MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp26

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017395	ATTTG	2	10	1825	1834	20 %	60 %	20 %	0 %	387825557
2	NC_017395	TAAAA	2	10	3667	3676	80 %	20 %	0 %	0 %	387825558
3	NC_017395	TTTTA	2	10	4326	4335	20 %	80 %	0 %	0 %	387825559
4	NC_017395	ATTAG	2	10	5063	5072	40 %	40 %	20 %	0 %	387825561
5	NC_017395	TAAAA	2	10	6299	6308	80 %	20 %	0 %	0 %	387825562
6	NC_017395	AAAAT	2	10	6495	6504	80 %	20 %	0 %	0 %	387825562
7	NC_017395	GAAAA	2	10	8645	8654	80 %	0 %	20 %	0 %	387825564
8	NC_017395	GAAAT	2	10	10156	10165	60 %	20 %	20 %	0 %	387825567
9	NC_017395	TATGC	2	10	10437	10446	20 %	40 %	20 %	20 %	387825567
10	NC_017395	TCCAA	2	10	11008	11017	40 %	20 %	0 %	40 %	387825568
11	NC_017395	AATTT	2	10	12062	12071	40 %	60 %	0 %	0 %	387825569
12	NC_017395	CATTT	2	10	12297	12306	20 %	60 %	0 %	20 %	387825569
13	NC_017395	ATCTT	2	10	12364	12373	20 %	60 %	0 %	20 %	387825569
14	NC_017395	GCAAA	2	10	12456	12465	60 %	0 %	20 %	20 %	387825569
15	NC_017395	TACAA	2	10	13148	13157	60 %	20 %	0 %	20 %	387825569
16	NC_017395	ATTTA	2	10	13579	13588	40 %	60 %	0 %	0 %	387825569
17	NC_017395	TATGT	2	10	13900	13909	20 %	60 %	20 %	0 %	387825570
18	NC_017395	TCTTT	2	10	14866	14875	0 %	80 %	0 %	20 %	387825570
19	NC_017395	TTAAA	2	10	16451	16460	60 %	40 %	0 %	0 %	387825571
20	NC_017395	TCTTT	2	10	19526	19535	0 %	80 %	0 %	20 %	387825574
21	NC_017395	TAAAT	2	10	20163	20172	60 %	40 %	0 %	0 %	387825574
22	NC_017395	TAGTA	2	10	20610	20619	40 %	40 %	20 %	0 %	387825574
23	NC_017395	ATAAA	2	10	22445	22454	80 %	20 %	0 %	0 %	387825577
24	NC_017395	AAGAT	2	10	22816	22825	60 %	20 %	20 %	0 %	387825578
25	NC_017395	TTTTA	2	10	23026	23035	20 %	80 %	0 %	0 %	387825578
26	NC_017395	ATAAA	2	10	23529	23538	80 %	20 %	0 %	0 %	387825579
27	NC_017395	GAAGA	2	10	26191	26200	60 %	0 %	40 %	0 %	387825580

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.