MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-1+5

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017394	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387825485
2	NC_017394	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	387825485
3	NC_017394	GA	3	6	1739	1744	50 %	0 %	50 %	0 %	387825486
4	NC_017394	GT	3	6	2160	2165	0 %	50 %	50 %	0 %	387825487
5	NC_017394	GT	3	6	2298	2303	0 %	50 %	50 %	0 %	387825487
6	NC_017394	CA	3	6	2497	2502	50 %	0 %	0 %	50 %	387825487
7	NC_017394	TA	3	6	2939	2944	50 %	50 %	0 %	0 %	387825487
8	NC_017394	CT	3	6	3162	3167	0 %	50 %	0 %	50 %	387825487
9	NC_017394	TC	3	6	4286	4291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017394	TG	3	6	5360	5365	0 %	50 %	50 %	0 %	387825489
11	NC_017394	AG	3	6	5501	5506	50 %	0 %	50 %	0 %	387825490
12	NC_017394	AT	3	6	5894	5899	50 %	50 %	0 %	0 %	387825491
13	NC_017394	TA	3	6	5910	5915	50 %	50 %	0 %	0 %	387825491
14	NC_017394	AT	4	8	6386	6393	50 %	50 %	0 %	0 %	387825492
15	NC_017394	AC	3	6	7028	7033	50 %	0 %	0 %	50 %	387825493
16	NC_017394	TA	3	6	7476	7481	50 %	50 %	0 %	0 %	387825493
17	NC_017394	AG	3	6	9149	9154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017394	GA	3	6	9951	9956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017394	AT	3	6	10582	10587	50 %	50 %	0 %	0 %	387825497
20	NC_017394	TA	3	6	10615	10620	50 %	50 %	0 %	0 %	387825497
21	NC_017394	TA	4	8	10736	10743	50 %	50 %	0 %	0 %	387825497
22	NC_017394	AT	3	6	11139	11144	50 %	50 %	0 %	0 %	387825498
23	NC_017394	TA	3	6	11538	11543	50 %	50 %	0 %	0 %	387825498
24	NC_017394	CA	3	6	11672	11677	50 %	0 %	0 %	50 %	387825498
25	NC_017394	CA	3	6	12037	12042	50 %	0 %	0 %	50 %	387825499
26	NC_017394	TA	3	6	12160	12165	50 %	50 %	0 %	0 %	387825499
27	NC_017394	AT	3	6	12715	12720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017394	AT	3	6	13288	13293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017394	TA	3	6	14512	14517	50 %	50 %	0 %	0 %	387825500
30	NC_017394	AT	3	6	14531	14536	50 %	50 %	0 %	0 %	387825500
31	NC_017394	TA	3	6	14599	14604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017394	AT	3	6	14913	14918	50 %	50 %	0 %	0 %	387825502
33	NC_017394	AT	3	6	15323	15328	50 %	50 %	0 %	0 %	387825503
34	NC_017394	AT	3	6	15491	15496	50 %	50 %	0 %	0 %	387825503
35	NC_017394	AT	3	6	15796	15801	50 %	50 %	0 %	0 %	387825504
36	NC_017394	AT	3	6	16570	16575	50 %	50 %	0 %	0 %	387825506
37	NC_017394	AT	3	6	16814	16819	50 %	50 %	0 %	0 %	387825506
38	NC_017394	AT	3	6	16934	16939	50 %	50 %	0 %	0 %	387825506
39	NC_017394	CT	3	6	18503	18508	0 %	50 %	0 %	50 %	387825508
40	NC_017394	AT	3	6	18986	18991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017394	TA	3	6	20354	20359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017394	TA	3	6	20941	20946	50 %	50 %	0 %	0 %	387825509
43	NC_017394	TA	3	6	21190	21195	50 %	50 %	0 %	0 %	387825510
44	NC_017394	TA	3	6	21680	21685	50 %	50 %	0 %	0 %	387825510
45	NC_017394	AG	3	6	21934	21939	50 %	0 %	50 %	0 %	387825511
46	NC_017394	AT	3	6	22524	22529	50 %	50 %	0 %	0 %	387825512
47	NC_017394	AT	3	6	22578	22583	50 %	50 %	0 %	0 %	387825512
48	NC_017394	AT	3	6	22632	22637	50 %	50 %	0 %	0 %	387825512
49	NC_017394	AT	3	6	22686	22691	50 %	50 %	0 %	0 %	387825512
50	NC_017394	AT	3	6	22740	22745	50 %	50 %	0 %	0 %	387825512
51	NC_017394	AT	3	6	23029	23034	50 %	50 %	0 %	0 %	387825512
52	NC_017394	AT	5	10	23322	23331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017394	AT	5	10	23475	23484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017394	TA	3	6	23626	23631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017394	TA	3	6	24019	24024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017394	TA	3	6	24100	24105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017394	AT	3	6	24820	24825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017394	GA	3	6	25649	25654	50 %	0 %	50 %	0 %	387825513
59	NC_017394	CA	3	6	26436	26441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017394	AT	3	6	26465	26470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017394	TA	3	6	26612	26617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017394	AT	3	6	27806	27811	50 %	50 %	0 %	0 %	387825515
63	NC_017394	AT	3	6	28483	28488	50 %	50 %	0 %	0 %	387825516
64	NC_017394	TA	3	6	28579	28584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017394	AT	4	8	28608	28615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017394	TG	3	6	28827	28832	0 %	50 %	50 %	0 %	387825517
67	NC_017394	AT	3	6	29693	29698	50 %	50 %	0 %	0 %	387825518
68	NC_017394	AG	3	6	30597	30602	50 %	0 %	50 %	0 %	387825518
69	NC_017394	GT	3	6	30704	30709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017394	AT	3	6	31142	31147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017394	TA	3	6	33604	33609	50 %	50 %	0 %	0 %	387825521
72	NC_017394	GA	3	6	33745	33750	50 %	0 %	50 %	0 %	387825521
73	NC_017394	TC	3	6	34952	34957	0 %	50 %	0 %	50 %	387825523
74	NC_017394	TG	3	6	36026	36031	0 %	50 %	50 %	0 %	387825524
75	NC_017394	AG	3	6	36167	36172	50 %	0 %	50 %	0 %	387825525
76	NC_017394	AT	3	6	36560	36565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017394	TA	3	6	36576	36581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017394	AT	4	8	37052	37059	50 %	50 %	0 %	0 %	387825526
79	NC_017394	AT	3	6	37186	37191	50 %	50 %	0 %	0 %	387825526
80	NC_017394	AC	3	6	37694	37699	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017394	TA	3	6	38142	38147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017394	AG	3	6	39816	39821	50 %	0 %	50 %	0 %	387825530
83	NC_017394	AT	3	6	40481	40486	50 %	50 %	0 %	0 %	387825530
84	NC_017394	TA	3	6	41338	41343	50 %	50 %	0 %	0 %	387825531
85	NC_017394	AT	3	6	41653	41658	50 %	50 %	0 %	0 %	387825532
86	NC_017394	AT	3	6	41862	41867	50 %	50 %	0 %	0 %	387825532
87	NC_017394	TA	3	6	42261	42266	50 %	50 %	0 %	0 %	387825532
88	NC_017394	CA	3	6	42395	42400	50 %	0 %	0 %	50 %	387825532
89	NC_017394	CA	3	6	42761	42766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017394	TA	3	6	42884	42889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017394	AT	3	6	43438	43443	50 %	50 %	0 %	0 %	387825533
92	NC_017394	AT	3	6	43832	43837	50 %	50 %	0 %	0 %	387825534
93	NC_017394	AT	3	6	44517	44522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017394	TA	3	6	45738	45743	50 %	50 %	0 %	0 %	387825535
95	NC_017394	AT	3	6	45757	45762	50 %	50 %	0 %	0 %	387825535
96	NC_017394	TA	3	6	45825	45830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017394	AT	3	6	46139	46144	50 %	50 %	0 %	0 %	387825537
98	NC_017394	AT	3	6	46549	46554	50 %	50 %	0 %	0 %	387825538
99	NC_017394	AT	3	6	46717	46722	50 %	50 %	0 %	0 %	387825538
100	NC_017394	AT	3	6	47022	47027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017394	AT	3	6	47249	47254	50 %	50 %	0 %	0 %	387825539
102	NC_017394	AT	3	6	47460	47465	50 %	50 %	0 %	0 %	387825539
103	NC_017394	AT	3	6	47547	47552	50 %	50 %	0 %	0 %	387825539
104	NC_017394	TA	3	6	49453	49458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017394	TA	3	6	50820	50825	50 %	50 %	0 %	0 %	387825542
106	NC_017394	TA	3	6	51407	51412	50 %	50 %	0 %	0 %	387825543
107	NC_017394	AT	4	8	51655	51662	50 %	50 %	0 %	0 %	387825544
108	NC_017394	TA	3	6	51834	51839	50 %	50 %	0 %	0 %	387825544
109	NC_017394	TG	4	8	52151	52158	0 %	50 %	50 %	0 %	387825544
110	NC_017394	TA	3	6	52285	52290	50 %	50 %	0 %	0 %	387825545
111	NC_017394	AT	3	6	53093	53098	50 %	50 %	0 %	0 %	387825546
112	NC_017394	AT	3	6	53255	53260	50 %	50 %	0 %	0 %	387825546
113	NC_017394	TA	3	6	53410	53415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017394	TA	3	6	54202	54207	50 %	50 %	0 %	0 %	387825547
115	NC_017394	AG	3	6	54243	54248	50 %	0 %	50 %	0 %	387825547
116	NC_017394	AG	3	6	54699	54704	50 %	0 %	50 %	0 %	387825547
117	NC_017394	AT	3	6	55003	55008	50 %	50 %	0 %	0 %	387825547
118	NC_017394	AT	3	6	55392	55397	50 %	50 %	0 %	0 %	387825548
119	NC_017394	GA	3	6	55833	55838	50 %	0 %	50 %	0 %	387825549
120	NC_017394	TA	3	6	56087	56092	50 %	50 %	0 %	0 %	387825549
121	NC_017394	AT	3	6	56666	56671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017394	GA	3	6	56741	56746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017394	TA	3	6	56813	56818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017394	TA	4	8	57621	57628	50 %	50 %	0 %	0 %	387825550
125	NC_017394	CT	3	6	58088	58093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017394	TA	3	6	58140	58145	50 %	50 %	0 %	0 %	387825551
127	NC_017394	TG	3	6	58928	58933	0 %	50 %	50 %	0 %	387825552
128	NC_017394	AT	3	6	59270	59275	50 %	50 %	0 %	0 %	387825552
129	NC_017394	AT	3	6	59794	59799	50 %	50 %	0 %	0 %	387825553
130	NC_017394	TA	3	6	60111	60116	50 %	50 %	0 %	0 %	387825553
131	NC_017394	AG	3	6	60698	60703	50 %	0 %	50 %	0 %	387825553

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.