MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-1+5

Total Repeats: 633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017394	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825485
2	NC_017394	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825485
3	NC_017394	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825485
4	NC_017394	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825485
5	NC_017394	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825485
6	NC_017394	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825485
7	NC_017394	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825485
8	NC_017394	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825485
9	NC_017394	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825485
10	NC_017394	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825485
11	NC_017394	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825485
12	NC_017394	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825485
13	NC_017394	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825485
14	NC_017394	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825485
15	NC_017394	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825485
16	NC_017394	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825485
17	NC_017394	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825485
18	NC_017394	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825485
19	NC_017394	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825486
20	NC_017394	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825486
21	NC_017394	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825486
22	NC_017394	GCA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825486
23	NC_017394	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825486
24	NC_017394	ATT	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825486
25	NC_017394	CAA	2	6	2085	2090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825487
26	NC_017394	TGG	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825487
27	NC_017394	CAG	2	6	2168	2173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825487
28	NC_017394	GAG	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825487
29	NC_017394	AAC	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825487
30	NC_017394	TGG	3	9	2273	2281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825487
31	NC_017394	TGA	2	6	2591	2596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825487
32	NC_017394	GAA	2	6	2667	2672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825487
33	NC_017394	TAG	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825487
34	NC_017394	GTT	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825487
35	NC_017394	AGA	2	6	2864	2869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825487
36	NC_017394	TAG	2	6	3002	3007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825487
37	NC_017394	TTA	2	6	3112	3117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825487
38	NC_017394	TGG	3	9	3125	3133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825487
39	NC_017394	CCA	2	6	3135	3140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825487
40	NC_017394	TGG	2	6	3308	3313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825487
41	NC_017394	ATT	2	6	3363	3368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825488
42	NC_017394	ATC	2	6	3527	3532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825488
43	NC_017394	TGG	2	6	3624	3629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825488
44	NC_017394	GAT	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825488
45	NC_017394	AAT	2	6	3703	3708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825488
46	NC_017394	TAG	2	6	3722	3727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825488
47	NC_017394	TAA	2	6	3768	3773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825488
48	NC_017394	CAC	2	6	3803	3808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825488
49	NC_017394	GAA	3	9	4961	4969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825489
50	NC_017394	TTG	2	6	5003	5008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825489
51	NC_017394	GTT	2	6	5174	5179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825489
52	NC_017394	ATT	2	6	5235	5240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825489
53	NC_017394	TAG	2	6	5245	5250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825489
54	NC_017394	GAA	2	6	5261	5266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825489
55	NC_017394	TGT	2	6	5469	5474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825490
56	NC_017394	TTC	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825490
57	NC_017394	TTA	2	6	5543	5548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825490
58	NC_017394	TGG	2	6	5792	5797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825491
59	NC_017394	TAG	2	6	5873	5878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825491
60	NC_017394	AAT	2	6	5901	5906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825491
61	NC_017394	CTA	2	6	5994	5999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825491
62	NC_017394	GTA	2	6	6058	6063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825491
63	NC_017394	GCA	2	6	6069	6074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825491
64	NC_017394	TTG	2	6	6082	6087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825491
65	NC_017394	AAT	2	6	6209	6214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825492
66	NC_017394	ATC	2	6	6243	6248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825492
67	NC_017394	GCT	2	6	6269	6274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825492
68	NC_017394	ATA	2	6	6284	6289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825492
69	NC_017394	TAA	2	6	6526	6531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825492
70	NC_017394	AGG	2	6	6666	6671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825492
71	NC_017394	CAG	2	6	6731	6736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825493
72	NC_017394	ATT	2	6	6742	6747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825493
73	NC_017394	TGC	2	6	6797	6802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825493
74	NC_017394	TAA	2	6	6830	6835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825493
75	NC_017394	GAA	2	6	6948	6953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825493
76	NC_017394	TGT	2	6	7037	7042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825493
77	NC_017394	TTA	2	6	7045	7050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825493
78	NC_017394	GAT	2	6	7071	7076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825493
79	NC_017394	GAC	2	6	7095	7100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825493
80	NC_017394	TTG	2	6	7327	7332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825493
81	NC_017394	CTT	2	6	7383	7388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825493
82	NC_017394	AAG	2	6	7423	7428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825493
83	NC_017394	ATT	2	6	7494	7499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825493
84	NC_017394	TTA	2	6	7504	7509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825493
85	NC_017394	ATT	2	6	7635	7640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825493
86	NC_017394	TAC	2	6	7748	7753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825493
87	NC_017394	TGG	2	6	7846	7851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825494
88	NC_017394	ACA	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825494
89	NC_017394	TAG	2	6	7912	7917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825494
90	NC_017394	TAA	2	6	7938	7943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825494
91	NC_017394	TGA	2	6	8032	8037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825494
92	NC_017394	ATT	2	6	8114	8119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825494
93	NC_017394	AAG	2	6	8152	8157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825494
94	NC_017394	CTG	2	6	8163	8168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825494
95	NC_017394	ACA	2	6	8226	8231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825494
96	NC_017394	TTA	2	6	8247	8252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825495
97	NC_017394	TTA	2	6	8482	8487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825495
98	NC_017394	TTG	2	6	8499	8504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825495
99	NC_017394	AAT	2	6	8506	8511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825495
100	NC_017394	AAT	2	6	8591	8596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825495
101	NC_017394	TCA	2	6	8666	8671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825495
102	NC_017394	ATT	2	6	8804	8809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825496
103	NC_017394	AAT	2	6	10299	10304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825497
104	NC_017394	AAC	2	6	10358	10363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825497
105	NC_017394	GTT	2	6	10501	10506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825497
106	NC_017394	TAT	2	6	10527	10532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825497
107	NC_017394	AAC	2	6	10696	10701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825497
108	NC_017394	TAC	2	6	10891	10896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825498
109	NC_017394	GAA	2	6	10968	10973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825498
110	NC_017394	ATC	2	6	10986	10991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825498
111	NC_017394	CGA	2	6	11108	11113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825498
112	NC_017394	CCT	2	6	11202	11207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387825498
113	NC_017394	TTA	2	6	11259	11264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825498
114	NC_017394	CTT	2	6	11276	11281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825498
115	NC_017394	AAG	2	6	11302	11307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825498
116	NC_017394	AGG	2	6	11335	11340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825498
117	NC_017394	ATT	2	6	11403	11408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825498
118	NC_017394	AGA	2	6	11576	11581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825498
119	NC_017394	CAA	2	6	11604	11609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825498
120	NC_017394	GTA	2	6	11834	11839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825498
121	NC_017394	ACA	2	6	11982	11987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825499
122	NC_017394	AAG	2	6	11993	11998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825499
123	NC_017394	TAC	2	6	12092	12097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825499
124	NC_017394	CAT	2	6	12151	12156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825499
125	NC_017394	AAC	2	6	12252	12257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825499
126	NC_017394	AGG	2	6	12324	12329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825499
127	NC_017394	ACC	2	6	12364	12369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825499
128	NC_017394	TGA	2	6	13764	13769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825500
129	NC_017394	TGA	2	6	13788	13793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825500
130	NC_017394	AGA	2	6	13794	13799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825500
131	NC_017394	AAC	2	6	13840	13845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825500
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