MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-11

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017393	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	387825445
2	NC_017393	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	387825445
3	NC_017393	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	387825445
4	NC_017393	T	6	6	1058	1063	0 %	100 %	0 %	0 %	387825445
5	NC_017393	A	6	6	1791	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	387825446
6	NC_017393	A	6	6	2049	2054	100 %	0 %	0 %	0 %	387825447
7	NC_017393	A	6	6	2763	2768	100 %	0 %	0 %	0 %	387825448
8	NC_017393	T	6	6	3505	3510	0 %	100 %	0 %	0 %	387825449
9	NC_017393	A	6	6	4404	4409	100 %	0 %	0 %	0 %	387825450
10	NC_017393	A	6	6	4514	4519	100 %	0 %	0 %	0 %	387825450
11	NC_017393	A	7	7	4959	4965	100 %	0 %	0 %	0 %	387825451
12	NC_017393	A	6	6	5231	5236	100 %	0 %	0 %	0 %	387825451
13	NC_017393	G	6	6	5302	5307	0 %	0 %	100 %	0 %	387825451
14	NC_017393	A	6	6	6928	6933	100 %	0 %	0 %	0 %	387825455
15	NC_017393	T	6	6	6959	6964	0 %	100 %	0 %	0 %	387825455
16	NC_017393	A	6	6	7031	7036	100 %	0 %	0 %	0 %	387825455
17	NC_017393	T	7	7	7154	7160	0 %	100 %	0 %	0 %	387825455
18	NC_017393	A	6	6	7508	7513	100 %	0 %	0 %	0 %	387825455
19	NC_017393	A	6	6	8238	8243	100 %	0 %	0 %	0 %	387825456
20	NC_017393	A	6	6	8581	8586	100 %	0 %	0 %	0 %	387825457
21	NC_017393	A	6	6	8787	8792	100 %	0 %	0 %	0 %	387825458
22	NC_017393	A	6	6	9028	9033	100 %	0 %	0 %	0 %	387825459
23	NC_017393	A	6	6	9080	9085	100 %	0 %	0 %	0 %	387825459
24	NC_017393	A	6	6	9115	9120	100 %	0 %	0 %	0 %	387825459
25	NC_017393	A	6	6	9137	9142	100 %	0 %	0 %	0 %	387825459
26	NC_017393	A	6	6	9476	9481	100 %	0 %	0 %	0 %	387825459
27	NC_017393	A	6	6	9500	9505	100 %	0 %	0 %	0 %	387825459
28	NC_017393	A	6	6	9682	9687	100 %	0 %	0 %	0 %	387825459
29	NC_017393	G	6	6	9886	9891	0 %	0 %	100 %	0 %	387825459
30	NC_017393	A	7	7	10319	10325	100 %	0 %	0 %	0 %	387825460
31	NC_017393	A	6	6	10394	10399	100 %	0 %	0 %	0 %	387825460
32	NC_017393	A	6	6	10407	10412	100 %	0 %	0 %	0 %	387825460
33	NC_017393	T	6	6	10504	10509	0 %	100 %	0 %	0 %	387825460
34	NC_017393	T	6	6	10562	10567	0 %	100 %	0 %	0 %	387825460
35	NC_017393	A	6	6	10989	10994	100 %	0 %	0 %	0 %	387825460
36	NC_017393	A	7	7	11280	11286	100 %	0 %	0 %	0 %	387825461
37	NC_017393	A	6	6	12093	12098	100 %	0 %	0 %	0 %	387825462
38	NC_017393	A	6	6	12151	12156	100 %	0 %	0 %	0 %	387825462
39	NC_017393	A	7	7	12430	12436	100 %	0 %	0 %	0 %	387825462
40	NC_017393	A	6	6	12741	12746	100 %	0 %	0 %	0 %	387825463
41	NC_017393	T	8	8	12832	12839	0 %	100 %	0 %	0 %	387825463
42	NC_017393	T	7	7	13062	13068	0 %	100 %	0 %	0 %	387825464
43	NC_017393	T	6	6	13557	13562	0 %	100 %	0 %	0 %	387825464
44	NC_017393	A	8	8	13665	13672	100 %	0 %	0 %	0 %	387825464
45	NC_017393	A	6	6	13750	13755	100 %	0 %	0 %	0 %	387825464
46	NC_017393	T	6	6	13938	13943	0 %	100 %	0 %	0 %	387825465
47	NC_017393	A	6	6	14176	14181	100 %	0 %	0 %	0 %	387825465
48	NC_017393	G	6	6	14362	14367	0 %	0 %	100 %	0 %	387825465
49	NC_017393	T	6	6	14518	14523	0 %	100 %	0 %	0 %	387825466
50	NC_017393	A	6	6	14793	14798	100 %	0 %	0 %	0 %	387825466
51	NC_017393	A	7	7	15054	15060	100 %	0 %	0 %	0 %	387825466
52	NC_017393	A	6	6	15132	15137	100 %	0 %	0 %	0 %	387825466
53	NC_017393	A	6	6	15256	15261	100 %	0 %	0 %	0 %	387825467
54	NC_017393	A	7	7	15450	15456	100 %	0 %	0 %	0 %	387825467
55	NC_017393	T	6	6	15922	15927	0 %	100 %	0 %	0 %	387825468
56	NC_017393	A	7	7	16428	16434	100 %	0 %	0 %	0 %	387825469
57	NC_017393	A	6	6	17383	17388	100 %	0 %	0 %	0 %	387825471
58	NC_017393	A	6	6	17414	17419	100 %	0 %	0 %	0 %	387825471
59	NC_017393	A	6	6	17454	17459	100 %	0 %	0 %	0 %	387825471
60	NC_017393	A	6	6	17481	17486	100 %	0 %	0 %	0 %	387825471
61	NC_017393	A	8	8	17732	17739	100 %	0 %	0 %	0 %	387825471
62	NC_017393	T	6	6	18154	18159	0 %	100 %	0 %	0 %	387825472
63	NC_017393	T	6	6	18284	18289	0 %	100 %	0 %	0 %	387825472
64	NC_017393	T	8	8	18390	18397	0 %	100 %	0 %	0 %	387825472
65	NC_017393	T	7	7	18439	18445	0 %	100 %	0 %	0 %	387825472
66	NC_017393	T	6	6	18476	18481	0 %	100 %	0 %	0 %	387825472
67	NC_017393	A	6	6	19507	19512	100 %	0 %	0 %	0 %	387825473
68	NC_017393	A	6	6	19711	19716	100 %	0 %	0 %	0 %	387825473
69	NC_017393	A	6	6	19755	19760	100 %	0 %	0 %	0 %	387825473
70	NC_017393	A	7	7	20028	20034	100 %	0 %	0 %	0 %	387825473
71	NC_017393	A	7	7	20043	20049	100 %	0 %	0 %	0 %	387825473
72	NC_017393	A	8	8	20069	20076	100 %	0 %	0 %	0 %	387825473
73	NC_017393	A	6	6	20104	20109	100 %	0 %	0 %	0 %	387825473
74	NC_017393	A	7	7	20334	20340	100 %	0 %	0 %	0 %	387825473
75	NC_017393	A	6	6	20454	20459	100 %	0 %	0 %	0 %	387825473
76	NC_017393	A	7	7	20462	20468	100 %	0 %	0 %	0 %	387825473
77	NC_017393	A	6	6	20550	20555	100 %	0 %	0 %	0 %	387825474
78	NC_017393	A	6	6	20677	20682	100 %	0 %	0 %	0 %	387825474
79	NC_017393	T	6	6	20783	20788	0 %	100 %	0 %	0 %	387825474
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81	NC_017393	T	6	6	20906	20911	0 %	100 %	0 %	0 %	387825474
82	NC_017393	A	7	7	20944	20950	100 %	0 %	0 %	0 %	387825474
83	NC_017393	A	6	6	21028	21033	100 %	0 %	0 %	0 %	387825474
84	NC_017393	A	6	6	21069	21074	100 %	0 %	0 %	0 %	387825474
85	NC_017393	A	9	9	21155	21163	100 %	0 %	0 %	0 %	387825475
86	NC_017393	A	6	6	21294	21299	100 %	0 %	0 %	0 %	387825475
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90	NC_017393	T	6	6	21783	21788	0 %	100 %	0 %	0 %	387825475
91	NC_017393	A	6	6	21989	21994	100 %	0 %	0 %	0 %	387825476
92	NC_017393	A	6	6	22093	22098	100 %	0 %	0 %	0 %	387825476
93	NC_017393	A	6	6	22244	22249	100 %	0 %	0 %	0 %	387825476
94	NC_017393	A	6	6	22474	22479	100 %	0 %	0 %	0 %	387825477
95	NC_017393	A	6	6	22812	22817	100 %	0 %	0 %	0 %	387825477
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99	NC_017393	A	6	6	25697	25702	100 %	0 %	0 %	0 %	387825479
100	NC_017393	T	6	6	25882	25887	0 %	100 %	0 %	0 %	387825479
101	NC_017393	T	6	6	25901	25906	0 %	100 %	0 %	0 %	387825479
102	NC_017393	A	7	7	26457	26463	100 %	0 %	0 %	0 %	387825480
103	NC_017393	A	8	8	26579	26586	100 %	0 %	0 %	0 %	387825480
104	NC_017393	A	7	7	26600	26606	100 %	0 %	0 %	0 %	387825480
105	NC_017393	A	7	7	26730	26736	100 %	0 %	0 %	0 %	387825480
106	NC_017393	A	8	8	26774	26781	100 %	0 %	0 %	0 %	387825480
107	NC_017393	A	6	6	26846	26851	100 %	0 %	0 %	0 %	387825480
108	NC_017393	A	6	6	26853	26858	100 %	0 %	0 %	0 %	387825480
109	NC_017393	A	7	7	26867	26873	100 %	0 %	0 %	0 %	387825480
110	NC_017393	A	6	6	27120	27125	100 %	0 %	0 %	0 %	387825480
111	NC_017393	A	6	6	27328	27333	100 %	0 %	0 %	0 %	387825481
112	NC_017393	A	7	7	27378	27384	100 %	0 %	0 %	0 %	387825481
113	NC_017393	A	6	6	27478	27483	100 %	0 %	0 %	0 %	387825481
114	NC_017393	A	6	6	27990	27995	100 %	0 %	0 %	0 %	387825482
115	NC_017393	A	8	8	28374	28381	100 %	0 %	0 %	0 %	387825482
116	NC_017393	A	6	6	28485	28490	100 %	0 %	0 %	0 %	387825482
117	NC_017393	A	7	7	28695	28701	100 %	0 %	0 %	0 %	387825483
118	NC_017393	A	7	7	28731	28737	100 %	0 %	0 %	0 %	387825483
119	NC_017393	A	6	6	29726	29731	100 %	0 %	0 %	0 %	387825483

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.