MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-1+5

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017394	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	387825485
2	NC_017394	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	387825485
3	NC_017394	GTTC	2	8	1677	1684	0 %	50 %	25 %	25 %	387825486
4	NC_017394	AATT	2	8	1893	1900	50 %	50 %	0 %	0 %	387825486
5	NC_017394	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	387825486
6	NC_017394	AAGA	2	8	2379	2386	75 %	0 %	25 %	0 %	387825487
7	NC_017394	ATTT	2	8	2515	2522	25 %	75 %	0 %	0 %	387825487
8	NC_017394	TGCT	2	8	2527	2534	0 %	50 %	25 %	25 %	387825487
9	NC_017394	ATGT	2	8	2989	2996	25 %	50 %	25 %	0 %	387825487
10	NC_017394	GTAT	2	8	3014	3021	25 %	50 %	25 %	0 %	387825487
11	NC_017394	ATAA	2	8	3096	3103	75 %	25 %	0 %	0 %	387825487
12	NC_017394	TAAT	2	8	3145	3152	50 %	50 %	0 %	0 %	387825487
13	NC_017394	CAAT	2	8	3178	3185	50 %	25 %	0 %	25 %	387825487
14	NC_017394	TTTA	2	8	3869	3876	25 %	75 %	0 %	0 %	387825488
15	NC_017394	GTAA	2	8	3907	3914	50 %	25 %	25 %	0 %	387825488
16	NC_017394	TTAC	2	8	5129	5136	25 %	50 %	0 %	25 %	387825489
17	NC_017394	AATG	2	8	5376	5383	50 %	25 %	25 %	0 %	387825489
18	NC_017394	AAGT	2	8	6041	6048	50 %	25 %	25 %	0 %	387825491
19	NC_017394	GAAA	2	8	6896	6903	75 %	0 %	25 %	0 %	387825493
20	NC_017394	AGAA	2	8	7196	7203	75 %	0 %	25 %	0 %	387825493
21	NC_017394	GCTG	2	8	7310	7317	0 %	25 %	50 %	25 %	387825493
22	NC_017394	ATTT	2	8	8473	8480	25 %	75 %	0 %	0 %	387825495
23	NC_017394	CTTG	2	8	8775	8782	0 %	50 %	25 %	25 %	387825496
24	NC_017394	AATT	2	8	8921	8928	50 %	50 %	0 %	0 %	387825496
25	NC_017394	CTTT	2	8	10629	10636	0 %	75 %	0 %	25 %	387825497
26	NC_017394	GGCA	2	8	11294	11301	25 %	0 %	50 %	25 %	387825498
27	NC_017394	TCAA	2	8	12099	12106	50 %	25 %	0 %	25 %	387825499
28	NC_017394	AATT	2	8	12372	12379	50 %	50 %	0 %	0 %	387825499
29	NC_017394	GTTT	2	8	12392	12399	0 %	75 %	25 %	0 %	387825499
30	NC_017394	TCTA	2	8	14130	14137	25 %	50 %	0 %	25 %	387825500
31	NC_017394	TCAA	2	8	15084	15091	50 %	25 %	0 %	25 %	387825502
32	NC_017394	AGGA	2	8	15156	15163	50 %	0 %	50 %	0 %	387825502
33	NC_017394	CTAT	2	8	15168	15175	25 %	50 %	0 %	25 %	387825502
34	NC_017394	AATA	2	8	15184	15191	75 %	25 %	0 %	0 %	387825502
35	NC_017394	TAAC	2	8	15238	15245	50 %	25 %	0 %	25 %	387825503
36	NC_017394	AGAT	2	8	16781	16788	50 %	25 %	25 %	0 %	387825506
37	NC_017394	TTGT	2	8	18287	18294	0 %	75 %	25 %	0 %	387825508
38	NC_017394	TTGA	2	8	20529	20536	25 %	50 %	25 %	0 %	387825509
39	NC_017394	AAAT	2	8	20761	20768	75 %	25 %	0 %	0 %	387825509
40	NC_017394	AACA	2	8	20882	20889	75 %	0 %	0 %	25 %	387825509
41	NC_017394	TTTA	2	8	20906	20913	25 %	75 %	0 %	0 %	387825509
42	NC_017394	TCAA	2	8	21026	21033	50 %	25 %	0 %	25 %	387825510
43	NC_017394	ATTA	2	8	21778	21785	50 %	50 %	0 %	0 %	387825511
44	NC_017394	AAAG	2	8	22217	22224	75 %	0 %	25 %	0 %	387825511
45	NC_017394	AGAT	2	8	22545	22552	50 %	25 %	25 %	0 %	387825512
46	NC_017394	ATAG	2	8	22829	22836	50 %	25 %	25 %	0 %	387825512
47	NC_017394	AAAT	2	8	25624	25631	75 %	25 %	0 %	0 %	387825513
48	NC_017394	TTTA	2	8	25655	25662	25 %	75 %	0 %	0 %	387825513
49	NC_017394	ACCA	2	8	26008	26015	50 %	0 %	0 %	50 %	387825513
50	NC_017394	AATT	2	8	26057	26064	50 %	50 %	0 %	0 %	387825513
51	NC_017394	GAAA	2	8	27086	27093	75 %	0 %	25 %	0 %	387825514
52	NC_017394	TAAA	2	8	27693	27700	75 %	25 %	0 %	0 %	387825515
53	NC_017394	ATTT	2	8	28170	28177	25 %	75 %	0 %	0 %	387825516
54	NC_017394	TAAA	2	8	29093	29100	75 %	25 %	0 %	0 %	387825517
55	NC_017394	CAAG	2	8	29118	29125	50 %	0 %	25 %	25 %	387825517
56	NC_017394	CAAA	2	8	29298	29305	75 %	0 %	0 %	25 %	387825518
57	NC_017394	AAAT	2	8	29336	29343	75 %	25 %	0 %	0 %	387825518
58	NC_017394	AATT	2	8	29387	29394	50 %	50 %	0 %	0 %	387825518
59	NC_017394	TAGC	2	8	29494	29501	25 %	25 %	25 %	25 %	387825518
60	NC_017394	TGAT	2	8	29701	29708	25 %	50 %	25 %	0 %	387825518
61	NC_017394	AGCA	2	8	30062	30069	50 %	0 %	25 %	25 %	387825518
62	NC_017394	AAAT	2	8	30088	30095	75 %	25 %	0 %	0 %	387825518
63	NC_017394	TTGC	2	8	32250	32257	0 %	50 %	25 %	25 %	387825519
64	NC_017394	GTTC	2	8	32315	32322	0 %	50 %	25 %	25 %	387825519
65	NC_017394	TGCT	2	8	33168	33175	0 %	50 %	25 %	25 %	387825520
66	NC_017394	ATGT	2	8	33654	33661	25 %	50 %	25 %	0 %	387825521
67	NC_017394	GTAT	2	8	33679	33686	25 %	50 %	25 %	0 %	387825521
68	NC_017394	ATAA	2	8	33761	33768	75 %	25 %	0 %	0 %	387825521
69	NC_017394	CAAT	2	8	33843	33850	50 %	25 %	0 %	25 %	387825521
70	NC_017394	TTTA	2	8	34535	34542	25 %	75 %	0 %	0 %	387825522
71	NC_017394	GTAA	2	8	34573	34580	50 %	25 %	25 %	0 %	387825522
72	NC_017394	TCAT	2	8	35487	35494	25 %	50 %	0 %	25 %	387825523
73	NC_017394	TTAC	2	8	35795	35802	25 %	50 %	0 %	25 %	387825524
74	NC_017394	AATG	2	8	36042	36049	50 %	25 %	25 %	0 %	387825524
75	NC_017394	ATTT	2	8	39140	39147	25 %	75 %	0 %	0 %	387825528
76	NC_017394	CTTG	2	8	39442	39449	0 %	50 %	25 %	25 %	387825529
77	NC_017394	AATT	2	8	39588	39595	50 %	50 %	0 %	0 %	387825529
78	NC_017394	AACG	2	8	40173	40180	50 %	0 %	25 %	25 %	387825530
79	NC_017394	CAAG	2	8	40278	40285	50 %	0 %	25 %	25 %	387825530
80	NC_017394	TAAC	2	8	40705	40712	50 %	25 %	0 %	25 %	387825530
81	NC_017394	TGGT	2	8	40795	40802	0 %	50 %	50 %	0 %	387825530
82	NC_017394	AGAA	2	8	41041	41048	75 %	0 %	25 %	0 %	387825531
83	NC_017394	CTTT	2	8	41352	41359	0 %	75 %	0 %	25 %	387825531
84	NC_017394	AGTT	2	8	41546	41553	25 %	50 %	25 %	0 %	387825531
85	NC_017394	GGCA	2	8	42017	42024	25 %	0 %	50 %	25 %	387825532
86	NC_017394	TAAT	2	8	43656	43663	50 %	50 %	0 %	0 %	387825534
87	NC_017394	TAAT	2	8	45274	45281	50 %	50 %	0 %	0 %	387825535
88	NC_017394	AATA	2	8	46275	46282	75 %	25 %	0 %	0 %	387825537
89	NC_017394	TCAA	2	8	46310	46317	50 %	25 %	0 %	25 %	387825537
90	NC_017394	AGGA	2	8	46382	46389	50 %	0 %	50 %	0 %	387825537
91	NC_017394	CTAT	2	8	46394	46401	25 %	50 %	0 %	25 %	387825537
92	NC_017394	AATA	2	8	46410	46417	75 %	25 %	0 %	0 %	387825537
93	NC_017394	TAAC	2	8	46464	46471	50 %	25 %	0 %	25 %	387825538
94	NC_017394	AGAT	2	8	47427	47434	50 %	25 %	25 %	0 %	387825539
95	NC_017394	TTGT	2	8	47953	47960	0 %	75 %	25 %	0 %	387825540
96	NC_017394	CAAA	2	8	48008	48015	75 %	0 %	0 %	25 %	387825540
97	NC_017394	TTGT	2	8	48905	48912	0 %	75 %	25 %	0 %	387825541
98	NC_017394	AAGA	3	12	50261	50272	75 %	0 %	25 %	0 %	387825542
99	NC_017394	AATA	2	8	50388	50395	75 %	25 %	0 %	0 %	387825542
100	NC_017394	GAAA	2	8	50454	50461	75 %	0 %	25 %	0 %	387825542
101	NC_017394	AAAT	2	8	50540	50547	75 %	25 %	0 %	0 %	387825542
102	NC_017394	GAAA	2	8	50653	50660	75 %	0 %	25 %	0 %	387825542
103	NC_017394	TTGA	2	8	50995	51002	25 %	50 %	25 %	0 %	387825543
104	NC_017394	AAAT	2	8	51227	51234	75 %	25 %	0 %	0 %	387825543
105	NC_017394	TTTA	2	8	51372	51379	25 %	75 %	0 %	0 %	387825543
106	NC_017394	GATA	2	8	51572	51579	50 %	25 %	25 %	0 %	387825544
107	NC_017394	TGGA	2	8	52214	52221	25 %	25 %	50 %	0 %	387825544
108	NC_017394	TAAA	2	8	52303	52310	75 %	25 %	0 %	0 %	387825545
109	NC_017394	AAAG	2	8	52620	52627	75 %	0 %	25 %	0 %	387825545
110	NC_017394	CAAA	2	8	52646	52653	75 %	0 %	0 %	25 %	387825545
111	NC_017394	TAAA	2	8	52883	52890	75 %	25 %	0 %	0 %	387825546
112	NC_017394	TAAT	2	8	52988	52995	50 %	50 %	0 %	0 %	387825546
113	NC_017394	ATAG	2	8	53041	53048	50 %	25 %	25 %	0 %	387825546
114	NC_017394	ATAG	2	8	53116	53123	50 %	25 %	25 %	0 %	387825546
115	NC_017394	ATAG	2	8	53149	53156	50 %	25 %	25 %	0 %	387825546
116	NC_017394	AGAT	2	8	53168	53175	50 %	25 %	25 %	0 %	387825546
117	NC_017394	ATAG	2	8	53203	53210	50 %	25 %	25 %	0 %	387825546
118	NC_017394	AGAT	2	8	53222	53229	50 %	25 %	25 %	0 %	387825546
119	NC_017394	GCAA	2	8	53284	53291	50 %	0 %	25 %	25 %	387825546
120	NC_017394	TAAG	2	8	53989	53996	50 %	25 %	25 %	0 %	387825547
121	NC_017394	AGAT	2	8	55085	55092	50 %	25 %	25 %	0 %	387825547
122	NC_017394	AAAT	2	8	55808	55815	75 %	25 %	0 %	0 %	387825549
123	NC_017394	TTTA	2	8	55839	55846	25 %	75 %	0 %	0 %	387825549
124	NC_017394	ACCA	2	8	56192	56199	50 %	0 %	0 %	50 %	387825549
125	NC_017394	AATT	2	8	56241	56248	50 %	50 %	0 %	0 %	387825549
126	NC_017394	TTTA	2	8	56364	56371	25 %	75 %	0 %	0 %	387825549
127	NC_017394	AAGA	2	8	57368	57375	75 %	0 %	25 %	0 %	387825550
128	NC_017394	TAAA	2	8	57722	57729	75 %	25 %	0 %	0 %	387825550
129	NC_017394	CAGT	2	8	57897	57904	25 %	25 %	25 %	25 %	387825550
130	NC_017394	AAGG	2	8	58376	58383	50 %	0 %	50 %	0 %	387825551
131	NC_017394	ATGA	2	8	58583	58590	50 %	25 %	25 %	0 %	387825551
132	NC_017394	AATT	2	8	58617	58624	50 %	50 %	0 %	0 %	387825551
133	NC_017394	TAAA	2	8	59194	59201	75 %	25 %	0 %	0 %	387825552
134	NC_017394	CAAG	2	8	59219	59226	50 %	0 %	25 %	25 %	387825552
135	NC_017394	AATT	2	8	59240	59247	50 %	50 %	0 %	0 %	387825552
136	NC_017394	CAAA	2	8	59399	59406	75 %	0 %	0 %	25 %	387825553
137	NC_017394	AAAT	2	8	59437	59444	75 %	25 %	0 %	0 %	387825553
138	NC_017394	AATT	2	8	59488	59495	50 %	50 %	0 %	0 %	387825553
139	NC_017394	TAGC	2	8	59595	59602	25 %	25 %	25 %	25 %	387825553
140	NC_017394	TGAT	2	8	59802	59809	25 %	50 %	25 %	0 %	387825553
141	NC_017394	AGCA	2	8	60163	60170	50 %	0 %	25 %	25 %	387825553
142	NC_017394	AAAT	2	8	60189	60196	75 %	25 %	0 %	0 %	387825553

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.