MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-9

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017397	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825623
2	NC_017397	CTGATA	2	12	2987	2998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825626
3	NC_017397	ACAAGC	2	12	4965	4976	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387825629
4	NC_017397	GAATTT	2	12	5206	5217	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387825629
5	NC_017397	TGAACT	2	12	5244	5255	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825629
6	NC_017397	AATGGA	2	12	6893	6904	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387825633
7	NC_017397	AAATCT	2	12	7672	7683	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387825633
8	NC_017397	AAATAA	2	12	10255	10266	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387825637
9	NC_017397	TTGATA	2	12	14946	14957	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387825644
10	NC_017397	AGTTAA	2	12	16276	16287	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387825648
11	NC_017397	AATTTA	2	12	16855	16866	50 %	50 %	0 %	0 %	387825649
12	NC_017397	TAATGA	2	12	17190	17201	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387825650
13	NC_017397	TTTTCG	2	12	18131	18142	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017397	ATATGT	2	12	22853	22864	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017397	AAGTAA	2	12	25662	25673	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017397	GAAAAT	2	12	26066	26077	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825657

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.