MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Erwinia pyrifoliae DSM 12163 plasmid pEP36

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017392	ATT	2	6	1105	1110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017392	GGC	2	6	1121	1126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017392	GTA	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017392	AGT	2	6	1179	1184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017392	AAC	2	6	1191	1196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017392	GTT	2	6	1209	1214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017392	CCA	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017392	CAA	2	6	1840	1845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017392	CAG	2	6	3149	3154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017392	GTC	2	6	3203	3208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017392	CTT	2	6	3435	3440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017392	GTC	2	6	3707	3712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017392	CAG	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017392	ATT	2	6	3873	3878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017392	TCT	2	6	3911	3916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017392	TTA	2	6	3962	3967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017392	CAC	2	6	4151	4156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017392	GCC	2	6	4246	4251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017392	ACT	2	6	4921	4926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017392	ACG	2	6	5020	5025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017392	CCG	2	6	5072	5077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017392	GAT	2	6	5107	5112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017392	ACA	2	6	5228	5233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017392	ATT	2	6	5362	5367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017392	TTA	2	6	5423	5428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017392	CGC	2	6	5435	5440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017392	AGG	2	6	6404	6409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017392	TCT	2	6	7470	7475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017392	TTA	2	6	7476	7481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017392	AAT	2	6	7495	7500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017392	CTC	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017392	CTG	2	6	9076	9081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017392	CTG	2	6	9111	9116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017392	GAT	2	6	9125	9130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017392	CGG	2	6	9185	9190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017392	TCC	2	6	9241	9246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017392	TCT	2	6	9266	9271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017392	CAA	2	6	10242	10247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017392	AAT	2	6	10267	10272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017392	AAG	2	6	11141	11146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017392	AGC	2	6	11150	11155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017392	GAA	2	6	11201	11206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017392	GAA	2	6	11271	11276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017392	GCT	2	6	12149	12154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017392	CAT	2	6	12163	12168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017392	TCG	2	6	12246	12251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017392	ATC	2	6	13477	13482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017392	CGT	2	6	13487	13492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017392	GTT	2	6	16710	16715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017392	GCT	2	6	16735	16740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017392	GAC	2	6	16937	16942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017392	ATG	2	6	16967	16972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017392	CCA	2	6	17798	17803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017392	TGC	2	6	17806	17811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017392	TGT	2	6	17840	17845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017392	ATA	2	6	17864	17869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017392	AAT	2	6	17928	17933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017392	GAA	2	6	18004	18009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017392	ACA	2	6	18792	18797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017392	CGA	2	6	18919	18924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017392	ATT	2	6	18996	19001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017392	GAG	2	6	19050	19055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017392	CCG	2	6	21172	21177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017392	AGT	2	6	21217	21222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017392	TCC	2	6	21263	21268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017392	CGT	2	6	21353	21358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017392	GCA	2	6	21435	21440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017392	GCC	2	6	21536	21541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017392	CGC	2	6	21546	21551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017392	GCC	2	6	21618	21623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017392	TGC	2	6	21698	21703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017392	ATA	2	6	21802	21807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017392	TTA	2	6	22133	22138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017392	ATG	2	6	22156	22161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017392	TCC	2	6	22234	22239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017392	ATT	2	6	22273	22278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017392	TGA	2	6	22313	22318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017392	TTA	2	6	22390	22395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017392	ATA	2	6	22432	22437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017392	TCA	2	6	22477	22482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017392	GTT	2	6	23528	23533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017392	ATA	2	6	28244	28249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017392	AGC	2	6	29154	29159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017392	CTG	2	6	29918	29923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017392	TGA	2	6	30438	30443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017392	GAA	2	6	30493	30498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017392	ATT	2	6	31280	31285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017392	GCA	2	6	31392	31397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017392	CAA	2	6	31433	31438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017392	TTA	2	6	31439	31444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017392	ATT	2	6	31445	31450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017392	GCC	2	6	31554	31559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017392	GCA	2	6	31832	31837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017392	CCG	2	6	31884	31889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017392	TTC	2	6	31940	31945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017392	CGC	2	6	32036	32041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017392	CAG	2	6	32096	32101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017392	AAC	2	6	32234	32239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017392	TCA	2	6	32285	32290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017392	TCA	2	6	32314	32319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017392	ATC	2	6	32487	32492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017392	CAA	2	6	33518	33523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017392	ATA	2	6	33694	33699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017392	GCT	2	6	34716	34721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017392	CTT	2	6	35021	35026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017392	TTC	2	6	35076	35081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017392	CAT	2	6	35156	35161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017392	GAA	2	6	35203	35208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017392	CAT	2	6	35220	35225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017392	AAT	2	6	35246	35251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017392	TAT	2	6	35357	35362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017392	GGA	2	6	35400	35405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017392	TCA	2	6	35623	35628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017392	TGA	2	6	35677	35682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017392	CTC	2	6	35755	35760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017392	ATG	2	6	35826	35831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017392	AAT	2	6	35876	35881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.