
66	NC_017402	AT	3	6	29189	29194	50 %	50 %	0 %	0 %	387827902
67	NC_017402	AT	3	6	29373	29378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017402	AT	3	6	29713	29718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017402	TA	3	6	30048	30053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017402	AG	3	6	30617	30622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.