MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-9

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017397	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	387825623
2	NC_017397	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	387825623
3	NC_017397	T	6	6	752	757	0 %	100 %	0 %	0 %	387825623
4	NC_017397	A	6	6	1794	1799	100 %	0 %	0 %	0 %	387825624
5	NC_017397	T	6	6	2144	2149	0 %	100 %	0 %	0 %	387825625
6	NC_017397	T	6	6	3504	3509	0 %	100 %	0 %	0 %	387825627
7	NC_017397	A	6	6	4096	4101	100 %	0 %	0 %	0 %	387825628
8	NC_017397	A	6	6	5227	5232	100 %	0 %	0 %	0 %	387825629
9	NC_017397	G	6	6	5298	5303	0 %	0 %	100 %	0 %	387825629
10	NC_017397	A	6	6	6924	6929	100 %	0 %	0 %	0 %	387825633
11	NC_017397	T	6	6	6955	6960	0 %	100 %	0 %	0 %	387825633
12	NC_017397	A	6	6	7027	7032	100 %	0 %	0 %	0 %	387825633
13	NC_017397	T	7	7	7150	7156	0 %	100 %	0 %	0 %	387825633
14	NC_017397	A	6	6	7504	7509	100 %	0 %	0 %	0 %	387825633
15	NC_017397	A	7	7	8781	8787	100 %	0 %	0 %	0 %	387825636
16	NC_017397	A	7	7	8868	8874	100 %	0 %	0 %	0 %	387825636
17	NC_017397	A	6	6	9022	9027	100 %	0 %	0 %	0 %	387825637
18	NC_017397	A	6	6	9074	9079	100 %	0 %	0 %	0 %	387825637
19	NC_017397	A	6	6	9131	9136	100 %	0 %	0 %	0 %	387825637
20	NC_017397	A	6	6	9206	9211	100 %	0 %	0 %	0 %	387825637
21	NC_017397	A	6	6	9470	9475	100 %	0 %	0 %	0 %	387825637
22	NC_017397	A	8	8	9887	9894	100 %	0 %	0 %	0 %	387825637
23	NC_017397	A	6	6	10159	10164	100 %	0 %	0 %	0 %	387825637
24	NC_017397	A	6	6	10361	10366	100 %	0 %	0 %	0 %	387825638
25	NC_017397	A	6	6	10374	10379	100 %	0 %	0 %	0 %	387825638
26	NC_017397	T	6	6	10471	10476	0 %	100 %	0 %	0 %	387825638
27	NC_017397	T	6	6	10529	10534	0 %	100 %	0 %	0 %	387825638
28	NC_017397	A	7	7	11247	11253	100 %	0 %	0 %	0 %	387825639
29	NC_017397	A	6	6	12118	12123	100 %	0 %	0 %	0 %	387825640
30	NC_017397	A	6	6	12708	12713	100 %	0 %	0 %	0 %	387825641
31	NC_017397	T	8	8	12799	12806	0 %	100 %	0 %	0 %	387825641
32	NC_017397	T	7	7	13029	13035	0 %	100 %	0 %	0 %	387825642
33	NC_017397	T	6	6	13524	13529	0 %	100 %	0 %	0 %	387825642
34	NC_017397	A	8	8	13632	13639	100 %	0 %	0 %	0 %	387825642
35	NC_017397	A	6	6	13717	13722	100 %	0 %	0 %	0 %	387825642
36	NC_017397	T	6	6	13905	13910	0 %	100 %	0 %	0 %	387825643
37	NC_017397	A	6	6	14143	14148	100 %	0 %	0 %	0 %	387825643
38	NC_017397	G	6	6	14329	14334	0 %	0 %	100 %	0 %	387825643
39	NC_017397	T	6	6	14485	14490	0 %	100 %	0 %	0 %	387825644
40	NC_017397	A	6	6	14760	14765	100 %	0 %	0 %	0 %	387825644
41	NC_017397	A	7	7	15021	15027	100 %	0 %	0 %	0 %	387825644
42	NC_017397	A	6	6	15099	15104	100 %	0 %	0 %	0 %	387825644
43	NC_017397	A	6	6	15223	15228	100 %	0 %	0 %	0 %	387825645
44	NC_017397	A	7	7	15417	15423	100 %	0 %	0 %	0 %	387825645
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46	NC_017397	A	7	7	15697	15703	100 %	0 %	0 %	0 %	387825646
47	NC_017397	T	6	6	15888	15893	0 %	100 %	0 %	0 %	387825647
48	NC_017397	A	7	7	16394	16400	100 %	0 %	0 %	0 %	387825648
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50	NC_017397	A	6	6	17327	17332	100 %	0 %	0 %	0 %	387825650
51	NC_017397	A	6	6	17481	17486	100 %	0 %	0 %	0 %	387825650
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53	NC_017397	A	8	8	19000	19007	100 %	0 %	0 %	0 %	387825651
54	NC_017397	A	6	6	19103	19108	100 %	0 %	0 %	0 %	387825651
55	NC_017397	A	6	6	19112	19117	100 %	0 %	0 %	0 %	387825651
56	NC_017397	A	6	6	19307	19312	100 %	0 %	0 %	0 %	387825651
57	NC_017397	A	6	6	19351	19356	100 %	0 %	0 %	0 %	387825651
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60	NC_017397	A	8	8	19665	19672	100 %	0 %	0 %	0 %	387825651
61	NC_017397	A	6	6	19700	19705	100 %	0 %	0 %	0 %	387825651
62	NC_017397	A	7	7	19930	19936	100 %	0 %	0 %	0 %	387825651
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64	NC_017397	A	7	7	20058	20064	100 %	0 %	0 %	0 %	387825651
65	NC_017397	A	7	7	20146	20152	100 %	0 %	0 %	0 %	387825652
66	NC_017397	A	6	6	20273	20278	100 %	0 %	0 %	0 %	387825652
67	NC_017397	T	6	6	20379	20384	0 %	100 %	0 %	0 %	387825652
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71	NC_017397	A	6	6	20624	20629	100 %	0 %	0 %	0 %	387825652
72	NC_017397	A	6	6	20665	20670	100 %	0 %	0 %	0 %	387825652
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97	NC_017397	A	8	8	27211	27218	100 %	0 %	0 %	0 %	387825658
98	NC_017397	A	6	6	27237	27242	100 %	0 %	0 %	0 %	387825658
99	NC_017397	A	6	6	27259	27264	100 %	0 %	0 %	0 %	387825658
100	NC_017397	A	6	6	27277	27282	100 %	0 %	0 %	0 %	387825658
101	NC_017397	A	6	6	27421	27426	100 %	0 %	0 %	0 %	387825658
102	NC_017397	A	6	6	28123	28128	100 %	0 %	0 %	0 %	387825659
103	NC_017397	A	7	7	28173	28179	100 %	0 %	0 %	0 %	387825659
104	NC_017397	A	6	6	28273	28278	100 %	0 %	0 %	0 %	387825659
105	NC_017397	A	8	8	29169	29176	100 %	0 %	0 %	0 %	387825660
106	NC_017397	A	6	6	29280	29285	100 %	0 %	0 %	0 %	387825660
107	NC_017397	A	7	7	29490	29496	100 %	0 %	0 %	0 %	387825661
108	NC_017397	A	6	6	30521	30526	100 %	0 %	0 %	0 %	387825661

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.