MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Erwinia pyrifoliae DSM 12163 plasmid pEP36

Total Repeats: 429

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017392	AGT	2	6	33	38	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869342
2	NC_017392	CCT	2	6	51	56	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387869342
3	NC_017392	CAG	2	6	123	128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869342
4	NC_017392	CAG	2	6	333	338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869342
5	NC_017392	TGA	2	6	339	344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869342
6	NC_017392	TGA	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869342
7	NC_017392	ATT	2	6	1105	1110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017392	GGC	2	6	1121	1126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017392	GTA	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017392	AGT	2	6	1179	1184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017392	AAC	2	6	1191	1196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017392	GTT	2	6	1209	1214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017392	TTG	2	6	1276	1281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387869343
14	NC_017392	GGC	2	6	1284	1289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869343
15	NC_017392	CTG	2	6	1413	1418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869343
16	NC_017392	GGT	2	6	1446	1451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387869343
17	NC_017392	GAT	2	6	1452	1457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869343
18	NC_017392	CCA	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017392	CAA	2	6	1840	1845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017392	TCA	2	6	2054	2059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387869344
21	NC_017392	CGA	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869344
22	NC_017392	TCG	2	6	2220	2225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869344
23	NC_017392	TAT	2	6	2623	2628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387869344
24	NC_017392	CGG	2	6	2686	2691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869344
25	NC_017392	AGA	2	6	2719	2724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387869344
26	NC_017392	GGC	2	6	2725	2730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869344
27	NC_017392	TTC	2	6	2825	2830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387869344
28	NC_017392	GAC	2	6	2936	2941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869344
29	NC_017392	GGC	2	6	3012	3017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869344
30	NC_017392	TAT	2	6	3034	3039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387869344
31	NC_017392	CAG	2	6	3149	3154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017392	GTC	2	6	3203	3208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017392	CTT	2	6	3435	3440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017392	GTC	2	6	3707	3712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017392	CAG	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017392	ATT	2	6	3873	3878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017392	TCT	2	6	3911	3916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017392	TTA	2	6	3962	3967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017392	CAC	2	6	4151	4156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017392	GCC	2	6	4246	4251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017392	TCA	2	6	4357	4362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387869346
42	NC_017392	CTG	2	6	4424	4429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869346
43	NC_017392	TCT	2	6	4492	4497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387869346
44	NC_017392	ACT	2	6	4549	4554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387869346
45	NC_017392	ACT	2	6	4921	4926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017392	ACG	2	6	5020	5025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017392	CCG	2	6	5072	5077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017392	GAT	2	6	5107	5112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017392	ACA	2	6	5228	5233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017392	ATT	2	6	5362	5367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017392	TTA	2	6	5423	5428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017392	CGC	2	6	5435	5440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017392	TTG	2	6	5481	5486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387869347
54	NC_017392	CAC	2	6	5524	5529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387869347
55	NC_017392	GCC	2	6	5552	5557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387869347
56	NC_017392	CTT	2	6	5563	5568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387869347
57	NC_017392	ATA	2	6	5618	5623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387869347
58	NC_017392	CCA	2	6	5779	5784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387869347
59	NC_017392	ATT	2	6	5864	5869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387869347
60	NC_017392	TCA	2	6	6346	6351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387869347
61	NC_017392	AGG	2	6	6404	6409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017392	CGG	2	6	6927	6932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869348
63	NC_017392	CAA	2	6	7013	7018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387869348
64	NC_017392	TTC	2	6	7320	7325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387869348
65	NC_017392	TCT	2	6	7470	7475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017392	TTA	2	6	7476	7481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017392	AAT	2	6	7495	7500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017392	ATG	2	6	7586	7591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869349
69	NC_017392	TCT	2	6	7601	7606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387869349
70	NC_017392	GCT	2	6	7753	7758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869349
71	NC_017392	CAG	2	6	7784	7789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869349
72	NC_017392	GAT	2	6	7807	7812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869349
73	NC_017392	TGC	2	6	8016	8021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869349
74	NC_017392	GCG	2	6	8022	8027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869349
75	NC_017392	CTG	2	6	8039	8044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869349
76	NC_017392	TGC	2	6	8100	8105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869349
77	NC_017392	GGT	2	6	8149	8154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387869349
78	NC_017392	TGC	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869349
79	NC_017392	GCG	2	6	8240	8245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869349
80	NC_017392	TGC	2	6	8338	8343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869349
81	NC_017392	CAT	2	6	8407	8412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387869349
82	NC_017392	CTG	2	6	8585	8590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869349
83	NC_017392	CGG	2	6	8593	8598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869349
84	NC_017392	TAT	2	6	8624	8629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387869349
85	NC_017392	CGG	2	6	8767	8772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869349
86	NC_017392	CGG	2	6	8830	8835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869349
87	NC_017392	TTA	2	6	8841	8846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387869349
88	NC_017392	TGG	2	6	8881	8886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387869349
89	NC_017392	GAA	2	6	8890	8895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387869349
90	NC_017392	CTC	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017392	CTG	2	6	9076	9081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017392	CTG	2	6	9111	9116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017392	GAT	2	6	9125	9130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017392	CGG	2	6	9185	9190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017392	TCC	2	6	9241	9246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017392	TCT	2	6	9266	9271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017392	CGG	2	6	9279	9284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869350
98	NC_017392	CCA	2	6	9369	9374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387869350
99	NC_017392	CGC	2	6	9457	9462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387869350
100	NC_017392	CCA	2	6	9537	9542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387869350
101	NC_017392	GGC	2	6	9601	9606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869350
102	NC_017392	CGG	2	6	9639	9644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869350
103	NC_017392	CAA	2	6	9645	9650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387869350
104	NC_017392	CCG	2	6	9693	9698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387869350
105	NC_017392	TGA	2	6	9747	9752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869350
106	NC_017392	TTC	2	6	9764	9769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387869350
107	NC_017392	TGG	2	6	9792	9797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387869350
108	NC_017392	GTT	2	6	9909	9914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387869350
109	NC_017392	TGG	2	6	9918	9923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387869350
110	NC_017392	CTG	2	6	9931	9936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869350
111	NC_017392	TTC	2	6	9952	9957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387869350
112	NC_017392	TGC	2	6	10026	10031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869350
113	NC_017392	CAG	2	6	10084	10089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869350
114	NC_017392	TGC	2	6	10103	10108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869350
115	NC_017392	CCT	2	6	10136	10141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387869350
116	NC_017392	CCT	2	6	10155	10160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387869350
117	NC_017392	TGC	3	9	10162	10170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869350
118	NC_017392	CAA	2	6	10242	10247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017392	AAT	2	6	10267	10272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017392	GAT	2	6	10479	10484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869351
121	NC_017392	GAC	2	6	10500	10505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869351
122	NC_017392	ATC	2	6	10620	10625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387869351
123	NC_017392	GTG	2	6	10725	10730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387869351
124	NC_017392	AAG	2	6	10767	10772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387869351
125	NC_017392	ATT	2	6	10776	10781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387869351
126	NC_017392	AAG	2	6	11141	11146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017392	AGC	2	6	11150	11155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017392	GAA	2	6	11201	11206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017392	GAA	2	6	11271	11276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017392	GAT	2	6	11334	11339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869352
131	NC_017392	AAC	2	6	11349	11354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387869352
132	NC_017392	AGC	2	6	11493	11498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869352
133	NC_017392	CGG	2	6	11707	11712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869352
134	NC_017392	TGA	2	6	11731	11736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869352
135	NC_017392	CGT	2	6	11792	11797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869353
136	NC_017392	CGC	2	6	11937	11942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387869353
137	NC_017392	ATC	2	6	11986	11991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387869353
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141	NC_017392	CAT	2	6	12163	12168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017392	TCG	2	6	12246	12251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017392	GTC	2	6	12328	12333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869354
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152	NC_017392	CGT	2	6	13487	13492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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257	NC_017392	TCC	2	6	21263	21268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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261	NC_017392	CGC	2	6	21546	21551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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385	NC_017392	ATT	2	6	31445	31450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
386	NC_017392	GCC	2	6	31554	31559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
387	NC_017392	GCA	2	6	31832	31837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
388	NC_017392	CCG	2	6	31884	31889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
389	NC_017392	TTC	2	6	31940	31945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
390	NC_017392	CGC	2	6	32036	32041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
391	NC_017392	CAG	2	6	32096	32101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
392	NC_017392	AAC	2	6	32234	32239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
393	NC_017392	TCA	2	6	32285	32290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
394	NC_017392	TCA	2	6	32314	32319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
395	NC_017392	ACG	2	6	32358	32363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869376
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397	NC_017392	ATC	2	6	32487	32492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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417	NC_017392	CTT	2	6	35021	35026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
418	NC_017392	TTC	2	6	35076	35081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
419	NC_017392	CAT	2	6	35156	35161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_017392	GAA	2	6	35203	35208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
421	NC_017392	CAT	2	6	35220	35225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_017392	AAT	2	6	35246	35251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_017392	TAT	2	6	35357	35362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_017392	CTC	2	6	35755	35760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
428	NC_017392	ATG	2	6	35826	35831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
429	NC_017392	AAT	2	6	35876	35881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.