MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-9

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017402	GA	3	6	1740	1745	50 %	0 %	50 %	0 %	387827868
2	NC_017402	TA	3	6	2967	2972	50 %	50 %	0 %	0 %	387827870
3	NC_017402	CT	3	6	3190	3195	0 %	50 %	0 %	50 %	387827870
4	NC_017402	AT	3	6	4277	4282	50 %	50 %	0 %	0 %	387827871
5	NC_017402	TC	3	6	4312	4317	0 %	50 %	0 %	50 %	387827871
6	NC_017402	TA	3	6	5136	5141	50 %	50 %	0 %	0 %	387827872
7	NC_017402	TG	3	6	5386	5391	0 %	50 %	50 %	0 %	387827872
8	NC_017402	AG	3	6	5527	5532	50 %	0 %	50 %	0 %	387827873
9	NC_017402	AT	3	6	5920	5925	50 %	50 %	0 %	0 %	387827874
10	NC_017402	TA	3	6	5936	5941	50 %	50 %	0 %	0 %	387827874
11	NC_017402	AT	4	8	6412	6419	50 %	50 %	0 %	0 %	387827875
12	NC_017402	AG	3	6	9175	9180	50 %	0 %	50 %	0 %	387827878
13	NC_017402	GA	3	6	9977	9982	50 %	0 %	50 %	0 %	387827878
14	NC_017402	AT	3	6	10608	10613	50 %	50 %	0 %	0 %	387827879
15	NC_017402	TA	3	6	10641	10646	50 %	50 %	0 %	0 %	387827879
16	NC_017402	TA	4	8	10762	10769	50 %	50 %	0 %	0 %	387827879
17	NC_017402	AT	3	6	11168	11173	50 %	50 %	0 %	0 %	387827880
18	NC_017402	TA	3	6	11668	11673	50 %	50 %	0 %	0 %	387827880
19	NC_017402	CA	3	6	11695	11700	50 %	0 %	0 %	50 %	387827880
20	NC_017402	CA	3	6	12060	12065	50 %	0 %	0 %	50 %	387827881
21	NC_017402	TA	3	6	12183	12188	50 %	50 %	0 %	0 %	387827881
22	NC_017402	CA	3	6	12341	12346	50 %	0 %	0 %	50 %	387827881
23	NC_017402	AT	3	6	13133	13138	50 %	50 %	0 %	0 %	387827882
24	NC_017402	AT	3	6	13819	13824	50 %	50 %	0 %	0 %	387827883
25	NC_017402	TA	3	6	15027	15032	50 %	50 %	0 %	0 %	387827884
26	NC_017402	AT	3	6	15442	15447	50 %	50 %	0 %	0 %	387827886
27	NC_017402	AT	3	6	15852	15857	50 %	50 %	0 %	0 %	387827887
28	NC_017402	AT	3	6	16020	16025	50 %	50 %	0 %	0 %	387827887
29	NC_017402	AT	3	6	16325	16330	50 %	50 %	0 %	0 %	387827888
30	NC_017402	AT	3	6	16552	16557	50 %	50 %	0 %	0 %	387827889
31	NC_017402	AT	3	6	17825	17830	50 %	50 %	0 %	0 %	387827891
32	NC_017402	AC	3	6	19257	19262	50 %	0 %	0 %	50 %	387827892
33	NC_017402	TA	3	6	20749	20754	50 %	50 %	0 %	0 %	387827893
34	NC_017402	AT	3	6	21028	21033	50 %	50 %	0 %	0 %	387827894
35	NC_017402	AG	3	6	21364	21369	50 %	0 %	50 %	0 %	387827894
36	NC_017402	AT	3	6	21867	21872	50 %	50 %	0 %	0 %	387827895
37	NC_017402	AT	3	6	22541	22546	50 %	50 %	0 %	0 %	387827896
38	NC_017402	AT	3	6	22595	22600	50 %	50 %	0 %	0 %	387827896
39	NC_017402	TA	3	6	23565	23570	50 %	50 %	0 %	0 %	387827897
40	NC_017402	AG	3	6	24062	24067	50 %	0 %	50 %	0 %	387827897
41	NC_017402	AT	3	6	24755	24760	50 %	50 %	0 %	0 %	387827898
42	NC_017402	GA	3	6	25196	25201	50 %	0 %	50 %	0 %	387827899
43	NC_017402	TA	3	6	25450	25455	50 %	50 %	0 %	0 %	387827899
44	NC_017402	AT	3	6	26699	26704	50 %	50 %	0 %	0 %	387827900
45	NC_017402	AG	3	6	27185	27190	50 %	0 %	50 %	0 %	387827901
46	NC_017402	AG	3	6	27242	27247	50 %	0 %	50 %	0 %	387827901
47	NC_017402	AT	3	6	27495	27500	50 %	50 %	0 %	0 %	387827901
48	NC_017402	AT	3	6	27647	27652	50 %	50 %	0 %	0 %	387827901
49	NC_017402	TG	3	6	28847	28852	0 %	50 %	50 %	0 %	387827902
50	NC_017402	AT	3	6	29189	29194	50 %	50 %	0 %	0 %	387827902

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.