MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Ketogulonigenium vulgarum WSH-001 plasmid 1

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017386	GCTTCG	2	12	1122	1133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385235307
2	NC_017386	GTTCGG	2	12	1702	1713	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385235308
3	NC_017386	GCCTTC	2	12	11969	11980	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385235317
4	NC_017386	GAGAGT	2	12	12341	12352	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017386	AGGCCG	2	12	14724	14735	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235320
6	NC_017386	GCGGTG	2	12	15308	15319	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385235320
7	NC_017386	CAGCAT	2	12	16154	16165	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385235321
8	NC_017386	AGCTGG	2	12	17008	17019	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385235322
9	NC_017386	TGAGAG	2	12	18963	18974	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017386	AGCGCA	2	12	22630	22641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385235326
11	NC_017386	ACGCGG	2	12	23806	23817	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235327
12	NC_017386	CGGAAA	2	12	28194	28205	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385235331
13	NC_017386	CGTGGC	2	12	36421	36432	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385235346
14	NC_017386	CATGTC	2	12	36826	36837	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385235346
15	NC_017386	GCGCGA	2	12	37980	37991	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235346
16	NC_017386	GGGCTG	2	12	38242	38253	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385235346
17	NC_017386	TCGGCC	2	12	47377	47388	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235355
18	NC_017386	ACCGTC	2	12	48535	48546	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385235356
19	NC_017386	GCCAGA	2	12	50521	50532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385235357
20	NC_017386	CGGCAA	2	12	50750	50761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385235357
21	NC_017386	GTGCTG	2	12	51526	51537	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385235359
22	NC_017386	ATGCAC	2	12	60023	60034	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385235367
23	NC_017386	CCGACA	2	12	61686	61697	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385235369
24	NC_017386	TCGGTA	2	12	64194	64205	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017386	TCGCCA	2	12	69562	69573	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385235371
26	NC_017386	TATGCG	2	12	74175	74186	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017386	ACCCCG	2	12	74774	74785	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385235373
28	NC_017386	GATCCT	2	12	76985	76996	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385235375
29	NC_017386	TGGCGC	2	12	77326	77337	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385235375
30	NC_017386	GGCATT	2	12	77601	77612	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385235375
31	NC_017386	CCGACC	2	12	77619	77630	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385235375
32	NC_017386	ATGGCG	2	12	78190	78201	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385235376
33	NC_017386	GCAGCG	2	12	79256	79267	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235377
34	NC_017386	CATCGC	2	12	80772	80783	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385235379
35	NC_017386	GCGTTG	2	12	83285	83296	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385235381
36	NC_017386	TGAATA	2	12	88097	88108	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017386	CGAGAT	2	12	92924	92935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385235391
38	NC_017386	GATCGT	2	12	95944	95955	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385235395
39	NC_017386	CAGAGC	2	12	99879	99890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385235396
40	NC_017386	ATCTGC	2	12	102353	102364	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385235401
41	NC_017386	CGAGGG	2	12	104714	104725	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385235403
42	NC_017386	CGCCCG	2	12	108231	108242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385235409
43	NC_017386	CTCGGG	2	12	108986	108997	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385235410
44	NC_017386	CTGAAC	2	12	110423	110434	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385235411
45	NC_017386	GCAACG	2	12	112346	112357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385235416
46	NC_017386	CAGCAC	2	12	113554	113565	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385235416
47	NC_017386	ATTACG	2	12	114935	114946	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385235418
48	NC_017386	CACAGA	2	12	116204	116215	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385235419
49	NC_017386	CCGAGC	2	12	116516	116527	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235419
50	NC_017386	CGCAAC	2	12	119305	119316	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385235421
51	NC_017386	TCTGGT	2	12	119515	119526	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385235422
52	NC_017386	GCCAGC	2	12	120680	120691	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235422
53	NC_017386	GATCCC	2	12	121269	121280	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385235423
54	NC_017386	GCTGGT	2	12	121311	121322	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385235423
55	NC_017386	CAGCAC	2	12	123958	123969	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385235425
56	NC_017386	GTCAGC	2	12	124028	124039	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385235425
57	NC_017386	CGATCG	2	12	127552	127563	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385235429
58	NC_017386	CGGCGT	2	12	130040	130051	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385235431
59	NC_017386	GGCAAA	2	12	131454	131465	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385235433
60	NC_017386	TCGCCG	2	12	133713	133724	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235438
61	NC_017386	TCGGCC	2	12	135542	135553	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235440
62	NC_017386	AAGGGC	2	12	137651	137662	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385235442
63	NC_017386	CCAGCG	2	12	138561	138572	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235443
64	NC_017386	CCGACG	2	12	140233	140244	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235446
65	NC_017386	CTTTGG	2	12	142397	142408	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385235448
66	NC_017386	ATCGTC	2	12	143513	143524	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385235449
67	NC_017386	CGAGGG	2	12	144057	144068	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385235450
68	NC_017386	TGCTGG	2	12	144128	144139	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385235450
69	NC_017386	CATCGG	2	12	147461	147472	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385235452
70	NC_017386	TTGCCT	2	12	148848	148859	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385235454
71	NC_017386	TTGCAC	2	12	148872	148883	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385235454
72	NC_017386	GGCCGA	2	12	149284	149295	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235454
73	NC_017386	TCATGA	2	12	152149	152160	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385235456
74	NC_017386	GCCATC	2	12	152574	152585	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385235456
75	NC_017386	GCCGGG	2	12	156594	156605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385235460
76	NC_017386	GATCTG	2	12	157478	157489	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017386	GGCCAA	2	12	157725	157736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017386	GCCTCG	2	12	163994	164005	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235465
79	NC_017386	ACCCGA	2	12	164257	164268	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385235465
80	NC_017386	TCGCCA	2	12	164846	164857	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385235466
81	NC_017386	CAGCGA	2	12	167661	167672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385235468
82	NC_017386	TGCCAA	2	12	167959	167970	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385235469
83	NC_017386	GCGCGG	2	12	171289	171300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385235470
84	NC_017386	GCCAGC	2	12	177078	177089	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235475
85	NC_017386	GCATAG	2	12	179605	179616	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385235477
86	NC_017386	CAGCGT	2	12	183587	183598	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385235480
87	NC_017386	CCTGCG	2	12	186109	186120	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235482
88	NC_017386	GAGAAT	2	12	187806	187817	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385235484
89	NC_017386	CCAGCT	2	12	188650	188661	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385235485
90	NC_017386	AGGCGC	2	12	190534	190545	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235487
91	NC_017386	TGCGCC	2	12	194271	194282	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235491
92	NC_017386	CGCCTG	2	12	194452	194463	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235492
93	NC_017386	CGTATG	2	12	194482	194493	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385235492
94	NC_017386	CGACAT	2	12	194637	194648	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385235492
95	NC_017386	ATCAGG	2	12	195227	195238	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385235492
96	NC_017386	CCGATC	2	12	196458	196469	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385235493
97	NC_017386	AGGCCG	2	12	196697	196708	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235494
98	NC_017386	TGACCG	2	12	198242	198253	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385235495
99	NC_017386	CTGGAT	2	12	200658	200669	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385235496
100	NC_017386	CAAGGC	2	12	200830	200841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385235497
101	NC_017386	CTCGGC	2	12	201917	201928	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235497
102	NC_017386	CCAGCG	2	12	201982	201993	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235497
103	NC_017386	ATCTCG	2	12	202795	202806	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385235499
104	NC_017386	CCCAAA	2	12	203182	203193	50 %	0 %	0 %	50 %	385235500
105	NC_017386	GAAGGC	2	12	203247	203258	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385235500
106	NC_017386	AGGGCG	2	12	205385	205396	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385235502
107	NC_017386	AACCGC	2	12	206152	206163	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385235502
108	NC_017386	GCCTGC	2	12	206840	206851	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235503
109	NC_017386	CGATGA	2	12	210886	210897	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385235506
110	NC_017386	GCTGGC	2	12	211628	211639	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385235507
111	NC_017386	GGCCGC	2	12	211748	211759	0 %	0 %	50 %	50 %	385235507
112	NC_017386	ACGGTG	2	12	213761	213772	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385235509
113	NC_017386	CGCGCC	2	12	214137	214148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385235510
114	NC_017386	GGCAAG	2	12	214362	214373	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385235510
115	NC_017386	CTTTGG	2	12	215078	215089	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385235510
116	NC_017386	GCCTCG	2	12	218724	218735	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235514
117	NC_017386	GCGCGA	2	12	220596	220607	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235516
118	NC_017386	CTGGCG	2	12	220807	220818	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385235516
119	NC_017386	CGGACG	2	12	221480	221491	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235517
120	NC_017386	CAAGGC	2	12	226117	226128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385235522
121	NC_017386	CGCGCC	2	12	226700	226711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385235522
122	NC_017386	GATGGT	2	12	227486	227497	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385235522
123	NC_017386	GGCAGG	2	12	227829	227840	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385235522
124	NC_017386	CGATGC	2	12	228351	228362	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385235523
125	NC_017386	GATCGG	2	12	228501	228512	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385235523
126	NC_017386	GTATAG	2	12	229132	229143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385235524
127	NC_017386	TGCCGG	2	12	233267	233278	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385235527
128	NC_017386	CGGGTG	2	12	233954	233965	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385235527
129	NC_017386	GATGAC	2	12	234252	234263	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385235527
130	NC_017386	GGCGTC	2	12	235744	235755	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385235528
131	NC_017386	CCCGGC	2	12	238836	238847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385235528
132	NC_017386	CGACAG	2	12	239440	239451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385235528
133	NC_017386	CGGCAT	2	12	240518	240529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385235530
134	NC_017386	GCGCAG	2	12	242350	242361	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235531
135	NC_017386	CAAGGC	2	12	242607	242618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385235531
136	NC_017386	CAGGTT	2	12	242638	242649	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385235531
137	NC_017386	CACGCG	2	12	248325	248336	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235537
138	NC_017386	GCCAAG	2	12	252981	252992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385235542
139	NC_017386	ACAAGG	2	12	253760	253771	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385235543
140	NC_017386	CGAAAG	2	12	254432	254443	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385235543
141	NC_017386	CGCGGG	2	12	255237	255248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385235544
142	NC_017386	GTTCGG	2	12	255567	255578	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385235544
143	NC_017386	TGCGGC	2	12	261310	261321	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385235549
144	NC_017386	GGGGCT	2	12	261592	261603	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385235549
145	NC_017386	GCCTTT	2	12	261890	261901	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385235549
146	NC_017386	ATCCGG	2	12	266994	267005	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.