MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-12

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017396	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	387825582
2	NC_017396	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	387825582
3	NC_017396	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	387825582
4	NC_017396	A	6	6	1791	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	387825583
5	NC_017396	T	6	6	2141	2146	0 %	100 %	0 %	0 %	387825584
6	NC_017396	T	6	6	3501	3506	0 %	100 %	0 %	0 %	387825586
7	NC_017396	A	6	6	4093	4098	100 %	0 %	0 %	0 %	387825587
8	NC_017396	A	6	6	5224	5229	100 %	0 %	0 %	0 %	387825588
9	NC_017396	G	6	6	5295	5300	0 %	0 %	100 %	0 %	387825588
10	NC_017396	A	6	6	6921	6926	100 %	0 %	0 %	0 %	387825592
11	NC_017396	T	6	6	6952	6957	0 %	100 %	0 %	0 %	387825592
12	NC_017396	A	6	6	7024	7029	100 %	0 %	0 %	0 %	387825592
13	NC_017396	T	7	7	7147	7153	0 %	100 %	0 %	0 %	387825592
14	NC_017396	A	6	6	7501	7506	100 %	0 %	0 %	0 %	387825592
15	NC_017396	G	6	6	7816	7821	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017396	A	6	6	8231	8236	100 %	0 %	0 %	0 %	387825593
17	NC_017396	A	6	6	8574	8579	100 %	0 %	0 %	0 %	387825594
18	NC_017396	A	6	6	8780	8785	100 %	0 %	0 %	0 %	387825595
19	NC_017396	A	6	6	9021	9026	100 %	0 %	0 %	0 %	387825596
20	NC_017396	A	6	6	9073	9078	100 %	0 %	0 %	0 %	387825596
21	NC_017396	A	6	6	9108	9113	100 %	0 %	0 %	0 %	387825596
22	NC_017396	A	6	6	9130	9135	100 %	0 %	0 %	0 %	387825596
23	NC_017396	A	6	6	9469	9474	100 %	0 %	0 %	0 %	387825596
24	NC_017396	A	6	6	9493	9498	100 %	0 %	0 %	0 %	387825596
25	NC_017396	A	6	6	9675	9680	100 %	0 %	0 %	0 %	387825596
26	NC_017396	G	6	6	9879	9884	0 %	0 %	100 %	0 %	387825596
27	NC_017396	A	7	7	10312	10318	100 %	0 %	0 %	0 %	387825597
28	NC_017396	A	6	6	10387	10392	100 %	0 %	0 %	0 %	387825597
29	NC_017396	A	6	6	10400	10405	100 %	0 %	0 %	0 %	387825597
30	NC_017396	T	6	6	10497	10502	0 %	100 %	0 %	0 %	387825597
31	NC_017396	T	6	6	10555	10560	0 %	100 %	0 %	0 %	387825597
32	NC_017396	A	6	6	10982	10987	100 %	0 %	0 %	0 %	387825597
33	NC_017396	A	7	7	11273	11279	100 %	0 %	0 %	0 %	387825598
34	NC_017396	A	6	6	12086	12091	100 %	0 %	0 %	0 %	387825599
35	NC_017396	A	6	6	12144	12149	100 %	0 %	0 %	0 %	387825599
36	NC_017396	A	7	7	12423	12429	100 %	0 %	0 %	0 %	387825599
37	NC_017396	A	6	6	12734	12739	100 %	0 %	0 %	0 %	387825600
38	NC_017396	T	8	8	12825	12832	0 %	100 %	0 %	0 %	387825600
39	NC_017396	T	7	7	13055	13061	0 %	100 %	0 %	0 %	387825601
40	NC_017396	T	6	6	13550	13555	0 %	100 %	0 %	0 %	387825601
41	NC_017396	A	8	8	13658	13665	100 %	0 %	0 %	0 %	387825601
42	NC_017396	A	6	6	13743	13748	100 %	0 %	0 %	0 %	387825601
43	NC_017396	T	6	6	13931	13936	0 %	100 %	0 %	0 %	387825602
44	NC_017396	A	6	6	14169	14174	100 %	0 %	0 %	0 %	387825602
45	NC_017396	G	6	6	14355	14360	0 %	0 %	100 %	0 %	387825602
46	NC_017396	T	6	6	14511	14516	0 %	100 %	0 %	0 %	387825603
47	NC_017396	A	6	6	14786	14791	100 %	0 %	0 %	0 %	387825603
48	NC_017396	A	7	7	15047	15053	100 %	0 %	0 %	0 %	387825603
49	NC_017396	A	6	6	15125	15130	100 %	0 %	0 %	0 %	387825603
50	NC_017396	A	6	6	15249	15254	100 %	0 %	0 %	0 %	387825604
51	NC_017396	A	7	7	15443	15449	100 %	0 %	0 %	0 %	387825604
52	NC_017396	A	6	6	15684	15689	100 %	0 %	0 %	0 %	387825605
53	NC_017396	A	7	7	15723	15729	100 %	0 %	0 %	0 %	387825605
54	NC_017396	T	6	6	15914	15919	0 %	100 %	0 %	0 %	387825606
55	NC_017396	A	7	7	16420	16426	100 %	0 %	0 %	0 %	387825607
56	NC_017396	A	7	7	17249	17255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017396	A	8	8	17446	17453	100 %	0 %	0 %	0 %	387825609
58	NC_017396	A	6	6	17596	17601	100 %	0 %	0 %	0 %	387825609
59	NC_017396	G	6	6	17637	17642	0 %	0 %	100 %	0 %	387825609
60	NC_017396	T	6	6	17884	17889	0 %	100 %	0 %	0 %	387825610
61	NC_017396	T	6	6	18014	18019	0 %	100 %	0 %	0 %	387825610
62	NC_017396	T	8	8	18120	18127	0 %	100 %	0 %	0 %	387825610
63	NC_017396	T	7	7	18169	18175	0 %	100 %	0 %	0 %	387825610
64	NC_017396	T	6	6	18206	18211	0 %	100 %	0 %	0 %	387825610
65	NC_017396	A	8	8	18543	18550	100 %	0 %	0 %	0 %	387825610
66	NC_017396	T	6	6	18816	18821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017396	T	7	7	18893	18899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017396	A	6	6	18924	18929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017396	T	7	7	19050	19056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017396	A	7	7	19126	19132	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
71	NC_017396	A	6	6	19228	19233	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
72	NC_017396	A	6	6	19237	19242	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
73	NC_017396	A	6	6	19432	19437	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
74	NC_017396	A	6	6	19476	19481	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
75	NC_017396	A	6	6	19752	19757	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
76	NC_017396	A	7	7	19986	19992	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
77	NC_017396	A	7	7	20058	20064	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
78	NC_017396	A	7	7	20178	20184	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
79	NC_017396	A	6	6	20187	20192	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
80	NC_017396	A	7	7	20274	20280	100 %	0 %	0 %	0 %	387825612
81	NC_017396	A	6	6	20401	20406	100 %	0 %	0 %	0 %	387825612
82	NC_017396	T	6	6	20507	20512	0 %	100 %	0 %	0 %	387825612
83	NC_017396	A	7	7	20668	20674	100 %	0 %	0 %	0 %	387825612
84	NC_017396	A	6	6	20752	20757	100 %	0 %	0 %	0 %	387825612
85	NC_017396	A	6	6	20793	20798	100 %	0 %	0 %	0 %	387825612
86	NC_017396	T	7	7	21136	21142	0 %	100 %	0 %	0 %	387825613
87	NC_017396	A	8	8	21342	21349	100 %	0 %	0 %	0 %	387825613
88	NC_017396	A	6	6	21387	21392	100 %	0 %	0 %	0 %	387825613
89	NC_017396	T	6	6	21507	21512	0 %	100 %	0 %	0 %	387825613
90	NC_017396	T	6	6	21578	21583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017396	A	9	9	21639	21647	100 %	0 %	0 %	0 %	387825614
92	NC_017396	A	6	6	21968	21973	100 %	0 %	0 %	0 %	387825614
93	NC_017396	A	7	7	22117	22123	100 %	0 %	0 %	0 %	387825614
94	NC_017396	T	6	6	22199	22204	0 %	100 %	0 %	0 %	387825615
95	NC_017396	A	7	7	22299	22305	100 %	0 %	0 %	0 %	387825615
96	NC_017396	A	7	7	22353	22359	100 %	0 %	0 %	0 %	387825615
97	NC_017396	A	6	6	22546	22551	100 %	0 %	0 %	0 %	387825615
98	NC_017396	A	6	6	22602	22607	100 %	0 %	0 %	0 %	387825615
99	NC_017396	A	6	6	22633	22638	100 %	0 %	0 %	0 %	387825615
100	NC_017396	T	6	6	22729	22734	0 %	100 %	0 %	0 %	387825615
101	NC_017396	T	6	6	22805	22810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017396	A	7	7	23054	23060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017396	A	7	7	23073	23079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017396	T	6	6	23139	23144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017396	T	6	6	23150	23155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017396	A	6	6	23158	23163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017396	A	6	6	23306	23311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017396	A	6	6	23360	23365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017396	T	6	6	23862	23867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017396	T	6	6	23880	23885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017396	A	7	7	24325	24331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017396	A	6	6	24567	24572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017396	A	7	7	24575	24581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017396	A	6	6	24940	24945	100 %	0 %	0 %	0 %	387825616
115	NC_017396	T	7	7	25034	25040	0 %	100 %	0 %	0 %	387825617
116	NC_017396	T	6	6	25240	25245	0 %	100 %	0 %	0 %	387825617
117	NC_017396	T	6	6	25261	25266	0 %	100 %	0 %	0 %	387825617
118	NC_017396	T	6	6	25314	25319	0 %	100 %	0 %	0 %	387825617
119	NC_017396	T	7	7	25440	25446	0 %	100 %	0 %	0 %	387825617
120	NC_017396	T	6	6	25675	25680	0 %	100 %	0 %	0 %	387825617
121	NC_017396	T	6	6	25985	25990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017396	A	6	6	26362	26367	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
123	NC_017396	A	8	8	26457	26464	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
124	NC_017396	A	6	6	26466	26471	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
125	NC_017396	A	6	6	26587	26592	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
126	NC_017396	A	6	6	26655	26660	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
127	NC_017396	A	6	6	26724	26729	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
128	NC_017396	A	6	6	26795	26800	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
129	NC_017396	A	7	7	26824	26830	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
130	NC_017396	A	6	6	26842	26847	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
131	NC_017396	A	6	6	26920	26925	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
132	NC_017396	A	7	7	27359	27365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017396	T	6	6	27409	27414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017396	T	6	6	27807	27812	0 %	100 %	0 %	0 %	387825619
135	NC_017396	T	6	6	27840	27845	0 %	100 %	0 %	0 %	387825619
136	NC_017396	T	6	6	27877	27882	0 %	100 %	0 %	0 %	387825619
137	NC_017396	A	8	8	28491	28498	100 %	0 %	0 %	0 %	387825620
138	NC_017396	A	6	6	28602	28607	100 %	0 %	0 %	0 %	387825620
139	NC_017396	A	7	7	28812	28818	100 %	0 %	0 %	0 %	387825621
140	NC_017396	A	7	7	28848	28854	100 %	0 %	0 %	0 %	387825621

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.