MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-11

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017393	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	387825445
2	NC_017393	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	387825446
3	NC_017393	TGGCA	2	10	2330	2339	20 %	20 %	40 %	20 %	387825447
4	NC_017393	AATTA	2	10	2568	2577	60 %	40 %	0 %	0 %	387825447
5	NC_017393	TTCAA	2	10	4386	4395	40 %	40 %	0 %	20 %	387825450
6	NC_017393	CTGCA	2	10	7576	7585	20 %	20 %	20 %	40 %	387825455
7	NC_017393	AAGAA	2	10	9250	9259	80 %	0 %	20 %	0 %	387825459
8	NC_017393	GAAAA	2	10	10388	10397	80 %	0 %	20 %	0 %	387825460
9	NC_017393	TTAAA	2	10	11901	11910	60 %	40 %	0 %	0 %	387825461
10	NC_017393	TAAAG	2	10	11941	11950	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017393	AATCT	2	10	12302	12311	40 %	40 %	0 %	20 %	387825462
12	NC_017393	TACTT	2	10	13328	13337	20 %	60 %	0 %	20 %	387825464
13	NC_017393	GAAAA	2	10	13406	13415	80 %	0 %	20 %	0 %	387825464
14	NC_017393	AAAGT	2	10	13428	13437	60 %	20 %	20 %	0 %	387825464
15	NC_017393	ATTCA	2	10	14236	14245	40 %	40 %	0 %	20 %	387825465
16	NC_017393	AGACA	2	10	14536	14545	60 %	0 %	20 %	20 %	387825466
17	NC_017393	ATTAA	2	10	15270	15279	60 %	40 %	0 %	0 %	387825467
18	NC_017393	AGTAA	2	10	15908	15917	60 %	20 %	20 %	0 %	387825468
19	NC_017393	TCACT	2	10	16065	16074	20 %	40 %	0 %	40 %	387825468
20	NC_017393	TTGCT	2	10	16162	16171	0 %	60 %	20 %	20 %	387825469
21	NC_017393	TATGT	2	10	16272	16281	20 %	60 %	20 %	0 %	387825469
22	NC_017393	TTTAC	2	10	16517	16526	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017393	TGTAG	2	10	19232	19241	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017393	CACTA	2	10	19584	19593	40 %	20 %	0 %	40 %	387825473
25	NC_017393	TTTTA	2	10	23076	23085	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017393	CAATC	2	10	23282	23291	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017393	GAGTT	2	10	24377	24386	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017393	ATAAA	2	10	24822	24831	80 %	20 %	0 %	0 %	387825478
29	NC_017393	ATTAT	2	10	27459	27468	40 %	60 %	0 %	0 %	387825481

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.