MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii TCDC-AB0715 chromosome

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017387	TTTTAT	2	12	7253	7264	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017387	TAAATT	2	12	14939	14950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017387	TAAATT	2	12	15116	15127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017387	AAATCA	2	12	15206	15217	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017387	TTTAAA	2	12	34760	34771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017387	TTTAAA	2	12	34900	34911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017387	AAATTT	2	12	35109	35120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017387	AAAAAT	2	12	38984	38995	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017387	AGAAAA	2	12	61609	61620	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017387	AAAAAG	2	12	68361	68372	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017387	TATTTT	2	12	71496	71507	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017387	TCCTGT	2	12	119318	119329	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017387	TCCTGT	2	12	120499	120510	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017387	AATTTA	2	12	124391	124402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017387	AATTTT	2	12	148757	148768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017387	ATTAAA	2	12	149826	149837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017387	TTTATG	2	12	149944	149955	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017387	TAATTA	2	12	150389	150400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017387	ATAAAT	2	12	171955	171966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017387	TTCAAT	2	12	180917	180928	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017387	ATTGAC	2	12	188182	188193	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017387	AATTTT	2	12	209083	209094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017387	GAAATC	2	12	213638	213649	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017387	CAAGTT	2	12	218840	218851	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017387	ATTTTT	2	12	241704	241715	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017387	GATATT	2	12	294023	294034	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017387	TCAGAA	2	12	393616	393627	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017387	ATTTTT	2	12	402077	402088	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017387	ACTCAA	2	12	430915	430926	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017387	TATAAA	2	12	479413	479424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017387	ATTCAT	2	12	497394	497405	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017387	GTTTTT	2	12	521889	521900	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017387	AATTTT	2	12	533766	533777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017387	TCAAAA	2	12	559072	559083	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017387	TGATAG	2	12	584108	584119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017387	TAAATA	2	12	654342	654353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017387	TAAAAT	2	12	655881	655892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017387	GAAATC	2	12	725951	725962	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017387	TTTTTC	2	12	731902	731913	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017387	TAAAAA	2	12	782373	782384	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017387	TAAAAT	2	12	796595	796606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017387	ATTCTT	2	12	804103	804114	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017387	AAGATT	2	12	822543	822554	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017387	AATTTA	2	12	825753	825764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017387	AAAGAA	2	12	866524	866535	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017387	AATTTA	2	12	906222	906233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017387	AACTAT	2	12	961926	961937	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017387	GAAAAA	2	12	1001321	1001332	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017387	AATTGA	2	12	1027507	1027518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017387	GTTCTT	2	12	1041527	1041538	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017387	TTACTA	2	12	1067125	1067136	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017387	TACAAG	2	12	1079791	1079802	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017387	CTAAAA	2	12	1093693	1093704	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017387	TAAATA	2	12	1131105	1131116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017387	ATATTT	2	12	1131123	1131134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017387	AAAACA	2	12	1153197	1153208	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017387	AGAATT	2	12	1195296	1195307	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017387	TAAAAA	2	12	1204688	1204699	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017387	TTTTAT	2	12	1204720	1204731	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017387	TATTTT	2	12	1209230	1209241	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017387	ATTTTG	2	12	1223852	1223863	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017387	TTTTAA	2	12	1232858	1232869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017387	ATATTT	2	12	1233052	1233063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017387	TGCAGT	2	12	1235465	1235476	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017387	CTTTAA	2	12	1247856	1247867	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017387	GTCAAA	2	12	1248265	1248276	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017387	TAAAAA	2	12	1259375	1259386	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017387	CTTTTT	2	12	1259540	1259551	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017387	CAATGT	2	12	1290040	1290051	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017387	TAATCA	2	12	1306556	1306567	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017387	TTATTT	2	12	1315965	1315976	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017387	TTTTAA	2	12	1378317	1378328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017387	GAAATG	2	12	1389171	1389182	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017387	AGGGCA	2	12	1389919	1389930	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017387	AAATAT	2	12	1390186	1390197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017387	TTTGTG	2	12	1402573	1402584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017387	GCACCA	2	12	1409972	1409983	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017387	ATTCTA	2	12	1409997	1410008	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017387	CATTAA	2	12	1430302	1430313	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017387	GTGATT	2	12	1430569	1430580	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017387	TAAATA	2	12	1449491	1449502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017387	AAAGTG	2	12	1468456	1468467	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017387	TAAAAA	2	12	1488692	1488703	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017387	AAATTG	2	12	1493978	1493989	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017387	AAAAAT	2	12	1497849	1497860	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017387	CAATTA	2	12	1500621	1500632	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017387	TAAAAA	2	12	1505624	1505635	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017387	TCAATA	2	12	1507621	1507632	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017387	TAATCA	2	12	1538036	1538047	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017387	ATTGAG	2	12	1538085	1538096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017387	CATTTG	2	12	1564401	1564412	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017387	TTATTT	2	12	1579448	1579459	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017387	AAATTT	2	12	1638477	1638488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017387	TAAAAA	2	12	1660665	1660676	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017387	TGTTTT	2	12	1721259	1721270	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017387	TAAAAT	2	12	1741480	1741491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017387	TAAGTG	2	12	1766536	1766547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017387	AGATAA	2	12	1772061	1772072	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017387	TAAAAA	2	12	1773307	1773318	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017387	AAAAAT	2	12	1773463	1773474	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017387	TAAAAA	2	12	1802866	1802877	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017387	ATATAG	2	12	1824995	1825006	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017387	AAATAA	2	12	1825220	1825231	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017387	TAATCA	2	12	1852892	1852903	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017387	TTATTT	2	12	1862301	1862312	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017387	TTTAAT	2	12	1882473	1882484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017387	TTTAAT	2	12	1892976	1892987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017387	CTTGAG	2	12	1894259	1894270	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017387	ATTTGT	2	12	1916454	1916465	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017387	TAATAT	2	12	1988956	1988967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017387	ATTGTT	2	12	1999608	1999619	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017387	ATTTTA	2	12	2015093	2015104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017387	ATTATC	2	12	2017309	2017320	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017387	GCTAGG	2	12	2032654	2032665	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017387	AATTTA	2	12	2034627	2034638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017387	AAAAAT	2	12	2065981	2065992	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017387	CCAAAA	2	12	2155184	2155195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017387	TCAATT	2	12	2155290	2155301	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017387	AAGCAA	2	12	2176013	2176024	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017387	GTTATA	2	12	2195349	2195360	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017387	CTTATT	2	12	2197898	2197909	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017387	ATACAT	2	12	2199959	2199970	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017387	CTGTTG	2	12	2234186	2234197	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017387	TTTTAA	2	12	2236960	2236971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017387	TCCTTT	2	12	2238616	2238627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017387	CATTTT	2	12	2256751	2256762	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017387	GTACCC	2	12	2258895	2258906	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017387	ATCTAA	2	12	2284588	2284599	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017387	TAAAGC	2	12	2284621	2284632	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.