MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp26

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017401	ATTTG	2	10	1822	1831	20 %	60 %	20 %	0 %	387827987
2	NC_017401	TTAAA	2	10	2262	2271	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017401	TAAAA	2	10	3662	3671	80 %	20 %	0 %	0 %	387827988
4	NC_017401	TATAA	2	10	4007	4016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017401	TTTTA	2	10	4321	4330	20 %	80 %	0 %	0 %	387827989
6	NC_017401	ATTAG	2	10	5058	5067	40 %	40 %	20 %	0 %	387827991
7	NC_017401	TAAAA	2	10	6294	6303	80 %	20 %	0 %	0 %	387827992
8	NC_017401	AAAAT	2	10	6490	6499	80 %	20 %	0 %	0 %	387827992
9	NC_017401	AAATT	2	10	6630	6639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017401	ACTTT	2	10	7755	7764	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017401	GAAAT	2	10	10151	10160	60 %	20 %	20 %	0 %	387827997
12	NC_017401	TATGC	2	10	10432	10441	20 %	40 %	20 %	20 %	387827997
13	NC_017401	TTCTG	2	10	11190	11199	0 %	60 %	20 %	20 %	387827998
14	NC_017401	AATTT	2	10	12037	12046	40 %	60 %	0 %	0 %	387827999
15	NC_017401	ATCTT	2	10	12339	12348	20 %	60 %	0 %	20 %	387827999
16	NC_017401	TACAA	2	10	13123	13132	60 %	20 %	0 %	20 %	387827999
17	NC_017401	ATTTA	2	10	13554	13563	40 %	60 %	0 %	0 %	387827999
18	NC_017401	TATGT	2	10	13875	13884	20 %	60 %	20 %	0 %	387828000
19	NC_017401	TCTTT	2	10	14841	14850	0 %	80 %	0 %	20 %	387828000
20	NC_017401	ATTTT	2	10	19339	19348	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017401	TCTTT	2	10	19499	19508	0 %	80 %	0 %	20 %	387828004
22	NC_017401	TAAAT	2	10	20136	20145	60 %	40 %	0 %	0 %	387828004
23	NC_017401	TAGTA	2	10	20583	20592	40 %	40 %	20 %	0 %	387828004
24	NC_017401	TAACA	2	10	21651	21660	60 %	20 %	0 %	20 %	387828006
25	NC_017401	TTATA	2	10	21859	21868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017401	ATAAA	2	10	22418	22427	80 %	20 %	0 %	0 %	387828007
27	NC_017401	AAGAT	2	10	22789	22798	60 %	20 %	20 %	0 %	387828008
28	NC_017401	TTTTA	2	10	22999	23008	20 %	80 %	0 %	0 %	387828008
29	NC_017401	TAAAG	2	10	23185	23194	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017401	ATAAA	2	10	23502	23511	80 %	20 %	0 %	0 %	387828009
31	NC_017401	ATTTA	2	10	24571	24580	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017401	GAAGA	2	10	26164	26173	60 %	0 %	40 %	0 %	387828010
33	NC_017401	ATATA	2	10	26464	26473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.