MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp26

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017395	ATTTG	2	10	1825	1834	20 %	60 %	20 %	0 %	387825557
2	NC_017395	TTAAA	2	10	2266	2275	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017395	TAAAA	2	10	3667	3676	80 %	20 %	0 %	0 %	387825558
4	NC_017395	TATAA	2	10	4012	4021	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017395	TTTTA	2	10	4326	4335	20 %	80 %	0 %	0 %	387825559
6	NC_017395	ATTAG	2	10	5063	5072	40 %	40 %	20 %	0 %	387825561
7	NC_017395	TAAAA	2	10	6299	6308	80 %	20 %	0 %	0 %	387825562
8	NC_017395	AAAAT	2	10	6495	6504	80 %	20 %	0 %	0 %	387825562
9	NC_017395	ACTTT	2	10	7760	7769	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017395	GAAAA	2	10	8645	8654	80 %	0 %	20 %	0 %	387825564
11	NC_017395	AAAAT	2	10	10097	10106	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017395	GAAAT	2	10	10156	10165	60 %	20 %	20 %	0 %	387825567
13	NC_017395	TATGC	2	10	10437	10446	20 %	40 %	20 %	20 %	387825567
14	NC_017395	TCCAA	2	10	11008	11017	40 %	20 %	0 %	40 %	387825568
15	NC_017395	ATTTT	2	10	11906	11915	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017395	AATTT	2	10	12062	12071	40 %	60 %	0 %	0 %	387825569
17	NC_017395	CATTT	2	10	12297	12306	20 %	60 %	0 %	20 %	387825569
18	NC_017395	ATCTT	2	10	12364	12373	20 %	60 %	0 %	20 %	387825569
19	NC_017395	GCAAA	2	10	12456	12465	60 %	0 %	20 %	20 %	387825569
20	NC_017395	TACAA	2	10	13148	13157	60 %	20 %	0 %	20 %	387825569
21	NC_017395	ATTTA	2	10	13579	13588	40 %	60 %	0 %	0 %	387825569
22	NC_017395	TATGT	2	10	13900	13909	20 %	60 %	20 %	0 %	387825570
23	NC_017395	TCTTT	2	10	14866	14875	0 %	80 %	0 %	20 %	387825570
24	NC_017395	TTAAA	2	10	16451	16460	60 %	40 %	0 %	0 %	387825571
25	NC_017395	ATTTT	2	10	19366	19375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017395	TCTTT	2	10	19526	19535	0 %	80 %	0 %	20 %	387825574
27	NC_017395	TAAAT	2	10	20163	20172	60 %	40 %	0 %	0 %	387825574
28	NC_017395	TAGTA	2	10	20610	20619	40 %	40 %	20 %	0 %	387825574
29	NC_017395	TTATA	2	10	21886	21895	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017395	ATAAA	2	10	22445	22454	80 %	20 %	0 %	0 %	387825577
31	NC_017395	AAGAT	2	10	22816	22825	60 %	20 %	20 %	0 %	387825578
32	NC_017395	TTTTA	2	10	23026	23035	20 %	80 %	0 %	0 %	387825578
33	NC_017395	TAAAG	2	10	23212	23221	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017395	ATAAA	2	10	23529	23538	80 %	20 %	0 %	0 %	387825579
35	NC_017395	ATTTA	2	10	24598	24607	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017395	GAAGA	2	10	26191	26200	60 %	0 %	40 %	0 %	387825580
37	NC_017395	ATATA	2	10	26491	26500	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.