MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-11

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017393	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	387825445
2	NC_017393	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	387825445
3	NC_017393	GTTC	2	8	1677	1684	0 %	50 %	25 %	25 %	387825446
4	NC_017393	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	387825446
5	NC_017393	TGCT	2	8	2530	2537	0 %	50 %	25 %	25 %	387825447
6	NC_017393	ATGT	2	8	3016	3023	25 %	50 %	25 %	0 %	387825448
7	NC_017393	GTAT	2	8	3041	3048	25 %	50 %	25 %	0 %	387825448
8	NC_017393	ATAA	2	8	3123	3130	75 %	25 %	0 %	0 %	387825448
9	NC_017393	TAAT	2	8	3172	3179	50 %	50 %	0 %	0 %	387825448
10	NC_017393	CAAT	2	8	3205	3212	50 %	25 %	0 %	25 %	387825448
11	NC_017393	TTTA	2	8	3896	3903	25 %	75 %	0 %	0 %	387825449
12	NC_017393	GTAA	2	8	3934	3941	50 %	25 %	25 %	0 %	387825449
13	NC_017393	TCAT	2	8	4848	4855	25 %	50 %	0 %	25 %	387825450
14	NC_017393	TTAC	2	8	5156	5163	25 %	50 %	0 %	25 %	387825451
15	NC_017393	AATG	2	8	5403	5410	50 %	25 %	25 %	0 %	387825451
16	NC_017393	AAAT	2	8	5544	5551	75 %	25 %	0 %	0 %	387825452
17	NC_017393	AAGT	2	8	6068	6075	50 %	25 %	25 %	0 %	387825453
18	NC_017393	GAAA	2	8	6923	6930	75 %	0 %	25 %	0 %	387825455
19	NC_017393	AGAA	2	8	7223	7230	75 %	0 %	25 %	0 %	387825455
20	NC_017393	TAGA	2	8	7648	7655	50 %	25 %	25 %	0 %	387825455
21	NC_017393	ATTT	2	8	8500	8507	25 %	75 %	0 %	0 %	387825457
22	NC_017393	TGAG	2	8	8604	8611	25 %	25 %	50 %	0 %	387825457
23	NC_017393	AAAT	2	8	8738	8745	75 %	25 %	0 %	0 %	387825458
24	NC_017393	GAAA	2	8	9565	9572	75 %	0 %	25 %	0 %	387825459
25	NC_017393	AGAA	2	8	10428	10435	75 %	0 %	25 %	0 %	387825460
26	NC_017393	TCAA	2	8	12208	12215	50 %	25 %	0 %	25 %	387825462
27	NC_017393	AATT	2	8	12481	12488	50 %	50 %	0 %	0 %	387825462
28	NC_017393	TATT	2	8	12694	12701	25 %	75 %	0 %	0 %	387825463
29	NC_017393	TAAT	2	8	13042	13049	50 %	50 %	0 %	0 %	387825464
30	NC_017393	AAAC	2	8	14124	14131	75 %	0 %	0 %	25 %	387825465
31	NC_017393	TAAT	2	8	14661	14668	50 %	50 %	0 %	0 %	387825466
32	NC_017393	TCTA	2	8	14743	14750	25 %	50 %	0 %	25 %	387825466
33	NC_017393	TAAC	2	8	15852	15859	50 %	25 %	0 %	25 %	387825468
34	NC_017393	AGAT	2	8	16848	16855	50 %	25 %	25 %	0 %	387825470
35	NC_017393	ATTG	2	8	17723	17730	25 %	50 %	25 %	0 %	387825471
36	NC_017393	CAAA	2	8	17745	17752	75 %	0 %	0 %	25 %	387825471
37	NC_017393	CTTG	2	8	18506	18513	0 %	50 %	25 %	25 %	387825472
38	NC_017393	AAGA	3	12	19865	19876	75 %	0 %	25 %	0 %	387825473
39	NC_017393	AATA	2	8	19992	19999	75 %	25 %	0 %	0 %	387825473
40	NC_017393	GAAA	2	8	20058	20065	75 %	0 %	25 %	0 %	387825473
41	NC_017393	AAAT	2	8	20144	20151	75 %	25 %	0 %	0 %	387825473
42	NC_017393	AACA	2	8	20952	20959	75 %	0 %	0 %	25 %	387825474
43	NC_017393	TTTA	2	8	20976	20983	25 %	75 %	0 %	0 %	387825474
44	NC_017393	TCAA	2	8	21096	21103	50 %	25 %	0 %	25 %	387825475
45	NC_017393	AAAT	2	8	21569	21576	75 %	25 %	0 %	0 %	387825475
46	NC_017393	TAAA	2	8	21703	21710	75 %	25 %	0 %	0 %	387825475
47	NC_017393	TATG	2	8	21752	21759	25 %	50 %	25 %	0 %	387825475
48	NC_017393	AAAG	2	8	22226	22233	75 %	0 %	25 %	0 %	387825476
49	NC_017393	AAAG	2	8	22295	22302	75 %	0 %	25 %	0 %	387825476
50	NC_017393	GAAT	2	8	25081	25088	50 %	25 %	25 %	0 %	387825478
51	NC_017393	AAAT	3	12	25392	25403	75 %	25 %	0 %	0 %	387825479
52	NC_017393	TTTA	2	8	25423	25430	25 %	75 %	0 %	0 %	387825479
53	NC_017393	ACCA	2	8	25776	25783	50 %	0 %	0 %	50 %	387825479
54	NC_017393	AATA	2	8	26711	26718	75 %	25 %	0 %	0 %	387825480
55	NC_017393	AAGA	2	8	26802	26809	75 %	0 %	25 %	0 %	387825480
56	NC_017393	TAAA	2	8	28357	28364	75 %	25 %	0 %	0 %	387825482
57	NC_017393	CAAG	2	8	28382	28389	50 %	0 %	25 %	25 %	387825482
58	NC_017393	AATT	2	8	28403	28410	50 %	50 %	0 %	0 %	387825482
59	NC_017393	CAAA	2	8	28562	28569	75 %	0 %	0 %	25 %	387825483
60	NC_017393	AAAT	2	8	28600	28607	75 %	25 %	0 %	0 %	387825483
61	NC_017393	AATT	2	8	28651	28658	50 %	50 %	0 %	0 %	387825483
62	NC_017393	TAGC	2	8	28758	28765	25 %	25 %	25 %	25 %	387825483
63	NC_017393	TGAT	2	8	28965	28972	25 %	50 %	25 %	0 %	387825483
64	NC_017393	AGCA	2	8	29326	29333	50 %	0 %	25 %	25 %	387825483
65	NC_017393	AAAT	2	8	29352	29359	75 %	25 %	0 %	0 %	387825483

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.