MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp26

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017401	AC	3	6	409	414	50 %	0 %	0 %	50 %	387827986
2	NC_017401	TA	3	6	758	763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017401	AT	3	6	801	806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017401	TA	3	6	882	887	50 %	50 %	0 %	0 %	387827987
5	NC_017401	AT	3	6	1028	1033	50 %	50 %	0 %	0 %	387827987
6	NC_017401	AT	3	6	1960	1965	50 %	50 %	0 %	0 %	387827987
7	NC_017401	TA	3	6	2256	2261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017401	TA	3	6	2273	2278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017401	CT	3	6	2421	2426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017401	TC	3	6	3871	3876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017401	AT	3	6	3969	3974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017401	AT	3	6	3999	4004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017401	AT	3	6	4027	4032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017401	TA	3	6	4095	4100	50 %	50 %	0 %	0 %	387827989
15	NC_017401	CA	3	6	4266	4271	50 %	0 %	0 %	50 %	387827989
16	NC_017401	AT	3	6	5805	5810	50 %	50 %	0 %	0 %	387827991
17	NC_017401	CT	3	6	5943	5948	0 %	50 %	0 %	50 %	387827992
18	NC_017401	AT	3	6	5979	5984	50 %	50 %	0 %	0 %	387827992
19	NC_017401	AT	3	6	6533	6538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017401	AT	3	6	6543	6548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017401	TA	3	6	6648	6653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017401	CA	3	6	7111	7116	50 %	0 %	0 %	50 %	387827993
23	NC_017401	AT	3	6	7148	7153	50 %	50 %	0 %	0 %	387827993
24	NC_017401	AT	3	6	7629	7634	50 %	50 %	0 %	0 %	387827993
25	NC_017401	CT	3	6	7950	7955	0 %	50 %	0 %	50 %	387827994
26	NC_017401	CA	3	6	8848	8853	50 %	0 %	0 %	50 %	387827995
27	NC_017401	AT	3	6	8924	8929	50 %	50 %	0 %	0 %	387827995
28	NC_017401	AT	3	6	9436	9441	50 %	50 %	0 %	0 %	387827996
29	NC_017401	AT	4	8	9475	9482	50 %	50 %	0 %	0 %	387827996
30	NC_017401	AT	3	6	10359	10364	50 %	50 %	0 %	0 %	387827997
31	NC_017401	AT	3	6	10426	10431	50 %	50 %	0 %	0 %	387827997
32	NC_017401	TA	3	6	10722	10727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017401	TA	3	6	10734	10739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017401	AT	3	6	11938	11943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017401	AG	3	6	12954	12959	50 %	0 %	50 %	0 %	387827999
36	NC_017401	AT	3	6	13227	13232	50 %	50 %	0 %	0 %	387827999
37	NC_017401	GA	4	8	13399	13406	50 %	0 %	50 %	0 %	387827999
38	NC_017401	AT	3	6	15825	15830	50 %	50 %	0 %	0 %	387828001
39	NC_017401	AT	3	6	16786	16791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017401	GA	3	6	18022	18027	50 %	0 %	50 %	0 %	387828003
41	NC_017401	AT	3	6	18218	18223	50 %	50 %	0 %	0 %	387828003
42	NC_017401	AT	3	6	18686	18691	50 %	50 %	0 %	0 %	387828003
43	NC_017401	AT	3	6	19400	19405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017401	CA	3	6	19664	19669	50 %	0 %	0 %	50 %	387828004
45	NC_017401	AT	3	6	19683	19688	50 %	50 %	0 %	0 %	387828004
46	NC_017401	GC	3	6	20627	20632	0 %	0 %	50 %	50 %	387828004
47	NC_017401	AT	3	6	20680	20685	50 %	50 %	0 %	0 %	387828004
48	NC_017401	AT	3	6	21201	21206	50 %	50 %	0 %	0 %	387828005
49	NC_017401	AT	3	6	21592	21597	50 %	50 %	0 %	0 %	387828006
50	NC_017401	TA	3	6	21952	21957	50 %	50 %	0 %	0 %	387828007
51	NC_017401	AT	3	6	22071	22076	50 %	50 %	0 %	0 %	387828007
52	NC_017401	TA	4	8	22097	22104	50 %	50 %	0 %	0 %	387828007
53	NC_017401	TA	3	6	22624	22629	50 %	50 %	0 %	0 %	387828008
54	NC_017401	TA	3	6	22854	22859	50 %	50 %	0 %	0 %	387828008
55	NC_017401	TA	3	6	23589	23594	50 %	50 %	0 %	0 %	387828009
56	NC_017401	TA	3	6	25182	25187	50 %	50 %	0 %	0 %	387828010
57	NC_017401	TC	3	6	25297	25302	0 %	50 %	0 %	50 %	387828010
58	NC_017401	AT	3	6	25675	25680	50 %	50 %	0 %	0 %	387828010
59	NC_017401	TA	3	6	25937	25942	50 %	50 %	0 %	0 %	387828010
60	NC_017401	AC	3	6	25974	25979	50 %	0 %	0 %	50 %	387828010

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.