MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp26

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017401	CTTT	2	8	182	189	0 %	75 %	0 %	25 %	387827985
2	NC_017401	AAAT	2	8	621	628	75 %	25 %	0 %	0 %	387827986
3	NC_017401	AGAC	2	8	1310	1317	50 %	0 %	25 %	25 %	387827987
4	NC_017401	AATT	2	8	1445	1452	50 %	50 %	0 %	0 %	387827987
5	NC_017401	AATT	2	8	1685	1692	50 %	50 %	0 %	0 %	387827987
6	NC_017401	ACAA	2	8	1777	1784	75 %	0 %	0 %	25 %	387827987
7	NC_017401	TTTC	2	8	2075	2082	0 %	75 %	0 %	25 %	387827987
8	NC_017401	TAAA	2	8	2376	2383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017401	CCTA	2	8	2804	2811	25 %	25 %	0 %	50 %	387827988
10	NC_017401	TAAT	2	8	3833	3840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017401	TAAT	2	8	3899	3906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017401	TAAT	2	8	3935	3942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017401	TAAA	2	8	4057	4064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017401	ATCA	2	8	4284	4291	50 %	25 %	0 %	25 %	387827989
15	NC_017401	AATG	2	8	4692	4699	50 %	25 %	25 %	0 %	387827990
16	NC_017401	CAAT	2	8	4721	4728	50 %	25 %	0 %	25 %	387827990
17	NC_017401	AAGG	2	8	4754	4761	50 %	0 %	50 %	0 %	387827990
18	NC_017401	GAAA	2	8	4769	4776	75 %	0 %	25 %	0 %	387827991
19	NC_017401	ATAA	2	8	5148	5155	75 %	25 %	0 %	0 %	387827991
20	NC_017401	GAAA	2	8	5345	5352	75 %	0 %	25 %	0 %	387827991
21	NC_017401	ATAA	2	8	5857	5864	75 %	25 %	0 %	0 %	387827991
22	NC_017401	ATCC	2	8	6725	6732	25 %	25 %	0 %	50 %	387827993
23	NC_017401	ACTA	2	8	7019	7026	50 %	25 %	0 %	25 %	387827993
24	NC_017401	ATTA	2	8	8061	8068	50 %	50 %	0 %	0 %	387827994
25	NC_017401	TACT	2	8	8109	8116	25 %	50 %	0 %	25 %	387827994
26	NC_017401	AATA	2	8	8121	8128	75 %	25 %	0 %	0 %	387827994
27	NC_017401	ATAC	2	8	8674	8681	50 %	25 %	0 %	25 %	387827994
28	NC_017401	ATAA	2	8	8869	8876	75 %	25 %	0 %	0 %	387827995
29	NC_017401	ATTT	2	8	8957	8964	25 %	75 %	0 %	0 %	387827995
30	NC_017401	AGAA	2	8	9195	9202	75 %	0 %	25 %	0 %	387827995
31	NC_017401	CAAG	2	8	9408	9415	50 %	0 %	25 %	25 %	387827996
32	NC_017401	GAAA	2	8	9599	9606	75 %	0 %	25 %	0 %	387827996
33	NC_017401	TAAA	2	8	10109	10116	75 %	25 %	0 %	0 %	387827997
34	NC_017401	GAAA	2	8	10194	10201	75 %	0 %	25 %	0 %	387827997
35	NC_017401	AATT	2	8	10406	10413	50 %	50 %	0 %	0 %	387827997
36	NC_017401	AAAT	2	8	10617	10624	75 %	25 %	0 %	0 %	387827997
37	NC_017401	ATTT	2	8	10877	10884	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017401	AAAT	2	8	10893	10900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017401	TTTA	2	8	11285	11292	25 %	75 %	0 %	0 %	387827998
40	NC_017401	AATT	2	8	11501	11508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017401	TTTA	2	8	11554	11561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017401	ATTT	2	8	11710	11717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017401	TAAA	2	8	11740	11747	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017401	ATAA	2	8	11764	11771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017401	CAAT	2	8	11817	11824	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017401	TATT	2	8	13766	13773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017401	GTTA	2	8	13840	13847	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017401	ATTT	2	8	13946	13953	25 %	75 %	0 %	0 %	387828000
49	NC_017401	ATTA	2	8	15185	15192	50 %	50 %	0 %	0 %	387828001
50	NC_017401	TTCA	2	8	15557	15564	25 %	50 %	0 %	25 %	387828001
51	NC_017401	AATT	2	8	16063	16070	50 %	50 %	0 %	0 %	387828001
52	NC_017401	TGGA	2	8	16139	16146	25 %	25 %	50 %	0 %	387828001
53	NC_017401	TTTG	2	8	16274	16281	0 %	75 %	25 %	0 %	387828001
54	NC_017401	ATAA	2	8	16860	16867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017401	TTAA	2	8	17511	17518	50 %	50 %	0 %	0 %	387828002
56	NC_017401	AAGA	2	8	17583	17590	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017401	AATA	2	8	17968	17975	75 %	25 %	0 %	0 %	387828003
58	NC_017401	TAAA	2	8	17976	17983	75 %	25 %	0 %	0 %	387828003
59	NC_017401	AATT	2	8	18178	18185	50 %	50 %	0 %	0 %	387828003
60	NC_017401	AATA	2	8	18257	18264	75 %	25 %	0 %	0 %	387828003
61	NC_017401	AAAT	2	8	18512	18519	75 %	25 %	0 %	0 %	387828003
62	NC_017401	TAAA	2	8	18787	18794	75 %	25 %	0 %	0 %	387828003
63	NC_017401	CCAA	2	8	18822	18829	50 %	0 %	0 %	50 %	387828003
64	NC_017401	ATTC	2	8	19028	19035	25 %	50 %	0 %	25 %	387828003
65	NC_017401	GATT	2	8	19311	19318	25 %	50 %	25 %	0 %	387828003
66	NC_017401	ATAA	2	8	19440	19447	75 %	25 %	0 %	0 %	387828004
67	NC_017401	AAAT	2	8	19977	19984	75 %	25 %	0 %	0 %	387828004
68	NC_017401	TAAA	2	8	20252	20259	75 %	25 %	0 %	0 %	387828004
69	NC_017401	CCAA	2	8	20287	20294	50 %	0 %	0 %	50 %	387828004
70	NC_017401	AATT	2	8	21191	21198	50 %	50 %	0 %	0 %	387828005
71	NC_017401	TAAA	2	8	21461	21468	75 %	25 %	0 %	0 %	387828006
72	NC_017401	ACTA	2	8	21561	21568	50 %	25 %	0 %	25 %	387828006
73	NC_017401	AATT	2	8	21609	21616	50 %	50 %	0 %	0 %	387828006
74	NC_017401	ATGA	2	8	21898	21905	50 %	25 %	25 %	0 %	387828007
75	NC_017401	TAAA	2	8	22082	22089	75 %	25 %	0 %	0 %	387828007
76	NC_017401	TCTA	2	8	22191	22198	25 %	50 %	0 %	25 %	387828007
77	NC_017401	ATTT	2	8	22375	22382	25 %	75 %	0 %	0 %	387828007
78	NC_017401	TAAT	2	8	22394	22401	50 %	50 %	0 %	0 %	387828007
79	NC_017401	TAAA	2	8	22871	22878	75 %	25 %	0 %	0 %	387828008
80	NC_017401	ATTT	2	8	23062	23069	25 %	75 %	0 %	0 %	387828008
81	NC_017401	TAAA	2	8	23195	23202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017401	CAAA	2	8	23657	23664	75 %	0 %	0 %	25 %	387828009
83	NC_017401	ATTT	2	8	24559	24566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017401	ATTA	2	8	24776	24783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017401	TAAT	3	12	24787	24798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017401	TCTT	2	8	25348	25355	0 %	75 %	0 %	25 %	387828010
87	NC_017401	ATTT	2	8	25469	25476	25 %	75 %	0 %	0 %	387828010
88	NC_017401	AAAT	2	8	25642	25649	75 %	25 %	0 %	0 %	387828010
89	NC_017401	TACA	2	8	26270	26277	50 %	25 %	0 %	25 %	387828010

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.