MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Erwinia pyrifoliae DSM 12163 plasmid pEP36

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017392	AGCG	2	8	1757	1764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017392	TGGC	2	8	2465	2472	0 %	25 %	50 %	25 %	387869344
3	NC_017392	TCAA	2	8	3159	3166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017392	TTTC	2	8	3340	3347	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017392	GACA	2	8	3515	3522	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017392	TACC	2	8	5848	5855	25 %	25 %	0 %	50 %	387869347
7	NC_017392	AGGA	2	8	6126	6133	50 %	0 %	50 %	0 %	387869347
8	NC_017392	TGCG	2	8	6205	6212	0 %	25 %	50 %	25 %	387869347
9	NC_017392	TCAG	2	8	6595	6602	25 %	25 %	25 %	25 %	387869348
10	NC_017392	CCAG	2	8	6653	6660	25 %	0 %	25 %	50 %	387869348
11	NC_017392	CCCG	2	8	6710	6717	0 %	0 %	25 %	75 %	387869348
12	NC_017392	GCTG	2	8	8317	8324	0 %	25 %	50 %	25 %	387869349
13	NC_017392	TGGA	2	8	8960	8967	25 %	25 %	50 %	0 %	387869349
14	NC_017392	TTGA	2	8	9490	9497	25 %	50 %	25 %	0 %	387869350
15	NC_017392	ACAG	2	8	9543	9550	50 %	0 %	25 %	25 %	387869350
16	NC_017392	TAAT	2	8	9579	9586	50 %	50 %	0 %	0 %	387869350
17	NC_017392	GCTG	2	8	9858	9865	0 %	25 %	50 %	25 %	387869350
18	NC_017392	GCTG	2	8	9963	9970	0 %	25 %	50 %	25 %	387869350
19	NC_017392	ATAC	2	8	10471	10478	50 %	25 %	0 %	25 %	387869351
20	NC_017392	AAGC	2	8	10905	10912	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017392	TTTA	2	8	11032	11039	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017392	TGCT	2	8	13271	13278	0 %	50 %	25 %	25 %	387869356
23	NC_017392	ATCG	2	8	14127	14134	25 %	25 %	25 %	25 %	387869357
24	NC_017392	CTGC	2	8	15176	15183	0 %	25 %	25 %	50 %	387869358
25	NC_017392	ATCG	2	8	15426	15433	25 %	25 %	25 %	25 %	387869359
26	NC_017392	CCCG	2	8	16318	16325	0 %	0 %	25 %	75 %	387869360
27	NC_017392	AAGT	2	8	17037	17044	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017392	AATT	2	8	17047	17054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017392	TACG	2	8	17085	17092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017392	TGAT	2	8	17270	17277	25 %	50 %	25 %	0 %	387869361
31	NC_017392	TAAA	2	8	17990	17997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017392	AGCA	2	8	18038	18045	50 %	0 %	25 %	25 %	387869362
33	NC_017392	TTGC	2	8	18392	18399	0 %	50 %	25 %	25 %	387869362
34	NC_017392	ACCA	2	8	18854	18861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017392	GGTA	2	8	19254	19261	25 %	25 %	50 %	0 %	387869363
36	NC_017392	GCAG	2	8	19367	19374	25 %	0 %	50 %	25 %	387869363
37	NC_017392	TTCA	2	8	19957	19964	25 %	50 %	0 %	25 %	387869363
38	NC_017392	CCAC	2	8	20100	20107	25 %	0 %	0 %	75 %	387869363
39	NC_017392	CGAA	2	8	20557	20564	50 %	0 %	25 %	25 %	387869363
40	NC_017392	CAGC	2	8	20901	20908	25 %	0 %	25 %	50 %	387869363
41	NC_017392	ATTG	2	8	21313	21320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017392	CTCC	2	8	21755	21762	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_017392	AAAT	2	8	21848	21855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017392	AGGC	2	8	22570	22577	25 %	0 %	50 %	25 %	387869364
45	NC_017392	GTTT	2	8	24518	24525	0 %	75 %	25 %	0 %	387869368
46	NC_017392	ACTG	2	8	24949	24956	25 %	25 %	25 %	25 %	387869368
47	NC_017392	TATC	2	8	25162	25169	25 %	50 %	0 %	25 %	387869369
48	NC_017392	TAAT	2	8	25215	25222	50 %	50 %	0 %	0 %	387869369
49	NC_017392	CGGG	2	8	25656	25663	0 %	0 %	75 %	25 %	387869370
50	NC_017392	TGGC	2	8	26176	26183	0 %	25 %	50 %	25 %	387869370
51	NC_017392	AGGG	2	8	26551	26558	25 %	0 %	75 %	0 %	387869370
52	NC_017392	CCAG	2	8	26774	26781	25 %	0 %	25 %	50 %	387869370
53	NC_017392	GGAA	2	8	27022	27029	50 %	0 %	50 %	0 %	387869370
54	NC_017392	CGGG	2	8	27948	27955	0 %	0 %	75 %	25 %	387869370
55	NC_017392	GAAC	2	8	28744	28751	50 %	0 %	25 %	25 %	387869371
56	NC_017392	GACG	2	8	28756	28763	25 %	0 %	50 %	25 %	387869371
57	NC_017392	CAGC	2	8	29623	29630	25 %	0 %	25 %	50 %	387869373
58	NC_017392	CTTG	2	8	30355	30362	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017392	GCAT	2	8	30454	30461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017392	TCAC	2	8	31338	31345	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017392	ATTA	2	8	31637	31644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017392	AGAA	2	8	31746	31753	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017392	ACAG	2	8	32012	32019	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017392	TAAC	2	8	32208	32215	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017392	CCAC	2	8	32748	32755	25 %	0 %	0 %	75 %	387869377
66	NC_017392	GTTG	2	8	33290	33297	0 %	50 %	50 %	0 %	387869378
67	NC_017392	GAAA	2	8	33656	33663	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017392	TCAT	2	8	33711	33718	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017392	CATC	2	8	33890	33897	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017392	CGTA	2	8	34041	34048	25 %	25 %	25 %	25 %	387869379
71	NC_017392	TCGA	2	8	34294	34301	25 %	25 %	25 %	25 %	387869379
72	NC_017392	TTCG	2	8	34699	34706	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017392	TACT	2	8	35108	35115	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017392	GAAT	2	8	35390	35397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017392	AGTC	2	8	35461	35468	25 %	25 %	25 %	25 %	387869381
76	NC_017392	ATCG	2	8	35728	35735	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017392	GCTG	2	8	35791	35798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.