MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp26

Total Repeats: 339

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017395	TAA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825555
2	NC_017395	ACA	2	6	54	59	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825555
3	NC_017395	ATA	2	6	122	127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825555
4	NC_017395	ATT	2	6	222	227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825555
5	NC_017395	TAT	2	6	316	321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825555
6	NC_017395	CTG	2	6	646	651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825556
7	NC_017395	ATT	2	6	859	864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
8	NC_017395	ATC	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825557
9	NC_017395	TTA	2	6	1046	1051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
10	NC_017395	TAA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825557
11	NC_017395	TAT	2	6	1142	1147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
12	NC_017395	GTT	2	6	1198	1203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825557
13	NC_017395	AAT	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825557
14	NC_017395	ATT	2	6	1338	1343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
15	NC_017395	TAT	2	6	1364	1369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
16	NC_017395	AGA	2	6	1386	1391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825557
17	NC_017395	AAC	2	6	1485	1490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825557
18	NC_017395	ATT	2	6	1503	1508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
19	NC_017395	GAC	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825557
20	NC_017395	ATT	2	6	1666	1671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
21	NC_017395	TCA	2	6	1816	1821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825557
22	NC_017395	TTC	2	6	1895	1900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825557
23	NC_017395	TAT	2	6	1925	1930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
24	NC_017395	ATT	2	6	1975	1980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
25	NC_017395	ATT	2	6	2005	2010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
26	NC_017395	TAA	2	6	2520	2525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825558
27	NC_017395	AAT	3	9	2555	2563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825558
28	NC_017395	AAT	2	6	2659	2664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825558
29	NC_017395	CAA	2	6	2688	2693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825558
30	NC_017395	ATA	2	6	2765	2770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825558
31	NC_017395	CAT	2	6	2845	2850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825558
32	NC_017395	CAC	2	6	2880	2885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825558
33	NC_017395	CAG	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825558
34	NC_017395	AAT	2	6	3004	3009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825558
35	NC_017395	ATA	2	6	3039	3044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825558
36	NC_017395	ATT	2	6	3122	3127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825558
37	NC_017395	CAA	2	6	3195	3200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825558
38	NC_017395	CAG	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825558
39	NC_017395	AGC	2	6	3310	3315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825558
40	NC_017395	AAT	2	6	3316	3321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825558
41	NC_017395	AGC	2	6	3400	3405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825558
42	NC_017395	TCC	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387825558
43	NC_017395	ACA	2	6	3530	3535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825558
44	NC_017395	ATA	2	6	3545	3550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825558
45	NC_017395	AGA	2	6	4110	4115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825559
46	NC_017395	TGT	2	6	4140	4145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825559
47	NC_017395	ATA	2	6	4282	4287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825559
48	NC_017395	GAA	2	6	4387	4392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825559
49	NC_017395	ATA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825559
50	NC_017395	CAA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825560
51	NC_017395	GTT	2	6	4590	4595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825560
52	NC_017395	CAC	2	6	4603	4608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825560
53	NC_017395	TAA	2	6	4619	4624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825560
54	NC_017395	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825560
55	NC_017395	AAT	2	6	4670	4675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825560
56	NC_017395	ATT	2	6	4823	4828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825561
57	NC_017395	TAT	2	6	4957	4962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825561
58	NC_017395	ATT	2	6	5034	5039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825561
59	NC_017395	GAA	2	6	5093	5098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825561
60	NC_017395	AAT	2	6	5173	5178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825561
61	NC_017395	ACA	2	6	5270	5275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825561
62	NC_017395	ATT	2	6	5289	5294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825561
63	NC_017395	TTA	2	6	5313	5318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825561
64	NC_017395	TAA	2	6	5323	5328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825561
65	NC_017395	AGA	2	6	5332	5337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825561
66	NC_017395	AAG	2	6	5358	5363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825561
67	NC_017395	AAG	2	6	5427	5432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825561
68	NC_017395	AAT	2	6	5563	5568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825561
69	NC_017395	TAC	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825561
70	NC_017395	AAT	2	6	5645	5650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825561
71	NC_017395	TTC	2	6	5707	5712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825561
72	NC_017395	AAT	2	6	5765	5770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825561
73	NC_017395	ATG	2	6	5802	5807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825561
74	NC_017395	ATA	2	6	5852	5857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825561
75	NC_017395	ATA	3	9	5924	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825562
76	NC_017395	AGA	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825562
77	NC_017395	ATA	2	6	6078	6083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825562
78	NC_017395	TAA	2	6	6236	6241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825562
79	NC_017395	ATT	2	6	6281	6286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825562
80	NC_017395	AAT	2	6	6316	6321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825562
81	NC_017395	TTA	2	6	6418	6423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825562
82	NC_017395	TAA	2	6	6439	6444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825562
83	NC_017395	GAA	2	6	6450	6455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825562
84	NC_017395	TAA	2	6	6484	6489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825562
85	NC_017395	AAG	2	6	6795	6800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825563
86	NC_017395	AAT	2	6	6805	6810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825563
87	NC_017395	ATA	2	6	6825	6830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825563
88	NC_017395	TCA	2	6	6894	6899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825563
89	NC_017395	GAA	2	6	6944	6949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825563
90	NC_017395	ATT	2	6	6957	6962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825563
91	NC_017395	TAA	2	6	7000	7005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825563
92	NC_017395	ATT	2	6	7010	7015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825563
93	NC_017395	TAA	2	6	7132	7137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825563
94	NC_017395	ATA	2	6	7215	7220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825563
95	NC_017395	ATT	2	6	7275	7280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825563
96	NC_017395	ATT	2	6	7306	7311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825563
97	NC_017395	ATT	2	6	7362	7367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825563
98	NC_017395	ATG	2	6	7446	7451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825563
99	NC_017395	CCT	2	6	7478	7483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387825563
100	NC_017395	CTT	2	6	7646	7651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825563
101	NC_017395	AAG	2	6	7665	7670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825563
102	NC_017395	CAA	2	6	7856	7861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825564
103	NC_017395	TAA	2	6	7871	7876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825564
104	NC_017395	AGT	2	6	7877	7882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825564
105	NC_017395	ACT	2	6	7930	7935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825564
106	NC_017395	TGT	2	6	7967	7972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825564
107	NC_017395	ATA	2	6	8238	8243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825564
108	NC_017395	GAA	2	6	8244	8249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825564
109	NC_017395	TAA	2	6	8297	8302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825564
110	NC_017395	AGA	2	6	8420	8425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825564
111	NC_017395	GAA	2	6	8493	8498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825564
112	NC_017395	GAA	2	6	8511	8516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825564
113	NC_017395	TAA	2	6	8614	8619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825564
114	NC_017395	TAA	2	6	8728	8733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825564
115	NC_017395	CAA	2	6	8816	8821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825565
116	NC_017395	ATT	2	6	8844	8849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825565
117	NC_017395	ATT	2	6	9043	9048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825565
118	NC_017395	GAA	3	9	9219	9227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825565
119	NC_017395	TAA	2	6	9260	9265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825565
120	NC_017395	ATA	2	6	9299	9304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825565
121	NC_017395	AGG	2	6	9322	9327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825566
122	NC_017395	ACA	2	6	9341	9346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825566
123	NC_017395	TAA	2	6	9382	9387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825566
124	NC_017395	ATT	2	6	9391	9396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825566
125	NC_017395	CAA	2	6	9522	9527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825566
126	NC_017395	ATA	3	9	9537	9545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825566
127	NC_017395	GAA	2	6	9587	9592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825566
128	NC_017395	TAT	2	6	9658	9663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825566
129	NC_017395	AAT	2	6	9698	9703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825566
130	NC_017395	TAA	2	6	9774	9779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825566
131	NC_017395	TGA	2	6	9790	9795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825566
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133	NC_017395	AGA	2	6	9958	9963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825566
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.