MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-12

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017396	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	387825582
2	NC_017396	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	387825583
3	NC_017396	TAAAT	2	10	2415	2424	60 %	40 %	0 %	0 %	387825584
4	NC_017396	GCAAA	2	10	3867	3876	60 %	0 %	20 %	20 %	387825586
5	NC_017396	TACAA	2	10	4213	4222	60 %	20 %	0 %	20 %	387825587
6	NC_017396	AAGAA	2	10	9243	9252	80 %	0 %	20 %	0 %	387825596
7	NC_017396	GAAAA	2	10	10381	10390	80 %	0 %	20 %	0 %	387825597
8	NC_017396	TTAAA	2	10	11894	11903	60 %	40 %	0 %	0 %	387825598
9	NC_017396	TAAAG	2	10	11934	11943	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017396	AATCT	2	10	12295	12304	40 %	40 %	0 %	20 %	387825599
11	NC_017396	TACTT	2	10	13321	13330	20 %	60 %	0 %	20 %	387825601
12	NC_017396	GAAAA	2	10	13399	13408	80 %	0 %	20 %	0 %	387825601
13	NC_017396	AAAGT	2	10	13421	13430	60 %	20 %	20 %	0 %	387825601
14	NC_017396	ATTCA	2	10	14229	14238	40 %	40 %	0 %	20 %	387825602
15	NC_017396	AGACA	2	10	14529	14538	60 %	0 %	20 %	20 %	387825603
16	NC_017396	ATTAA	2	10	15263	15272	60 %	40 %	0 %	0 %	387825604
17	NC_017396	AGTAA	2	10	15900	15909	60 %	20 %	20 %	0 %	387825606
18	NC_017396	TCACT	2	10	16057	16066	20 %	40 %	0 %	40 %	387825606
19	NC_017396	TTGCT	2	10	16154	16163	0 %	60 %	20 %	20 %	387825607
20	NC_017396	TATGT	2	10	16264	16273	20 %	60 %	20 %	0 %	387825607
21	NC_017396	TAAAA	2	10	17525	17534	80 %	20 %	0 %	0 %	387825609
22	NC_017396	AATTT	2	10	18688	18697	40 %	60 %	0 %	0 %	387825610
23	NC_017396	ATTAA	2	10	19024	19033	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017396	AATTT	2	10	21129	21138	40 %	60 %	0 %	0 %	387825613
25	NC_017396	AGAAA	2	10	21713	21722	80 %	0 %	20 %	0 %	387825614
26	NC_017396	TCTAT	2	10	22707	22716	20 %	60 %	0 %	20 %	387825615
27	NC_017396	TTTTA	2	10	22834	22843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017396	GAGTT	2	10	24173	24182	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017396	ATAAA	2	10	24618	24627	80 %	20 %	0 %	0 %	387825616
30	NC_017396	ACTTG	2	10	24967	24976	20 %	40 %	20 %	20 %	387825616
31	NC_017396	ATTTT	2	10	25718	25727	20 %	80 %	0 %	0 %	387825617
32	NC_017396	AATTT	2	10	26048	26057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017396	TAAAA	2	10	27163	27172	80 %	20 %	0 %	0 %	387825618
34	NC_017396	TTTTA	2	10	27679	27688	20 %	80 %	0 %	0 %	387825619
35	NC_017396	TTACA	2	10	29851	29860	40 %	40 %	0 %	20 %	387825621

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.