MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp26

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017395	AATTTA	2	12	6195	6206	50 %	50 %	0 %	0 %	387825562
2	NC_017395	AGAAAA	2	12	6865	6876	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387825563
3	NC_017395	ATTGAA	2	12	7226	7237	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387825563
4	NC_017395	TAAAAT	2	12	7590	7601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825563
5	NC_017395	TTAAAA	2	12	8626	8637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825564
6	NC_017395	GAAAAC	2	12	8664	8675	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387825564
7	NC_017395	AAATTT	2	12	11984	11995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017395	AACTCC	2	12	14397	14408	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387825570
9	NC_017395	TATCAA	2	12	14654	14665	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387825570
10	NC_017395	TTTATT	2	12	16944	16955	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387825572
11	NC_017395	CAATAC	2	12	18557	18568	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387825573
12	NC_017395	AAATTT	2	12	21661	21672	50 %	50 %	0 %	0 %	387825576
13	NC_017395	ATTAAA	2	12	22317	22328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825577
14	NC_017395	ATCTAT	2	12	24869	24880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387825580
15	NC_017395	CTGCAA	2	12	25279	25290	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387825580

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.