MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii TCDC-AB0715 chromosome

Total Repeats: 1693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017387	GTTCAA	2	12	3661041	3661052	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385238957
1502	NC_017387	CGATTT	2	12	3671800	3671811	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1503	NC_017387	AAGGCG	2	12	3679993	3680004	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1504	NC_017387	AGACTT	2	12	3686222	3686233	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385238975
1505	NC_017387	AGTTTA	2	12	3687736	3687747	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385238977
1506	NC_017387	TTCAGC	2	12	3688308	3688319	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385238978
1507	NC_017387	CATTTT	2	12	3689288	3689299	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1508	NC_017387	AGCTTA	2	12	3694033	3694044	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385238984
1509	NC_017387	GAGGTA	2	12	3694422	3694433	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385238984
1510	NC_017387	TCTAAA	2	12	3698348	3698359	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1511	NC_017387	CAACTG	2	12	3700168	3700179	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385238989
1512	NC_017387	AAACTA	2	12	3701577	3701588	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1513	NC_017387	AAAAAG	2	12	3704197	3704208	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385238991
1514	NC_017387	TACCAA	2	12	3707310	3707321	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385238995
1515	NC_017387	CAGAAA	2	12	3710154	3710165	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385238996
1516	NC_017387	ATATTT	2	12	3710928	3710939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385238997
1517	NC_017387	TACGAG	2	12	3716045	3716056	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385239002
1518	NC_017387	CTTTAG	2	12	3716132	3716143	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385239002
1519	NC_017387	ACCTTT	2	12	3721856	3721867	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385239012
1520	NC_017387	AAGGTT	2	12	3722018	3722029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239012
1521	NC_017387	ACCAAC	2	12	3722060	3722071	50 %	0 %	0 %	50 %	385239012
1522	NC_017387	AGCAGG	2	12	3725375	3725386	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385239021
1523	NC_017387	ACCTTT	2	12	3728712	3728723	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385239027
1524	NC_017387	TGGTTA	2	12	3735258	3735269	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385239034
1525	NC_017387	ATCTTT	2	12	3736816	3736827	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385239036
1526	NC_017387	AGAGCT	2	12	3737224	3737235	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385239036
1527	NC_017387	TAAAAA	2	12	3738135	3738146	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017387	TTTATC	2	12	3742935	3742946	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1529	NC_017387	AAAAAT	2	12	3747920	3747931	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385239045
1530	NC_017387	AAACCT	2	12	3754149	3754160	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385239052
1531	NC_017387	GTATGG	2	12	3757614	3757625	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017387	CTATTT	2	12	3759050	3759061	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385239056
1533	NC_017387	ATTTTA	2	12	3760004	3760015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239057
1534	NC_017387	AAAATT	2	12	3760252	3760263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239057
1535	NC_017387	GCTACA	2	12	3761685	3761696	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385239058
1536	NC_017387	AGAAGT	2	12	3761741	3761752	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385239058
1537	NC_017387	TAAAAA	2	12	3762825	3762836	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017387	ACTTCC	2	12	3771241	3771252	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385239067
1539	NC_017387	TGTAGA	2	12	3771675	3771686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239068
1540	NC_017387	CGTTTA	2	12	3773500	3773511	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385239068
1541	NC_017387	ACCTCA	2	12	3776038	3776049	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385239072
1542	NC_017387	AGCCAT	2	12	3776962	3776973	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_017387	TTTAGT	2	12	3777689	3777700	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385239074
1544	NC_017387	AATGCA	2	12	3779975	3779986	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385239076
1545	NC_017387	AACCTA	2	12	3781141	3781152	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385239078
1546	NC_017387	ACGTAA	2	12	3781337	3781348	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385239078
1547	NC_017387	ATTAAA	2	12	3787675	3787686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239083
1548	NC_017387	CTTTAT	2	12	3789747	3789758	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1549	NC_017387	AATTTA	2	12	3789973	3789984	50 %	50 %	0 %	0 %	385239085
1550	NC_017387	GTAAAG	2	12	3794411	3794422	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385239090
1551	NC_017387	CTAAAG	2	12	3800149	3800160	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385239094
1552	NC_017387	GCTGAA	2	12	3801316	3801327	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385239096
1553	NC_017387	AAAATT	2	12	3802055	3802066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239097
1554	NC_017387	CTAAAA	2	12	3803312	3803323	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385239099
1555	NC_017387	TGCTTC	2	12	3805539	3805550	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385239100
1556	NC_017387	CGCGTA	2	12	3805594	3805605	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385239100
1557	NC_017387	TTTATA	2	12	3808136	3808147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017387	CAATCA	2	12	3808641	3808652	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385239104
1559	NC_017387	CTTCTG	2	12	3809095	3809106	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385239105
1560	NC_017387	AAAATA	2	12	3811158	3811169	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017387	CAACAC	2	12	3812357	3812368	50 %	0 %	0 %	50 %	385239108
1562	NC_017387	TTTTAC	2	12	3822211	3822222	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1563	NC_017387	ATTAAT	2	12	3831257	3831268	50 %	50 %	0 %	0 %	385239127
1564	NC_017387	ATATTC	2	12	3835498	3835509	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385239132
1565	NC_017387	GCAATT	2	12	3838985	3838996	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385239134
1566	NC_017387	TCAACC	2	12	3842856	3842867	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385239135
1567	NC_017387	CATTTA	2	12	3846259	3846270	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385239138
1568	NC_017387	TTGTGG	2	12	3846695	3846706	0 %	50 %	50 %	0 %	385239138
1569	NC_017387	TTTCTT	2	12	3848143	3848154	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385239140
1570	NC_017387	GTTAAA	2	12	3851240	3851251	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385239143
1571	NC_017387	AATAAA	2	12	3852612	3852623	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385239143
1572	NC_017387	ATACCG	2	12	3854024	3854035	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385239146
1573	NC_017387	AGCTTG	2	12	3856529	3856540	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385239148
1574	NC_017387	CACGGT	2	12	3856726	3856737	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385239148
1575	NC_017387	ATTGGC	2	12	3859523	3859534	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385239149
1576	NC_017387	TAAAGC	2	12	3860636	3860647	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385239151
1577	NC_017387	AAATTG	2	12	3861494	3861505	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385239152
1578	NC_017387	TTTATC	2	12	3861525	3861536	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385239152
1579	NC_017387	GGCTAA	2	12	3861948	3861959	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385239152
1580	NC_017387	ACTTTT	2	12	3862220	3862231	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1581	NC_017387	TATTTT	2	12	3862243	3862254	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017387	GAAAAT	2	12	3862601	3862612	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385239153
1583	NC_017387	TACATA	2	12	3866524	3866535	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385239156
1584	NC_017387	CCAGTT	2	12	3870351	3870362	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385239160
1585	NC_017387	CTGTTC	2	12	3871495	3871506	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385239160
1586	NC_017387	GTAGGC	2	12	3875103	3875114	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385239162
1587	NC_017387	GCAACA	2	12	3875901	3875912	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385239162
1588	NC_017387	ATCTTT	2	12	3876569	3876580	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1589	NC_017387	AGCTTT	2	12	3876670	3876681	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385239164
1590	NC_017387	TTATGG	2	12	3878769	3878780	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385239167
1591	NC_017387	TAAAAA	2	12	3883261	3883272	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017387	GCCCCT	2	12	3883292	3883303	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_017387	TTTGCT	2	12	3884544	3884555	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385239172
1594	NC_017387	CTAAAA	2	12	3884604	3884615	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385239172
1595	NC_017387	TGCTTC	2	12	3888231	3888242	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385239173
1596	NC_017387	AGACCA	2	12	3889164	3889175	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_017387	CGCGCT	2	12	3893531	3893542	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385239176
1598	NC_017387	CTTTTT	2	12	3904298	3904309	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1599	NC_017387	AGTTGT	2	12	3906254	3906265	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017387	TTGAAA	2	12	3907001	3907012	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385239195
1601	NC_017387	AAAATT	2	12	3915162	3915173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239203
1602	NC_017387	ATTTAA	2	12	3916317	3916328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017387	TGGCTT	2	12	3919936	3919947	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385239207
1604	NC_017387	CTTTTT	2	12	3921714	3921725	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385239210
1605	NC_017387	TAATTT	2	12	3923446	3923457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017387	GTCATG	2	12	3923506	3923517	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1607	NC_017387	TTCCTG	2	12	3925193	3925204	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_017387	TTTAAA	2	12	3925288	3925299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017387	TTTAAA	2	12	3926500	3926511	50 %	50 %	0 %	0 %	385239214
1610	NC_017387	ATTTTT	2	12	3928247	3928258	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017387	CGCCTT	2	12	3933585	3933596	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385239220
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1613	NC_017387	AATTTA	2	12	3942885	3942896	50 %	50 %	0 %	0 %	385239229
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.