MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-5

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017398	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387826860
2	NC_017398	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	387826860
3	NC_017398	GT	3	6	2539	2544	0 %	50 %	50 %	0 %	387826862
4	NC_017398	TA	4	8	2969	2976	50 %	50 %	0 %	0 %	387826863
5	NC_017398	TC	3	6	4539	4544	0 %	50 %	0 %	50 %	387826865
6	NC_017398	TG	3	6	5402	5407	0 %	50 %	50 %	0 %	387826866
7	NC_017398	AT	3	6	5447	5452	50 %	50 %	0 %	0 %	387826867
8	NC_017398	AG	3	6	5543	5548	50 %	0 %	50 %	0 %	387826867
9	NC_017398	AT	3	6	5936	5941	50 %	50 %	0 %	0 %	387826868
10	NC_017398	TA	3	6	5952	5957	50 %	50 %	0 %	0 %	387826868
11	NC_017398	AT	4	8	6428	6435	50 %	50 %	0 %	0 %	387826869
12	NC_017398	TG	3	6	6954	6959	0 %	50 %	50 %	0 %	387826870
13	NC_017398	AT	3	6	7487	7492	50 %	50 %	0 %	0 %	387826870
14	NC_017398	TA	4	8	7888	7895	50 %	50 %	0 %	0 %	387826871
15	NC_017398	TA	3	6	8011	8016	50 %	50 %	0 %	0 %	387826871
16	NC_017398	AT	3	6	8190	8195	50 %	50 %	0 %	0 %	387826871
17	NC_017398	AT	3	6	8881	8886	50 %	50 %	0 %	0 %	387826872
18	NC_017398	CT	3	6	9157	9162	0 %	50 %	0 %	50 %	387826872
19	NC_017398	CT	3	6	9525	9530	0 %	50 %	0 %	50 %	387826872
20	NC_017398	AT	3	6	12807	12812	50 %	50 %	0 %	0 %	387826876
21	NC_017398	AT	4	8	13199	13206	50 %	50 %	0 %	0 %	387826877
22	NC_017398	AT	3	6	13886	13891	50 %	50 %	0 %	0 %	387826878
23	NC_017398	AT	3	6	15102	15107	50 %	50 %	0 %	0 %	387826879
24	NC_017398	AT	3	6	15517	15522	50 %	50 %	0 %	0 %	387826881
25	NC_017398	AT	3	6	15927	15932	50 %	50 %	0 %	0 %	387826882
26	NC_017398	AT	3	6	16095	16100	50 %	50 %	0 %	0 %	387826882
27	NC_017398	AT	3	6	16400	16405	50 %	50 %	0 %	0 %	387826883
28	NC_017398	AT	3	6	16627	16632	50 %	50 %	0 %	0 %	387826884
29	NC_017398	AT	3	6	16838	16843	50 %	50 %	0 %	0 %	387826884
30	NC_017398	AT	3	6	16958	16963	50 %	50 %	0 %	0 %	387826884
31	NC_017398	TA	3	6	20091	20096	50 %	50 %	0 %	0 %	387826886
32	NC_017398	TA	3	6	20678	20683	50 %	50 %	0 %	0 %	387826887
33	NC_017398	AT	4	8	20926	20933	50 %	50 %	0 %	0 %	387826888
34	NC_017398	TA	3	6	21105	21110	50 %	50 %	0 %	0 %	387826888
35	NC_017398	TG	4	8	21422	21429	0 %	50 %	50 %	0 %	387826888
36	NC_017398	TA	3	6	21556	21561	50 %	50 %	0 %	0 %	387826889
37	NC_017398	AT	3	6	22364	22369	50 %	50 %	0 %	0 %	387826890
38	NC_017398	AT	3	6	22526	22531	50 %	50 %	0 %	0 %	387826890
39	NC_017398	TA	3	6	23475	23480	50 %	50 %	0 %	0 %	387826891
40	NC_017398	AG	3	6	23516	23521	50 %	0 %	50 %	0 %	387826891
41	NC_017398	TA	3	6	23556	23561	50 %	50 %	0 %	0 %	387826891
42	NC_017398	AG	3	6	23972	23977	50 %	0 %	50 %	0 %	387826891
43	NC_017398	AT	3	6	24664	24669	50 %	50 %	0 %	0 %	387826892
44	NC_017398	AG	3	6	24985	24990	50 %	0 %	50 %	0 %	387826893
45	NC_017398	TA	3	6	27391	27396	50 %	50 %	0 %	0 %	387826895

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.