MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-9

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017397	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	387825623
2	NC_017397	ATTA	2	8	947	954	50 %	50 %	0 %	0 %	387825623
3	NC_017397	GTTC	2	8	1680	1687	0 %	50 %	25 %	25 %	387825624
4	NC_017397	ATAC	2	8	1931	1938	50 %	25 %	0 %	25 %	387825624
5	NC_017397	AAGA	2	8	2383	2390	75 %	0 %	25 %	0 %	387825625
6	NC_017397	ATTT	2	8	2519	2526	25 %	75 %	0 %	0 %	387825625
7	NC_017397	TGCT	2	8	2531	2538	0 %	50 %	25 %	25 %	387825625
8	NC_017397	GCAA	2	8	2679	2686	50 %	0 %	25 %	25 %	387825626
9	NC_017397	ATGT	2	8	3017	3024	25 %	50 %	25 %	0 %	387825626
10	NC_017397	GTAT	2	8	3042	3049	25 %	50 %	25 %	0 %	387825626
11	NC_017397	ATAA	2	8	3124	3131	75 %	25 %	0 %	0 %	387825626
12	NC_017397	CAAT	2	8	3206	3213	50 %	25 %	0 %	25 %	387825626
13	NC_017397	TAAA	2	8	3365	3372	75 %	25 %	0 %	0 %	387825627
14	NC_017397	TTTA	2	8	3892	3899	25 %	75 %	0 %	0 %	387825627
15	NC_017397	CTAC	2	8	4797	4804	25 %	25 %	0 %	50 %	387825628
16	NC_017397	TCAT	2	8	4844	4851	25 %	50 %	0 %	25 %	387825628
17	NC_017397	TTAC	2	8	5152	5159	25 %	50 %	0 %	25 %	387825629
18	NC_017397	AATG	2	8	5399	5406	50 %	25 %	25 %	0 %	387825629
19	NC_017397	AAGT	2	8	6064	6071	50 %	25 %	25 %	0 %	387825631
20	NC_017397	GAAA	2	8	6919	6926	75 %	0 %	25 %	0 %	387825633
21	NC_017397	AGAA	2	8	7219	7226	75 %	0 %	25 %	0 %	387825633
22	NC_017397	TAGA	2	8	7644	7651	50 %	25 %	25 %	0 %	387825633
23	NC_017397	AGGG	2	8	8258	8265	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017397	ATTT	2	8	8494	8501	25 %	75 %	0 %	0 %	387825635
25	NC_017397	CTTG	2	8	8796	8803	0 %	50 %	25 %	25 %	387825636
26	NC_017397	AATT	2	8	8942	8949	50 %	50 %	0 %	0 %	387825636
27	NC_017397	TATG	2	8	9454	9461	25 %	50 %	25 %	0 %	387825637
28	NC_017397	AAAT	2	8	9484	9491	75 %	25 %	0 %	0 %	387825637
29	NC_017397	AGGG	2	8	9672	9679	25 %	0 %	75 %	0 %	387825637
30	NC_017397	AGGG	2	8	9879	9886	25 %	0 %	75 %	0 %	387825637
31	NC_017397	TAGT	2	8	10200	10207	25 %	50 %	25 %	0 %	387825637
32	NC_017397	AGAA	2	8	10395	10402	75 %	0 %	25 %	0 %	387825638
33	NC_017397	CTTT	2	8	10706	10713	0 %	75 %	0 %	25 %	387825638
34	NC_017397	TAAT	2	8	10955	10962	50 %	50 %	0 %	0 %	387825638
35	NC_017397	ATTC	2	8	11668	11675	25 %	50 %	0 %	25 %	387825639
36	NC_017397	TCAA	2	8	12175	12182	50 %	25 %	0 %	25 %	387825640
37	NC_017397	AATT	2	8	12448	12455	50 %	50 %	0 %	0 %	387825640
38	NC_017397	TAAT	2	8	13009	13016	50 %	50 %	0 %	0 %	387825642
39	NC_017397	AAAC	2	8	14091	14098	75 %	0 %	0 %	25 %	387825643
40	NC_017397	TAAT	2	8	14628	14635	50 %	50 %	0 %	0 %	387825644
41	NC_017397	TCTA	2	8	14710	14717	25 %	50 %	0 %	25 %	387825644
42	NC_017397	AATA	2	8	15629	15636	75 %	25 %	0 %	0 %	387825646
43	NC_017397	TCAA	2	8	15664	15671	50 %	25 %	0 %	25 %	387825646
44	NC_017397	CTAT	2	8	15748	15755	25 %	50 %	0 %	25 %	387825646
45	NC_017397	AATA	2	8	15764	15771	75 %	25 %	0 %	0 %	387825646
46	NC_017397	TAAC	2	8	15818	15825	50 %	25 %	0 %	25 %	387825647
47	NC_017397	ATAG	2	8	16750	16757	50 %	25 %	25 %	0 %	387825649
48	NC_017397	ATAG	2	8	16816	16823	50 %	25 %	25 %	0 %	387825649
49	NC_017397	AGAT	2	8	16835	16842	50 %	25 %	25 %	0 %	387825649
50	NC_017397	ATAG	2	8	16870	16877	50 %	25 %	25 %	0 %	387825649
51	NC_017397	CTTG	2	8	18111	18118	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017397	AAGA	3	12	19461	19472	75 %	0 %	25 %	0 %	387825651
53	NC_017397	AATA	2	8	19588	19595	75 %	25 %	0 %	0 %	387825651
54	NC_017397	GAAA	2	8	19654	19661	75 %	0 %	25 %	0 %	387825651
55	NC_017397	AAAT	2	8	19740	19747	75 %	25 %	0 %	0 %	387825651
56	NC_017397	TTGA	2	8	20195	20202	25 %	50 %	25 %	0 %	387825652
57	NC_017397	AAAT	2	8	20427	20434	75 %	25 %	0 %	0 %	387825652
58	NC_017397	TTTA	2	8	20572	20579	25 %	75 %	0 %	0 %	387825652
59	NC_017397	TCAA	2	8	20692	20699	50 %	25 %	0 %	25 %	387825653
60	NC_017397	AAAG	2	8	20752	20759	75 %	0 %	25 %	0 %	387825653
61	NC_017397	AATT	2	8	21114	21121	50 %	50 %	0 %	0 %	387825653
62	NC_017397	AATA	2	8	21165	21172	75 %	25 %	0 %	0 %	387825653
63	NC_017397	AGAT	2	8	22213	22220	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017397	ATAG	2	8	22281	22288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017397	ATAG	2	8	22314	22321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017397	AGAT	2	8	22333	22340	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017397	ATAG	2	8	22386	22393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017397	AAAT	2	8	22438	22445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017397	ATTA	2	8	22801	22808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017397	TATT	2	8	23014	23021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017397	TAAG	2	8	23182	23189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017397	AAAT	2	8	23483	23490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017397	AATC	2	8	24054	24061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017397	AGAT	2	8	24278	24285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017397	TAAA	2	8	25015	25022	75 %	25 %	0 %	0 %	387825656
76	NC_017397	ACCA	2	8	25384	25391	50 %	0 %	0 %	50 %	387825656
77	NC_017397	AAGA	2	8	25816	25823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017397	TTGT	2	8	26083	26090	0 %	75 %	25 %	0 %	387825657
79	NC_017397	TTCA	2	8	28006	28013	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017397	TTTA	2	8	28046	28053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017397	AATA	2	8	28660	28667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017397	TAAA	2	8	29152	29159	75 %	25 %	0 %	0 %	387825660
83	NC_017397	CAAG	2	8	29177	29184	50 %	0 %	25 %	25 %	387825660
84	NC_017397	AATT	2	8	29198	29205	50 %	50 %	0 %	0 %	387825660
85	NC_017397	CAAA	2	8	29357	29364	75 %	0 %	0 %	25 %	387825661
86	NC_017397	AAAT	2	8	29395	29402	75 %	25 %	0 %	0 %	387825661
87	NC_017397	AATT	2	8	29446	29453	50 %	50 %	0 %	0 %	387825661
88	NC_017397	AGCA	2	8	30121	30128	50 %	0 %	25 %	25 %	387825661
89	NC_017397	AAAT	2	8	30147	30154	75 %	25 %	0 %	0 %	387825661

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.