MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-4

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017400	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	387827966
2	NC_017400	AGTAA	2	10	1433	1442	60 %	20 %	20 %	0 %	387827968
3	NC_017400	TCACT	2	10	1590	1599	20 %	40 %	0 %	40 %	387827968
4	NC_017400	TTGTT	2	10	1687	1696	0 %	80 %	20 %	0 %	387827969
5	NC_017400	TATGT	2	10	1797	1806	20 %	60 %	20 %	0 %	387827969
6	NC_017400	TGTAG	2	10	4751	4760	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017400	TTTTA	2	10	6113	6122	20 %	80 %	0 %	0 %	387827974
8	NC_017400	ATTGA	2	10	6758	6767	40 %	40 %	20 %	0 %	387827975
9	NC_017400	TCTAT	2	10	8427	8436	20 %	60 %	0 %	20 %	387827977
10	NC_017400	TTTTA	2	10	8554	8563	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017400	TAAGC	2	10	8635	8644	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017400	GAGTT	2	10	9881	9890	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017400	ATAAA	2	10	10327	10336	80 %	20 %	0 %	0 %	387827978
14	NC_017400	ACTTG	2	10	10676	10685	20 %	40 %	20 %	20 %	387827978
15	NC_017400	ATTTT	2	10	11427	11436	20 %	80 %	0 %	0 %	387827979
16	NC_017400	AATTT	2	10	11757	11766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017400	AGAAA	2	10	13080	13089	80 %	0 %	20 %	0 %	387827981
18	NC_017400	ACAAA	2	10	13139	13148	80 %	0 %	0 %	20 %	387827981
19	NC_017400	TTAGA	2	10	14211	14220	40 %	40 %	20 %	0 %	387827982

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.