MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-1+5

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017394	TCAT	2	8	4821	4828	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017394	AGGG	2	8	8237	8244	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017394	GTAA	2	8	9401	9408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017394	GAAA	2	8	9576	9583	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017394	GGTA	2	8	9802	9809	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017394	TTGA	2	8	10237	10244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017394	TATT	2	8	12585	12592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017394	TAAA	2	8	12675	12682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017394	TAAT	2	8	12933	12940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017394	AAAC	2	8	13511	13518	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017394	TATT	2	8	16002	16009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017394	ATCA	2	8	19189	19196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017394	ATTA	2	8	19304	19311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017394	AAGA	3	12	19794	19805	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017394	AATA	2	8	19921	19928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017394	GAAA	2	8	19987	19994	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017394	AAAT	2	8	20074	20081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017394	GAAA	2	8	20187	20194	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017394	TATT	2	8	23268	23275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017394	TATT	2	8	23421	23428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017394	TATT	2	8	23636	23643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017394	AAAT	2	8	24107	24114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017394	AGAT	2	8	24902	24909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017394	ATTA	2	8	25037	25044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017394	AAAT	2	8	26301	26308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017394	TATT	2	8	26638	26645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017394	TAAG	2	8	28562	28569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017394	ATTT	3	12	31211	31222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017394	TTAA	2	8	31583	31590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017394	AAGT	2	8	36707	36714	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017394	GAAA	2	8	37562	37569	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017394	AGAA	2	8	37862	37869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017394	GCTG	2	8	37976	37983	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017394	TCAA	2	8	42823	42830	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017394	AATT	2	8	43095	43102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017394	GTTT	2	8	43115	43122	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017394	AAAC	2	8	44738	44745	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017394	AGAA	2	8	44808	44815	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017394	GAAA	2	8	49799	49806	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017394	TATT	2	8	53606	53613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017394	TATT	2	8	53821	53828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017394	ATTA	2	8	55220	55227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017394	TGCA	2	8	56574	56581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017394	AAGA	2	8	56642	56649	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017394	TGTA	2	8	56695	56702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017394	TTAT	2	8	58077	58084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.