MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-9

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017397	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	387825623
2	NC_017397	ATTAA	2	10	1783	1792	60 %	40 %	0 %	0 %	387825624
3	NC_017397	TAAAT	2	10	2418	2427	60 %	40 %	0 %	0 %	387825625
4	NC_017397	GCAAA	2	10	3870	3879	60 %	0 %	20 %	20 %	387825627
5	NC_017397	TACAA	2	10	4216	4225	60 %	20 %	0 %	20 %	387825628
6	NC_017397	GAAAA	2	10	10355	10364	80 %	0 %	20 %	0 %	387825638
7	NC_017397	TTAAA	2	10	11868	11877	60 %	40 %	0 %	0 %	387825639
8	NC_017397	AACTT	2	10	12737	12746	40 %	40 %	0 %	20 %	387825641
9	NC_017397	GAAAA	2	10	13373	13382	80 %	0 %	20 %	0 %	387825642
10	NC_017397	AAAGT	2	10	13395	13404	60 %	20 %	20 %	0 %	387825642
11	NC_017397	ATTCA	2	10	14203	14212	40 %	40 %	0 %	20 %	387825643
12	NC_017397	AGACA	2	10	14503	14512	60 %	0 %	20 %	20 %	387825644
13	NC_017397	ATTAA	2	10	15237	15246	60 %	40 %	0 %	0 %	387825645
14	NC_017397	AGTAA	2	10	15874	15883	60 %	20 %	20 %	0 %	387825647
15	NC_017397	TCACT	2	10	16031	16040	20 %	40 %	0 %	40 %	387825647
16	NC_017397	TTGCT	2	10	16128	16137	0 %	60 %	20 %	20 %	387825648
17	NC_017397	TATGT	2	10	16238	16247	20 %	60 %	20 %	0 %	387825648
18	NC_017397	CACTA	2	10	19180	19189	40 %	20 %	0 %	40 %	387825651
19	NC_017397	TTAAA	2	10	20819	20828	60 %	40 %	0 %	0 %	387825653
20	NC_017397	ATAAA	2	10	24430	24439	80 %	20 %	0 %	0 %	387825655
21	NC_017397	ACTTG	2	10	24779	24788	20 %	40 %	20 %	20 %	387825655
22	NC_017397	AAGAA	2	10	26369	26378	80 %	0 %	20 %	0 %	387825657
23	NC_017397	ATTAT	2	10	28254	28263	40 %	60 %	0 %	0 %	387825659
24	NC_017397	TTACA	2	10	30529	30538	40 %	40 %	0 %	20 %	387825661

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.