MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Erwinia pyrifoliae DSM 12163 plasmid pEP36

Total Repeats: 312

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017392	AGT	2	6	33	38	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869342
2	NC_017392	CCT	2	6	51	56	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387869342
3	NC_017392	CAG	2	6	123	128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869342
4	NC_017392	CAG	2	6	333	338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869342
5	NC_017392	TGA	2	6	339	344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869342
6	NC_017392	TGA	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869342
7	NC_017392	TTG	2	6	1276	1281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387869343
8	NC_017392	GGC	2	6	1284	1289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869343
9	NC_017392	CTG	2	6	1413	1418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869343
10	NC_017392	GGT	2	6	1446	1451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387869343
11	NC_017392	GAT	2	6	1452	1457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869343
12	NC_017392	TCA	2	6	2054	2059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387869344
13	NC_017392	CGA	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869344
14	NC_017392	TCG	2	6	2220	2225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869344
15	NC_017392	TAT	2	6	2623	2628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387869344
16	NC_017392	CGG	2	6	2686	2691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869344
17	NC_017392	AGA	2	6	2719	2724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387869344
18	NC_017392	GGC	2	6	2725	2730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869344
19	NC_017392	TTC	2	6	2825	2830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387869344
20	NC_017392	GAC	2	6	2936	2941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869344
21	NC_017392	GGC	2	6	3012	3017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869344
22	NC_017392	TAT	2	6	3034	3039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387869344
23	NC_017392	TCA	2	6	4357	4362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387869346
24	NC_017392	CTG	2	6	4424	4429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869346
25	NC_017392	TCT	2	6	4492	4497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387869346
26	NC_017392	ACT	2	6	4549	4554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387869346
27	NC_017392	TTG	2	6	5481	5486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387869347
28	NC_017392	CAC	2	6	5524	5529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387869347
29	NC_017392	GCC	2	6	5552	5557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387869347
30	NC_017392	CTT	2	6	5563	5568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387869347
31	NC_017392	ATA	2	6	5618	5623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387869347
32	NC_017392	CCA	2	6	5779	5784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387869347
33	NC_017392	ATT	2	6	5864	5869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387869347
34	NC_017392	TCA	2	6	6346	6351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387869347
35	NC_017392	CGG	2	6	6927	6932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869348
36	NC_017392	CAA	2	6	7013	7018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387869348
37	NC_017392	TTC	2	6	7320	7325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387869348
38	NC_017392	ATG	2	6	7586	7591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869349
39	NC_017392	TCT	2	6	7601	7606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387869349
40	NC_017392	GCT	2	6	7753	7758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869349
41	NC_017392	CAG	2	6	7784	7789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869349
42	NC_017392	GAT	2	6	7807	7812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869349
43	NC_017392	TGC	2	6	8016	8021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869349
44	NC_017392	GCG	2	6	8022	8027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869349
45	NC_017392	CTG	2	6	8039	8044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869349
46	NC_017392	TGC	2	6	8100	8105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869349
47	NC_017392	GGT	2	6	8149	8154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387869349
48	NC_017392	TGC	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869349
49	NC_017392	GCG	2	6	8240	8245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869349
50	NC_017392	TGC	2	6	8338	8343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869349
51	NC_017392	CAT	2	6	8407	8412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387869349
52	NC_017392	CTG	2	6	8585	8590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869349
53	NC_017392	CGG	2	6	8593	8598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869349
54	NC_017392	TAT	2	6	8624	8629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387869349
55	NC_017392	CGG	2	6	8767	8772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869349
56	NC_017392	CGG	2	6	8830	8835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869349
57	NC_017392	TTA	2	6	8841	8846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387869349
58	NC_017392	TGG	2	6	8881	8886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387869349
59	NC_017392	GAA	2	6	8890	8895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387869349
60	NC_017392	CGG	2	6	9279	9284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869350
61	NC_017392	CCA	2	6	9369	9374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387869350
62	NC_017392	CGC	2	6	9457	9462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387869350
63	NC_017392	CCA	2	6	9537	9542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387869350
64	NC_017392	GGC	2	6	9601	9606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869350
65	NC_017392	CGG	2	6	9639	9644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869350
66	NC_017392	CAA	2	6	9645	9650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387869350
67	NC_017392	CCG	2	6	9693	9698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387869350
68	NC_017392	TGA	2	6	9747	9752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869350
69	NC_017392	TTC	2	6	9764	9769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387869350
70	NC_017392	TGG	2	6	9792	9797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387869350
71	NC_017392	GTT	2	6	9909	9914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387869350
72	NC_017392	TGG	2	6	9918	9923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387869350
73	NC_017392	CTG	2	6	9931	9936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869350
74	NC_017392	TTC	2	6	9952	9957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387869350
75	NC_017392	TGC	2	6	10026	10031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869350
76	NC_017392	CAG	2	6	10084	10089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869350
77	NC_017392	TGC	2	6	10103	10108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869350
78	NC_017392	CCT	2	6	10136	10141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387869350
79	NC_017392	CCT	2	6	10155	10160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387869350
80	NC_017392	TGC	3	9	10162	10170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869350
81	NC_017392	GAT	2	6	10479	10484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869351
82	NC_017392	GAC	2	6	10500	10505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869351
83	NC_017392	ATC	2	6	10620	10625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387869351
84	NC_017392	GTG	2	6	10725	10730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387869351
85	NC_017392	AAG	2	6	10767	10772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387869351
86	NC_017392	ATT	2	6	10776	10781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387869351
87	NC_017392	GAT	2	6	11334	11339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869352
88	NC_017392	AAC	2	6	11349	11354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387869352
89	NC_017392	AGC	2	6	11493	11498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869352
90	NC_017392	CGG	2	6	11707	11712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869352
91	NC_017392	TGA	2	6	11731	11736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869352
92	NC_017392	CGT	2	6	11792	11797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869353
93	NC_017392	CGC	2	6	11937	11942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387869353
94	NC_017392	ATC	2	6	11986	11991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387869353
95	NC_017392	TGC	2	6	12013	12018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869353
96	NC_017392	TCA	2	6	12073	12078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387869353
97	NC_017392	GTC	2	6	12328	12333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869354
98	NC_017392	TCT	2	6	12423	12428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387869354
99	NC_017392	GCT	2	6	12526	12531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869354
100	NC_017392	TGG	2	6	12616	12621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387869354
101	NC_017392	GCG	2	6	12661	12666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869354
102	NC_017392	GGT	2	6	13168	13173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387869356
103	NC_017392	GCA	2	6	13228	13233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869356
104	NC_017392	TTC	2	6	13312	13317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387869356
105	NC_017392	AAT	2	6	13533	13538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387869357
106	NC_017392	CGC	2	6	13575	13580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387869357
107	NC_017392	TGC	2	6	13584	13589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387869357
108	NC_017392	CGG	2	6	13628	13633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869357
109	NC_017392	TCT	2	6	13732	13737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387869357
110	NC_017392	GAT	2	6	13775	13780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387869357
111	NC_017392	CAG	2	6	13925	13930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869357
112	NC_017392	CGG	2	6	13943	13948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869357
113	NC_017392	CCG	2	6	14008	14013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387869357
114	NC_017392	CGG	2	6	14120	14125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869357
115	NC_017392	CCA	2	6	14198	14203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387869357
116	NC_017392	CAT	2	6	14321	14326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387869357
117	NC_017392	CGG	3	9	14348	14356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869357
118	NC_017392	CAG	2	6	14358	14363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869357
119	NC_017392	GCA	2	6	14366	14371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869357
120	NC_017392	GCC	2	6	14385	14390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387869357
121	NC_017392	GCA	2	6	14453	14458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869357
122	NC_017392	CGC	2	6	14551	14556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387869358
123	NC_017392	CGG	3	9	14597	14605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387869358
124	NC_017392	CAG	2	6	14658	14663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869358
125	NC_017392	GCC	2	6	14695	14700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387869358
126	NC_017392	AAT	2	6	14727	14732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387869358
127	NC_017392	CAG	2	6	14826	14831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869358
128	NC_017392	AGC	2	6	14848	14853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387869358
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133	NC_017392	CAT	2	6	15255	15260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387869358
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.