MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-4

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017400	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	387827966
2	NC_017400	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	387827966
3	NC_017400	AGGA	2	8	1295	1302	50 %	0 %	50 %	0 %	387827967
4	NC_017400	CTAT	2	8	1307	1314	25 %	50 %	0 %	25 %	387827967
5	NC_017400	TAAC	2	8	1377	1384	50 %	25 %	0 %	25 %	387827968
6	NC_017400	AGAT	2	8	2340	2347	50 %	25 %	25 %	0 %	387827970
7	NC_017400	AGAT	2	8	2460	2467	50 %	25 %	25 %	0 %	387827970
8	NC_017400	AAAT	2	8	3139	3146	75 %	25 %	0 %	0 %	387827971
9	NC_017400	TCTT	2	8	3621	3628	0 %	75 %	0 %	25 %	387827972
10	NC_017400	CTTG	2	8	4025	4032	0 %	50 %	25 %	25 %	387827972
11	NC_017400	TTTG	2	8	4521	4528	0 %	75 %	25 %	0 %	387827972
12	NC_017400	AACA	2	8	4971	4978	75 %	0 %	0 %	25 %	387827973
13	NC_017400	AAGA	3	12	5383	5394	75 %	0 %	25 %	0 %	387827973
14	NC_017400	AAAT	2	8	5537	5544	75 %	25 %	0 %	0 %	387827973
15	NC_017400	TAAA	2	8	5563	5570	75 %	25 %	0 %	0 %	387827973
16	NC_017400	AGAA	2	8	5623	5630	75 %	0 %	25 %	0 %	387827973
17	NC_017400	CAAA	2	8	5633	5640	75 %	0 %	0 %	25 %	387827973
18	NC_017400	GAAA	2	8	5778	5785	75 %	0 %	25 %	0 %	387827973
19	NC_017400	AAAC	2	8	5821	5828	75 %	0 %	0 %	25 %	387827973
20	NC_017400	AAAT	2	8	6352	6359	75 %	25 %	0 %	0 %	387827974
21	NC_017400	TTTA	2	8	6497	6504	25 %	75 %	0 %	0 %	387827974
22	NC_017400	TCAA	2	8	6617	6624	50 %	25 %	0 %	25 %	387827975
23	NC_017400	AATA	2	8	6829	6836	75 %	25 %	0 %	0 %	387827975
24	NC_017400	AATG	2	8	7081	7088	50 %	25 %	25 %	0 %	387827975
25	NC_017400	AGAA	2	8	7112	7119	75 %	0 %	25 %	0 %	387827975
26	NC_017400	TGAT	2	8	7574	7581	25 %	50 %	25 %	0 %	387827976
27	NC_017400	TAAT	2	8	8106	8113	50 %	50 %	0 %	0 %	387827977
28	NC_017400	ATAG	2	8	8159	8166	50 %	25 %	25 %	0 %	387827977
29	NC_017400	ATAG	2	8	8180	8187	50 %	25 %	25 %	0 %	387827977
30	NC_017400	ATAG	2	8	8234	8241	50 %	25 %	25 %	0 %	387827977
31	NC_017400	ATAG	2	8	8267	8274	50 %	25 %	25 %	0 %	387827977
32	NC_017400	AGAT	2	8	8286	8293	50 %	25 %	25 %	0 %	387827977
33	NC_017400	GCAA	2	8	8369	8376	50 %	0 %	25 %	25 %	387827977
34	NC_017400	AAAT	3	12	10897	10908	75 %	25 %	0 %	0 %	387827979
35	NC_017400	TAAA	2	8	10912	10919	75 %	25 %	0 %	0 %	387827979
36	NC_017400	AGGT	2	8	11034	11041	25 %	25 %	50 %	0 %	387827979
37	NC_017400	ACCA	2	8	11281	11288	50 %	0 %	0 %	50 %	387827979
38	NC_017400	GTTT	2	8	11301	11308	0 %	75 %	25 %	0 %	387827979
39	NC_017400	TAAA	2	8	11354	11361	75 %	25 %	0 %	0 %	387827979
40	NC_017400	AAGA	2	8	12306	12313	75 %	0 %	25 %	0 %	387827980
41	NC_017400	CAAA	2	8	12571	12578	75 %	0 %	0 %	25 %	387827980
42	NC_017400	GAAG	2	8	13104	13111	50 %	0 %	50 %	0 %	387827981
43	NC_017400	AAGA	2	8	13189	13196	75 %	0 %	25 %	0 %	387827981
44	NC_017400	AAAG	2	8	13286	13293	75 %	0 %	25 %	0 %	387827981
45	NC_017400	GTAT	2	8	14325	14332	25 %	50 %	25 %	0 %	387827982
46	NC_017400	TAAA	2	8	14370	14377	75 %	25 %	0 %	0 %	387827982
47	NC_017400	CAAG	2	8	14395	14402	50 %	0 %	25 %	25 %	387827982
48	NC_017400	AATT	2	8	14416	14423	50 %	50 %	0 %	0 %	387827982
49	NC_017400	CAAA	2	8	14575	14582	75 %	0 %	0 %	25 %	387827983
50	NC_017400	AAAT	2	8	14613	14620	75 %	25 %	0 %	0 %	387827983
51	NC_017400	AATT	2	8	14664	14671	50 %	50 %	0 %	0 %	387827983
52	NC_017400	TAGC	2	8	14771	14778	25 %	25 %	25 %	25 %	387827983
53	NC_017400	TGAT	2	8	14978	14985	25 %	50 %	25 %	0 %	387827983
54	NC_017400	AGCA	2	8	15339	15346	50 %	0 %	25 %	25 %	387827983
55	NC_017400	AAAT	2	8	15365	15372	75 %	25 %	0 %	0 %	387827983

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.