MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-12

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017396	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	387825582
2	NC_017396	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	387825582
3	NC_017396	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	387825582
4	NC_017396	A	6	6	1791	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	387825583
5	NC_017396	T	6	6	2141	2146	0 %	100 %	0 %	0 %	387825584
6	NC_017396	T	6	6	3501	3506	0 %	100 %	0 %	0 %	387825586
7	NC_017396	A	6	6	4093	4098	100 %	0 %	0 %	0 %	387825587
8	NC_017396	A	6	6	5224	5229	100 %	0 %	0 %	0 %	387825588
9	NC_017396	G	6	6	5295	5300	0 %	0 %	100 %	0 %	387825588
10	NC_017396	A	6	6	6921	6926	100 %	0 %	0 %	0 %	387825592
11	NC_017396	T	6	6	6952	6957	0 %	100 %	0 %	0 %	387825592
12	NC_017396	A	6	6	7024	7029	100 %	0 %	0 %	0 %	387825592
13	NC_017396	T	7	7	7147	7153	0 %	100 %	0 %	0 %	387825592
14	NC_017396	A	6	6	7501	7506	100 %	0 %	0 %	0 %	387825592
15	NC_017396	A	6	6	8231	8236	100 %	0 %	0 %	0 %	387825593
16	NC_017396	A	6	6	8574	8579	100 %	0 %	0 %	0 %	387825594
17	NC_017396	A	6	6	8780	8785	100 %	0 %	0 %	0 %	387825595
18	NC_017396	A	6	6	9021	9026	100 %	0 %	0 %	0 %	387825596
19	NC_017396	A	6	6	9073	9078	100 %	0 %	0 %	0 %	387825596
20	NC_017396	A	6	6	9108	9113	100 %	0 %	0 %	0 %	387825596
21	NC_017396	A	6	6	9130	9135	100 %	0 %	0 %	0 %	387825596
22	NC_017396	A	6	6	9469	9474	100 %	0 %	0 %	0 %	387825596
23	NC_017396	A	6	6	9493	9498	100 %	0 %	0 %	0 %	387825596
24	NC_017396	A	6	6	9675	9680	100 %	0 %	0 %	0 %	387825596
25	NC_017396	G	6	6	9879	9884	0 %	0 %	100 %	0 %	387825596
26	NC_017396	A	7	7	10312	10318	100 %	0 %	0 %	0 %	387825597
27	NC_017396	A	6	6	10387	10392	100 %	0 %	0 %	0 %	387825597
28	NC_017396	A	6	6	10400	10405	100 %	0 %	0 %	0 %	387825597
29	NC_017396	T	6	6	10497	10502	0 %	100 %	0 %	0 %	387825597
30	NC_017396	T	6	6	10555	10560	0 %	100 %	0 %	0 %	387825597
31	NC_017396	A	6	6	10982	10987	100 %	0 %	0 %	0 %	387825597
32	NC_017396	A	7	7	11273	11279	100 %	0 %	0 %	0 %	387825598
33	NC_017396	A	6	6	12086	12091	100 %	0 %	0 %	0 %	387825599
34	NC_017396	A	6	6	12144	12149	100 %	0 %	0 %	0 %	387825599
35	NC_017396	A	7	7	12423	12429	100 %	0 %	0 %	0 %	387825599
36	NC_017396	A	6	6	12734	12739	100 %	0 %	0 %	0 %	387825600
37	NC_017396	T	8	8	12825	12832	0 %	100 %	0 %	0 %	387825600
38	NC_017396	T	7	7	13055	13061	0 %	100 %	0 %	0 %	387825601
39	NC_017396	T	6	6	13550	13555	0 %	100 %	0 %	0 %	387825601
40	NC_017396	A	8	8	13658	13665	100 %	0 %	0 %	0 %	387825601
41	NC_017396	A	6	6	13743	13748	100 %	0 %	0 %	0 %	387825601
42	NC_017396	T	6	6	13931	13936	0 %	100 %	0 %	0 %	387825602
43	NC_017396	A	6	6	14169	14174	100 %	0 %	0 %	0 %	387825602
44	NC_017396	G	6	6	14355	14360	0 %	0 %	100 %	0 %	387825602
45	NC_017396	T	6	6	14511	14516	0 %	100 %	0 %	0 %	387825603
46	NC_017396	A	6	6	14786	14791	100 %	0 %	0 %	0 %	387825603
47	NC_017396	A	7	7	15047	15053	100 %	0 %	0 %	0 %	387825603
48	NC_017396	A	6	6	15125	15130	100 %	0 %	0 %	0 %	387825603
49	NC_017396	A	6	6	15249	15254	100 %	0 %	0 %	0 %	387825604
50	NC_017396	A	7	7	15443	15449	100 %	0 %	0 %	0 %	387825604
51	NC_017396	A	6	6	15684	15689	100 %	0 %	0 %	0 %	387825605
52	NC_017396	A	7	7	15723	15729	100 %	0 %	0 %	0 %	387825605
53	NC_017396	T	6	6	15914	15919	0 %	100 %	0 %	0 %	387825606
54	NC_017396	A	7	7	16420	16426	100 %	0 %	0 %	0 %	387825607
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60	NC_017396	T	8	8	18120	18127	0 %	100 %	0 %	0 %	387825610
61	NC_017396	T	7	7	18169	18175	0 %	100 %	0 %	0 %	387825610
62	NC_017396	T	6	6	18206	18211	0 %	100 %	0 %	0 %	387825610
63	NC_017396	A	8	8	18543	18550	100 %	0 %	0 %	0 %	387825610
64	NC_017396	A	7	7	19126	19132	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
65	NC_017396	A	6	6	19228	19233	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
66	NC_017396	A	6	6	19237	19242	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
67	NC_017396	A	6	6	19432	19437	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
68	NC_017396	A	6	6	19476	19481	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
69	NC_017396	A	6	6	19752	19757	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
70	NC_017396	A	7	7	19986	19992	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
71	NC_017396	A	7	7	20058	20064	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
72	NC_017396	A	7	7	20178	20184	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
73	NC_017396	A	6	6	20187	20192	100 %	0 %	0 %	0 %	387825611
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86	NC_017396	A	7	7	22117	22123	100 %	0 %	0 %	0 %	387825614
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89	NC_017396	A	7	7	22353	22359	100 %	0 %	0 %	0 %	387825615
90	NC_017396	A	6	6	22546	22551	100 %	0 %	0 %	0 %	387825615
91	NC_017396	A	6	6	22602	22607	100 %	0 %	0 %	0 %	387825615
92	NC_017396	A	6	6	22633	22638	100 %	0 %	0 %	0 %	387825615
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99	NC_017396	T	7	7	25440	25446	0 %	100 %	0 %	0 %	387825617
100	NC_017396	T	6	6	25675	25680	0 %	100 %	0 %	0 %	387825617
101	NC_017396	A	6	6	26362	26367	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
102	NC_017396	A	8	8	26457	26464	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
103	NC_017396	A	6	6	26466	26471	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
104	NC_017396	A	6	6	26587	26592	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
105	NC_017396	A	6	6	26655	26660	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
106	NC_017396	A	6	6	26724	26729	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
107	NC_017396	A	6	6	26795	26800	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
108	NC_017396	A	7	7	26824	26830	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
109	NC_017396	A	6	6	26842	26847	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
110	NC_017396	A	6	6	26920	26925	100 %	0 %	0 %	0 %	387825618
111	NC_017396	T	6	6	27807	27812	0 %	100 %	0 %	0 %	387825619
112	NC_017396	T	6	6	27840	27845	0 %	100 %	0 %	0 %	387825619
113	NC_017396	T	6	6	27877	27882	0 %	100 %	0 %	0 %	387825619
114	NC_017396	A	8	8	28491	28498	100 %	0 %	0 %	0 %	387825620
115	NC_017396	A	6	6	28602	28607	100 %	0 %	0 %	0 %	387825620
116	NC_017396	A	7	7	28812	28818	100 %	0 %	0 %	0 %	387825621
117	NC_017396	A	7	7	28848	28854	100 %	0 %	0 %	0 %	387825621

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.