MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-12

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017396	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387825582
2	NC_017396	GA	3	6	1739	1744	50 %	0 %	50 %	0 %	387825583
3	NC_017396	GT	3	6	2299	2304	0 %	50 %	50 %	0 %	387825584
4	NC_017396	CA	3	6	2498	2503	50 %	0 %	0 %	50 %	387825584
5	NC_017396	TA	3	6	2964	2969	50 %	50 %	0 %	0 %	387825585
6	NC_017396	AT	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	387825585
7	NC_017396	AT	3	6	4271	4276	50 %	50 %	0 %	0 %	387825587
8	NC_017396	TG	3	6	5380	5385	0 %	50 %	50 %	0 %	387825588
9	NC_017396	AG	3	6	5521	5526	50 %	0 %	50 %	0 %	387825589
10	NC_017396	AT	3	6	5914	5919	50 %	50 %	0 %	0 %	387825590
11	NC_017396	TA	3	6	5930	5935	50 %	50 %	0 %	0 %	387825590
12	NC_017396	AT	4	8	6406	6413	50 %	50 %	0 %	0 %	387825591
13	NC_017396	AC	3	6	7048	7053	50 %	0 %	0 %	50 %	387825592
14	NC_017396	TA	3	6	7496	7501	50 %	50 %	0 %	0 %	387825592
15	NC_017396	AG	3	6	9169	9174	50 %	0 %	50 %	0 %	387825596
16	NC_017396	AT	3	6	9929	9934	50 %	50 %	0 %	0 %	387825596
17	NC_017396	TA	3	6	10718	10723	50 %	50 %	0 %	0 %	387825597
18	NC_017396	AT	3	6	11248	11253	50 %	50 %	0 %	0 %	387825598
19	NC_017396	AT	4	8	11563	11570	50 %	50 %	0 %	0 %	387825598
20	NC_017396	AC	3	6	11771	11776	50 %	0 %	0 %	50 %	387825598
21	NC_017396	CA	3	6	12139	12144	50 %	0 %	0 %	50 %	387825599
22	NC_017396	TA	3	6	12262	12267	50 %	50 %	0 %	0 %	387825599
23	NC_017396	AT	3	6	12817	12822	50 %	50 %	0 %	0 %	387825600
24	NC_017396	AT	3	6	13211	13216	50 %	50 %	0 %	0 %	387825601
25	NC_017396	AT	3	6	13896	13901	50 %	50 %	0 %	0 %	387825602
26	NC_017396	TA	3	6	15118	15123	50 %	50 %	0 %	0 %	387825603
27	NC_017396	AT	3	6	15137	15142	50 %	50 %	0 %	0 %	387825603
28	NC_017396	TA	3	6	15205	15210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017396	AT	3	6	15519	15524	50 %	50 %	0 %	0 %	387825605
30	NC_017396	AT	3	6	15929	15934	50 %	50 %	0 %	0 %	387825606
31	NC_017396	AT	3	6	16097	16102	50 %	50 %	0 %	0 %	387825606
32	NC_017396	AT	3	6	16402	16407	50 %	50 %	0 %	0 %	387825607
33	NC_017396	AT	3	6	16629	16634	50 %	50 %	0 %	0 %	387825608
34	NC_017396	AT	3	6	16840	16845	50 %	50 %	0 %	0 %	387825608
35	NC_017396	AT	3	6	16894	16899	50 %	50 %	0 %	0 %	387825608
36	NC_017396	AC	3	6	19244	19249	50 %	0 %	0 %	50 %	387825611
37	NC_017396	TA	3	6	20735	20740	50 %	50 %	0 %	0 %	387825612
38	NC_017396	AT	3	6	20983	20988	50 %	50 %	0 %	0 %	387825613
39	NC_017396	TA	3	6	21288	21293	50 %	50 %	0 %	0 %	387825613
40	NC_017396	AT	3	6	21527	21532	50 %	50 %	0 %	0 %	387825613
41	NC_017396	AT	3	6	22317	22322	50 %	50 %	0 %	0 %	387825615
42	NC_017396	AT	3	6	22512	22517	50 %	50 %	0 %	0 %	387825615
43	NC_017396	AT	3	6	22620	22625	50 %	50 %	0 %	0 %	387825615
44	NC_017396	TA	3	6	23185	23190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017396	AT	3	6	24772	24777	50 %	50 %	0 %	0 %	387825616
46	NC_017396	AG	3	6	25093	25098	50 %	0 %	50 %	0 %	387825617
47	NC_017396	AT	3	6	26028	26033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017396	GA	3	6	26103	26108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017396	TA	3	6	26175	26180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017396	TA	3	6	27444	27449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017396	GT	3	6	27872	27877	0 %	50 %	50 %	0 %	387825619
52	NC_017396	TG	3	6	28208	28213	0 %	50 %	50 %	0 %	387825620
53	NC_017396	AT	3	6	29074	29079	50 %	50 %	0 %	0 %	387825621
54	NC_017396	AG	3	6	29978	29983	50 %	0 %	50 %	0 %	387825621

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.