MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp26

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017395	AC	3	6	412	417	50 %	0 %	0 %	50 %	387825556
2	NC_017395	TA	3	6	761	766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017395	AT	3	6	804	809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017395	TA	3	6	885	890	50 %	50 %	0 %	0 %	387825557
5	NC_017395	AT	3	6	1031	1036	50 %	50 %	0 %	0 %	387825557
6	NC_017395	AT	3	6	1963	1968	50 %	50 %	0 %	0 %	387825557
7	NC_017395	TA	3	6	2260	2265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017395	TA	3	6	2277	2282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017395	CT	3	6	2426	2431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017395	TC	3	6	3876	3881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017395	AT	3	6	3974	3979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017395	AT	3	6	4004	4009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017395	AT	3	6	4032	4037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017395	TA	3	6	4100	4105	50 %	50 %	0 %	0 %	387825559
15	NC_017395	CA	3	6	4271	4276	50 %	0 %	0 %	50 %	387825559
16	NC_017395	AT	3	6	5810	5815	50 %	50 %	0 %	0 %	387825561
17	NC_017395	CT	3	6	5948	5953	0 %	50 %	0 %	50 %	387825562
18	NC_017395	TA	3	6	5985	5990	50 %	50 %	0 %	0 %	387825562
19	NC_017395	AT	3	6	6548	6553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017395	TA	3	6	6653	6658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017395	CA	3	6	7116	7121	50 %	0 %	0 %	50 %	387825563
22	NC_017395	AT	3	6	7141	7146	50 %	50 %	0 %	0 %	387825563
23	NC_017395	AT	3	6	7153	7158	50 %	50 %	0 %	0 %	387825563
24	NC_017395	AT	3	6	7634	7639	50 %	50 %	0 %	0 %	387825563
25	NC_017395	CT	3	6	7955	7960	0 %	50 %	0 %	50 %	387825564
26	NC_017395	CA	3	6	8853	8858	50 %	0 %	0 %	50 %	387825565
27	NC_017395	AT	3	6	8929	8934	50 %	50 %	0 %	0 %	387825565
28	NC_017395	TA	4	8	9145	9152	50 %	50 %	0 %	0 %	387825565
29	NC_017395	AT	4	8	9480	9487	50 %	50 %	0 %	0 %	387825566
30	NC_017395	AT	3	6	10431	10436	50 %	50 %	0 %	0 %	387825567
31	NC_017395	TA	3	6	10727	10732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017395	TA	3	6	10739	10744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017395	AT	3	6	11587	11592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017395	AT	3	6	11963	11968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017395	AG	3	6	12979	12984	50 %	0 %	50 %	0 %	387825569
36	NC_017395	AT	3	6	13252	13257	50 %	50 %	0 %	0 %	387825569
37	NC_017395	GA	4	8	13424	13431	50 %	0 %	50 %	0 %	387825569
38	NC_017395	AT	3	6	15850	15855	50 %	50 %	0 %	0 %	387825571
39	NC_017395	AC	3	6	17331	17336	50 %	0 %	0 %	50 %	387825572
40	NC_017395	GA	3	6	18049	18054	50 %	0 %	50 %	0 %	387825573
41	NC_017395	AT	3	6	18245	18250	50 %	50 %	0 %	0 %	387825573
42	NC_017395	AT	3	6	18713	18718	50 %	50 %	0 %	0 %	387825573
43	NC_017395	AT	3	6	19427	19432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017395	AT	3	6	19710	19715	50 %	50 %	0 %	0 %	387825574
45	NC_017395	AT	3	6	20707	20712	50 %	50 %	0 %	0 %	387825574
46	NC_017395	AT	3	6	21228	21233	50 %	50 %	0 %	0 %	387825575
47	NC_017395	AT	3	6	21619	21624	50 %	50 %	0 %	0 %	387825576
48	NC_017395	TA	3	6	21979	21984	50 %	50 %	0 %	0 %	387825577
49	NC_017395	AT	3	6	22098	22103	50 %	50 %	0 %	0 %	387825577
50	NC_017395	TA	4	8	22124	22131	50 %	50 %	0 %	0 %	387825577
51	NC_017395	TA	3	6	22651	22656	50 %	50 %	0 %	0 %	387825578
52	NC_017395	TA	3	6	22881	22886	50 %	50 %	0 %	0 %	387825578
53	NC_017395	TA	3	6	23616	23621	50 %	50 %	0 %	0 %	387825579
54	NC_017395	TA	3	6	25209	25214	50 %	50 %	0 %	0 %	387825580
55	NC_017395	TC	3	6	25324	25329	0 %	50 %	0 %	50 %	387825580
56	NC_017395	AT	3	6	25702	25707	50 %	50 %	0 %	0 %	387825580
57	NC_017395	TA	3	6	25964	25969	50 %	50 %	0 %	0 %	387825580
58	NC_017395	AC	3	6	26001	26006	50 %	0 %	0 %	50 %	387825580

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.