MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-1+5

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017394	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825485
2	NC_017394	CTGATA	2	12	2959	2970	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825487
3	NC_017394	ATCAAG	2	12	3205	3216	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387825487
4	NC_017394	GAATTT	2	12	5183	5194	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387825489
5	NC_017394	TGAACT	2	12	5221	5232	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825489
6	NC_017394	AATGGA	2	12	6870	6881	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387825493
7	NC_017394	ACAGAA	2	12	13193	13204	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017394	TTGATA	2	12	14366	14377	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387825500
9	NC_017394	AGTTAA	2	12	15696	15707	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387825504
10	NC_017394	AATAAA	2	12	21796	21807	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387825511
11	NC_017394	TAGTGT	2	12	24971	24982	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017394	AAGTAA	2	12	26286	26297	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017394	CAAAAA	2	12	26332	26343	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017394	TTAATT	2	12	27812	27823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825515
15	NC_017394	TAGAAA	2	12	31236	31247	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017394	AAATGG	2	12	33028	33039	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387825520
17	NC_017394	CTGATA	2	12	33624	33635	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825521
18	NC_017394	ATCAAG	2	12	33870	33881	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387825521
19	NC_017394	GAATTT	2	12	35849	35860	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387825524
20	NC_017394	TGAACT	2	12	35887	35898	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825524
21	NC_017394	AATGGA	2	12	37536	37547	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017394	ACCTAA	2	12	40841	40852	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387825530
23	NC_017394	AATCAA	2	12	40863	40874	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387825530
24	NC_017394	TAGAAT	2	12	42565	42576	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017394	TTGATA	2	12	45592	45603	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387825535
26	NC_017394	AATGGT	2	12	46033	46044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825536
27	NC_017394	AGTTAA	2	12	46922	46933	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017394	ATACTA	2	12	47994	48005	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387825540
29	NC_017394	ATCAAA	2	12	51548	51559	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387825544
30	NC_017394	ACAAAT	2	12	53479	53490	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017394	ATATGT	2	12	53660	53671	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017394	TAGTGT	2	12	55154	55165	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387825547
33	NC_017394	AAGTAA	2	12	56488	56499	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017394	AATTGT	2	12	56834	56845	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017394	AAACAA	2	12	57340	57351	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387825550
36	NC_017394	AAACGA	2	12	57430	57441	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387825550
37	NC_017394	ATTAGA	2	12	58480	58491	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387825551
38	NC_017394	AAAGCA	2	12	59350	59361	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387825552

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.