MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp9

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017399	TAG	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826897
2	NC_017399	ATA	2	6	604	609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826897
3	NC_017399	ATA	2	6	613	618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826897
4	NC_017399	AGA	2	6	623	628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826897
5	NC_017399	ATA	2	6	751	756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826897
6	NC_017399	ATA	2	6	783	788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826897
7	NC_017399	TAT	2	6	974	979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826897
8	NC_017399	CAA	2	6	1059	1064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826897
9	NC_017399	AAC	2	6	1108	1113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826897
10	NC_017399	ATT	2	6	1210	1215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826897
11	NC_017399	ATT	2	6	1220	1225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826897
12	NC_017399	CTG	2	6	1368	1373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826898
13	NC_017399	AGT	2	6	1433	1438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826898
14	NC_017399	ATT	2	6	1478	1483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826898
15	NC_017399	TGT	2	6	1674	1679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826898
16	NC_017399	ATT	2	6	1700	1705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826898
17	NC_017399	TAA	2	6	1733	1738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826898
18	NC_017399	TTG	2	6	1744	1749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826898
19	NC_017399	TAA	2	6	1790	1795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826898
20	NC_017399	GTT	2	6	1917	1922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826899
21	NC_017399	TTA	2	6	1991	1996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826899
22	NC_017399	AGA	2	6	2213	2218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826899
23	NC_017399	ATG	2	6	2385	2390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826899
24	NC_017399	GAA	2	6	2445	2450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826899
25	NC_017399	GTA	2	6	2620	2625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017399	TAC	2	6	2630	2635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017399	TAA	2	6	2715	2720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017399	AAT	2	6	2825	2830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826900
29	NC_017399	CAA	2	6	3041	3046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826900
30	NC_017399	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826900
31	NC_017399	AAT	2	6	3140	3145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826900
32	NC_017399	TGT	2	6	3163	3168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826900
33	NC_017399	TCA	2	6	3194	3199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826900
34	NC_017399	TAG	2	6	3225	3230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826900
35	NC_017399	TAT	2	6	3377	3382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826900
36	NC_017399	ATG	2	6	3432	3437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826900
37	NC_017399	TAA	2	6	3583	3588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826900
38	NC_017399	TAA	2	6	3713	3718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826900
39	NC_017399	ATT	2	6	3758	3763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017399	ATT	2	6	3827	3832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017399	AAT	2	6	4006	4011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826901
42	NC_017399	AGC	2	6	4134	4139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826901
43	NC_017399	TAA	2	6	4355	4360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826901
44	NC_017399	TAT	2	6	4404	4409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017399	TAA	2	6	4427	4432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017399	TTG	2	6	4485	4490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017399	ATA	2	6	4538	4543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826902
48	NC_017399	TAA	3	9	4551	4559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826902
49	NC_017399	TTA	2	6	4575	4580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826902
50	NC_017399	CAA	2	6	4710	4715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826902
51	NC_017399	TTC	2	6	4756	4761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826902
52	NC_017399	TTA	2	6	4787	4792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826902
53	NC_017399	ATT	2	6	4856	4861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017399	ATA	2	6	4904	4909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017399	TAA	2	6	5138	5143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017399	TTC	2	6	5162	5167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017399	TAA	2	6	5197	5202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017399	TAG	2	6	5222	5227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017399	ACT	2	6	5341	5346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017399	AAC	2	6	5418	5423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017399	ACT	3	9	5517	5525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017399	TAT	2	6	5564	5569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017399	AGG	2	6	5597	5602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017399	ATG	2	6	5627	5632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826903
65	NC_017399	TTA	2	6	5724	5729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826903
66	NC_017399	ATT	3	9	5820	5828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826903
67	NC_017399	TTA	2	6	5857	5862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826903
68	NC_017399	CTA	3	9	5882	5890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826903
69	NC_017399	ATT	2	6	5930	5935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017399	TAT	2	6	5942	5947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017399	CTC	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017399	TGT	2	6	6157	6162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017399	ATT	2	6	6216	6221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017399	ATT	2	6	6232	6237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017399	TAC	2	6	6363	6368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826904
76	NC_017399	ATA	2	6	6371	6376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826904
77	NC_017399	TAA	2	6	6564	6569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826904
78	NC_017399	ACA	2	6	6651	6656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826904
79	NC_017399	TAC	2	6	6685	6690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826904
80	NC_017399	TTC	2	6	6988	6993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826904
81	NC_017399	ATA	2	6	7008	7013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826904
82	NC_017399	ATT	2	6	7348	7353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826905
83	NC_017399	TCA	2	6	7508	7513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826905
84	NC_017399	CAA	2	6	7617	7622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826905
85	NC_017399	TAT	3	9	7635	7643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826905
86	NC_017399	TAA	2	6	7660	7665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826905
87	NC_017399	TTA	2	6	7724	7729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826905
88	NC_017399	ATT	2	6	7759	7764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826905
89	NC_017399	TTA	2	6	7790	7795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826905
90	NC_017399	ATA	2	6	7861	7866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826905
91	NC_017399	TAC	2	6	7881	7886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826905
92	NC_017399	ACT	2	6	7924	7929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826905
93	NC_017399	ATT	3	9	7978	7986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826905
94	NC_017399	TTG	2	6	8004	8009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826905
95	NC_017399	TAA	2	6	8118	8123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826905
96	NC_017399	TCA	2	6	8220	8225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826905
97	NC_017399	ACC	2	6	8245	8250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826905
98	NC_017399	ATT	2	6	8488	8493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826905
99	NC_017399	AAT	2	6	8684	8689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017399	ATT	2	6	8695	8700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.