MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-11

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017393	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825445
2	NC_017393	AAATGG	2	12	2390	2401	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387825447
3	NC_017393	CTGATA	2	12	2986	2997	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825448
4	NC_017393	ATCAAG	2	12	3232	3243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387825448
5	NC_017393	GAATTT	2	12	5210	5221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387825451
6	NC_017393	TGAACT	2	12	5248	5259	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825451
7	NC_017393	AATGGA	2	12	6897	6908	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387825455
8	NC_017393	AAACCT	2	12	10244	10255	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387825459
9	NC_017393	TAAAAA	2	12	10357	10368	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387825460
10	NC_017393	CAAGCT	2	12	10826	10837	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387825460
11	NC_017393	TTGATA	2	12	14979	14990	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387825466
12	NC_017393	AATGGT	2	12	15420	15431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825467
13	NC_017393	AGTTAA	2	12	16310	16321	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387825469
14	NC_017393	TAATGA	2	12	17365	17376	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387825471
15	NC_017393	CAAAAA	2	12	17612	17623	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387825471
16	NC_017393	ACAAAT	2	12	23086	23097	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017393	TAGTGT	2	12	24738	24749	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017393	AAGTAA	2	12	26054	26065	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017393	CAAAAA	2	12	26100	26111	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017393	AAAGCA	2	12	28513	28524	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387825482

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.