MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-12

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017396	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	387825582
2	NC_017396	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	387825582
3	NC_017396	GTTC	2	8	1677	1684	0 %	50 %	25 %	25 %	387825583
4	NC_017396	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	387825583
5	NC_017396	AAGA	2	8	2380	2387	75 %	0 %	25 %	0 %	387825584
6	NC_017396	ATTT	2	8	2516	2523	25 %	75 %	0 %	0 %	387825584
7	NC_017396	GCAA	2	8	2676	2683	50 %	0 %	25 %	25 %	387825585
8	NC_017396	ATGT	2	8	3014	3021	25 %	50 %	25 %	0 %	387825585
9	NC_017396	GTAT	2	8	3039	3046	25 %	50 %	25 %	0 %	387825585
10	NC_017396	ATAA	2	8	3121	3128	75 %	25 %	0 %	0 %	387825585
11	NC_017396	CAAT	2	8	3203	3210	50 %	25 %	0 %	25 %	387825585
12	NC_017396	TAAA	2	8	3362	3369	75 %	25 %	0 %	0 %	387825586
13	NC_017396	TTTA	2	8	3889	3896	25 %	75 %	0 %	0 %	387825586
14	NC_017396	CTAC	2	8	4794	4801	25 %	25 %	0 %	50 %	387825587
15	NC_017396	TCAT	2	8	4841	4848	25 %	50 %	0 %	25 %	387825587
16	NC_017396	TTAC	2	8	5149	5156	25 %	50 %	0 %	25 %	387825588
17	NC_017396	AATG	2	8	5396	5403	50 %	25 %	25 %	0 %	387825588
18	NC_017396	AAGT	2	8	6061	6068	50 %	25 %	25 %	0 %	387825590
19	NC_017396	GAAA	2	8	6916	6923	75 %	0 %	25 %	0 %	387825592
20	NC_017396	AGAA	2	8	7216	7223	75 %	0 %	25 %	0 %	387825592
21	NC_017396	TAGA	2	8	7641	7648	50 %	25 %	25 %	0 %	387825592
22	NC_017396	ATTT	2	8	8493	8500	25 %	75 %	0 %	0 %	387825594
23	NC_017396	TGAG	2	8	8597	8604	25 %	25 %	50 %	0 %	387825594
24	NC_017396	AAAT	2	8	8731	8738	75 %	25 %	0 %	0 %	387825595
25	NC_017396	CTTG	2	8	8795	8802	0 %	50 %	25 %	25 %	387825595
26	NC_017396	GAAA	2	8	9558	9565	75 %	0 %	25 %	0 %	387825596
27	NC_017396	AGAA	2	8	10421	10428	75 %	0 %	25 %	0 %	387825597
28	NC_017396	TCAA	2	8	12201	12208	50 %	25 %	0 %	25 %	387825599
29	NC_017396	AATT	2	8	12474	12481	50 %	50 %	0 %	0 %	387825599
30	NC_017396	TATT	2	8	12687	12694	25 %	75 %	0 %	0 %	387825600
31	NC_017396	TAAT	2	8	13035	13042	50 %	50 %	0 %	0 %	387825601
32	NC_017396	AAAC	2	8	14117	14124	75 %	0 %	0 %	25 %	387825602
33	NC_017396	TCTA	2	8	14736	14743	25 %	50 %	0 %	25 %	387825603
34	NC_017396	AATA	2	8	15655	15662	75 %	25 %	0 %	0 %	387825605
35	NC_017396	TCAA	2	8	15690	15697	50 %	25 %	0 %	25 %	387825605
36	NC_017396	AGGA	2	8	15762	15769	50 %	0 %	50 %	0 %	387825605
37	NC_017396	CTAT	2	8	15774	15781	25 %	50 %	0 %	25 %	387825605
38	NC_017396	AATA	2	8	15790	15797	75 %	25 %	0 %	0 %	387825605
39	NC_017396	TAAC	2	8	15844	15851	50 %	25 %	0 %	25 %	387825606
40	NC_017396	CAAA	2	8	17609	17616	75 %	0 %	0 %	25 %	387825609
41	NC_017396	AACA	2	8	19174	19181	75 %	0 %	0 %	25 %	387825611
42	NC_017396	AAGA	3	12	19586	19597	75 %	0 %	25 %	0 %	387825611
43	NC_017396	AAAT	2	8	19740	19747	75 %	25 %	0 %	0 %	387825611
44	NC_017396	TAAA	2	8	19766	19773	75 %	25 %	0 %	0 %	387825611
45	NC_017396	AGAA	2	8	19826	19833	75 %	0 %	25 %	0 %	387825611
46	NC_017396	CAAA	2	8	19836	19843	75 %	0 %	0 %	25 %	387825611
47	NC_017396	GAAA	2	8	19981	19988	75 %	0 %	25 %	0 %	387825611
48	NC_017396	TTGA	2	8	20323	20330	25 %	50 %	25 %	0 %	387825612
49	NC_017396	AAAT	2	8	20555	20562	75 %	25 %	0 %	0 %	387825612
50	NC_017396	TTTA	2	8	20700	20707	25 %	75 %	0 %	0 %	387825612
51	NC_017396	TCAA	2	8	20820	20827	50 %	25 %	0 %	25 %	387825613
52	NC_017396	GAAA	2	8	20999	21006	75 %	0 %	25 %	0 %	387825613
53	NC_017396	ATAA	2	8	21015	21022	75 %	25 %	0 %	0 %	387825613
54	NC_017396	AAAG	2	8	21950	21957	75 %	0 %	25 %	0 %	387825614
55	NC_017396	ATAG	2	8	22406	22413	50 %	25 %	25 %	0 %	387825615
56	NC_017396	ATAG	2	8	22460	22467	50 %	25 %	25 %	0 %	387825615
57	NC_017396	ATAG	2	8	22568	22575	50 %	25 %	25 %	0 %	387825615
58	NC_017396	AGAT	2	8	22587	22594	50 %	25 %	25 %	0 %	387825615
59	NC_017396	AAAT	3	12	25188	25199	75 %	25 %	0 %	0 %	387825617
60	NC_017396	TAAA	2	8	25203	25210	75 %	25 %	0 %	0 %	387825617
61	NC_017396	AGGT	2	8	25325	25332	25 %	25 %	50 %	0 %	387825617
62	NC_017396	ACCA	2	8	25572	25579	50 %	0 %	0 %	50 %	387825617
63	NC_017396	GTTT	2	8	25592	25599	0 %	75 %	25 %	0 %	387825617
64	NC_017396	TAAA	2	8	25645	25652	75 %	25 %	0 %	0 %	387825617
65	NC_017396	AGAA	2	8	26818	26825	75 %	0 %	25 %	0 %	387825618
66	NC_017396	AAAC	2	8	27253	27260	75 %	0 %	0 %	25 %	387825618
67	NC_017396	TGTT	2	8	27595	27602	0 %	75 %	25 %	0 %	387825619
68	NC_017396	AAGG	2	8	27745	27752	50 %	0 %	50 %	0 %	387825619
69	NC_017396	CTTT	2	8	27824	27831	0 %	75 %	0 %	25 %	387825619
70	NC_017396	ATTT	2	8	27849	27856	25 %	75 %	0 %	0 %	387825619
71	NC_017396	CAAT	2	8	27902	27909	50 %	25 %	0 %	25 %	387825619
72	NC_017396	TAAA	2	8	28474	28481	75 %	25 %	0 %	0 %	387825620
73	NC_017396	AATT	2	8	28520	28527	50 %	50 %	0 %	0 %	387825620
74	NC_017396	CAAA	2	8	28679	28686	75 %	0 %	0 %	25 %	387825621
75	NC_017396	AATT	2	8	28768	28775	50 %	50 %	0 %	0 %	387825621
76	NC_017396	TGAT	2	8	29082	29089	25 %	50 %	25 %	0 %	387825621
77	NC_017396	AGCA	2	8	29443	29450	50 %	0 %	25 %	25 %	387825621
78	NC_017396	AAAT	2	8	29469	29476	75 %	25 %	0 %	0 %	387825621

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.