MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ketogulonigenium vulgarum WSH-001 plasmid 1

Total Repeats: 225

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017386	CGCTG	2	10	1735	1744	0 %	20 %	40 %	40 %	385235308
2	NC_017386	GCTTC	2	10	5465	5474	0 %	40 %	20 %	40 %	385235313
3	NC_017386	CGCAA	2	10	5557	5566	40 %	0 %	20 %	40 %	385235313
4	NC_017386	CCCGA	2	10	5629	5638	20 %	0 %	20 %	60 %	385235313
5	NC_017386	CGCAG	2	10	5676	5685	20 %	0 %	40 %	40 %	385235313
6	NC_017386	TGATC	2	10	7746	7755	20 %	40 %	20 %	20 %	385235314
7	NC_017386	TTTCG	2	10	8299	8308	0 %	60 %	20 %	20 %	385235314
8	NC_017386	CTCCG	2	10	8629	8638	0 %	20 %	20 %	60 %	385235314
9	NC_017386	CCGTG	2	10	9548	9557	0 %	20 %	40 %	40 %	385235316
10	NC_017386	CTTCG	2	10	13843	13852	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017386	CCATG	2	10	14305	14314	20 %	20 %	20 %	40 %	385235320
12	NC_017386	CCGTC	2	10	19657	19666	0 %	20 %	20 %	60 %	385235326
13	NC_017386	TGGAC	2	10	20197	20206	20 %	20 %	40 %	20 %	385235326
14	NC_017386	GCGCC	2	10	20485	20494	0 %	0 %	40 %	60 %	385235326
15	NC_017386	CCAGA	2	10	24648	24657	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017386	GACGA	2	10	26427	26436	40 %	0 %	40 %	20 %	385235330
17	NC_017386	CATCT	2	10	29963	29972	20 %	40 %	0 %	40 %	385235335
18	NC_017386	GCAAG	2	10	32060	32069	40 %	0 %	40 %	20 %	385235338
19	NC_017386	TGCGC	2	10	32412	32421	0 %	20 %	40 %	40 %	385235338
20	NC_017386	GGCGT	2	10	32805	32814	0 %	20 %	60 %	20 %	385235339
21	NC_017386	CGACG	2	10	33686	33695	20 %	0 %	40 %	40 %	385235341
22	NC_017386	CACCG	2	10	33708	33717	20 %	0 %	20 %	60 %	385235341
23	NC_017386	CAGCA	2	10	36298	36307	40 %	0 %	20 %	40 %	385235346
24	NC_017386	CGAGG	2	10	38444	38453	20 %	0 %	60 %	20 %	385235347
25	NC_017386	GGCGA	2	10	38694	38703	20 %	0 %	60 %	20 %	385235347
26	NC_017386	CGCTG	2	10	39402	39411	0 %	20 %	40 %	40 %	385235348
27	NC_017386	GGCAT	2	10	42956	42965	20 %	20 %	40 %	20 %	385235351
28	NC_017386	TGTGC	2	10	43746	43755	0 %	40 %	40 %	20 %	385235352
29	NC_017386	GGAAA	2	10	44098	44107	60 %	0 %	40 %	0 %	385235352
30	NC_017386	CATCA	2	10	45927	45936	40 %	20 %	0 %	40 %	385235354
31	NC_017386	GCGCC	2	10	46491	46500	0 %	0 %	40 %	60 %	385235354
32	NC_017386	TGCGC	2	10	46693	46702	0 %	20 %	40 %	40 %	385235354
33	NC_017386	GCCTG	2	10	48258	48267	0 %	20 %	40 %	40 %	385235356
34	NC_017386	GGCTC	2	10	48656	48665	0 %	20 %	40 %	40 %	385235356
35	NC_017386	CGGAA	2	10	48761	48770	40 %	0 %	40 %	20 %	385235356
36	NC_017386	ATCGG	2	10	49418	49427	20 %	20 %	40 %	20 %	385235356
37	NC_017386	GAAGC	2	10	56665	56674	40 %	0 %	40 %	20 %	385235365
38	NC_017386	GCTAC	2	10	57459	57468	20 %	20 %	20 %	40 %	385235365
39	NC_017386	ACTGG	2	10	57567	57576	20 %	20 %	40 %	20 %	385235365
40	NC_017386	GGCCA	2	10	63755	63764	20 %	0 %	40 %	40 %	385235369
41	NC_017386	TCGCA	2	10	64932	64941	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017386	GGACC	2	10	64981	64990	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_017386	GGGCC	2	10	65789	65798	0 %	0 %	60 %	40 %	385235371
44	NC_017386	CTGCG	2	10	66634	66643	0 %	20 %	40 %	40 %	385235371
45	NC_017386	TGACC	2	10	70370	70379	20 %	20 %	20 %	40 %	385235371
46	NC_017386	TGCGC	2	10	70448	70457	0 %	20 %	40 %	40 %	385235371
47	NC_017386	CCTGA	2	10	70710	70719	20 %	20 %	20 %	40 %	385235371
48	NC_017386	GCGCC	2	10	71142	71151	0 %	0 %	40 %	60 %	385235371
49	NC_017386	CGACC	2	10	71414	71423	20 %	0 %	20 %	60 %	385235371
50	NC_017386	CGGCC	2	10	71476	71485	0 %	0 %	40 %	60 %	385235371
51	NC_017386	GATGG	2	10	72258	72267	20 %	20 %	60 %	0 %	385235371
52	NC_017386	TGGCT	2	10	72696	72705	0 %	40 %	40 %	20 %	385235371
53	NC_017386	ATGGG	2	10	72824	72833	20 %	20 %	60 %	0 %	385235371
54	NC_017386	CGCGG	2	10	76347	76356	0 %	0 %	60 %	40 %	385235374
55	NC_017386	GCCGA	2	10	79293	79302	20 %	0 %	40 %	40 %	385235377
56	NC_017386	TGATA	2	10	80199	80208	40 %	40 %	20 %	0 %	385235378
57	NC_017386	CGCGC	2	10	85795	85804	0 %	0 %	40 %	60 %	385235382
58	NC_017386	GCGGG	2	10	86126	86135	0 %	0 %	80 %	20 %	385235382
59	NC_017386	GGACA	2	10	86584	86593	40 %	0 %	40 %	20 %	385235383
60	NC_017386	GATCA	2	10	87717	87726	40 %	20 %	20 %	20 %	385235384
61	NC_017386	GCCGC	2	10	88403	88412	0 %	0 %	40 %	60 %	385235385
62	NC_017386	GATTG	2	10	89367	89376	20 %	40 %	40 %	0 %	385235386
63	NC_017386	TGAAA	2	10	90335	90344	60 %	20 %	20 %	0 %	385235388
64	NC_017386	GCGCC	2	10	90895	90904	0 %	0 %	40 %	60 %	385235388
65	NC_017386	TGATG	2	10	92144	92153	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017386	CAATC	2	10	92591	92600	40 %	20 %	0 %	40 %	385235391
67	NC_017386	GTATC	2	10	93191	93200	20 %	40 %	20 %	20 %	385235391
68	NC_017386	GTCTC	2	10	95307	95316	0 %	40 %	20 %	40 %	385235394
69	NC_017386	AGCGC	2	10	97301	97310	20 %	0 %	40 %	40 %	385235395
70	NC_017386	GTCGC	2	10	99110	99119	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017386	AAAAG	2	10	100277	100286	80 %	0 %	20 %	0 %	385235398
72	NC_017386	GCCGC	2	10	101463	101472	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
73	NC_017386	AGGGT	2	10	102644	102653	20 %	20 %	60 %	0 %	385235401
74	NC_017386	CCGAT	2	10	103279	103288	20 %	20 %	20 %	40 %	385235403
75	NC_017386	CAATC	2	10	104611	104620	40 %	20 %	0 %	40 %	385235403
76	NC_017386	CCGGT	2	10	105229	105238	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017386	GCCGC	2	10	105547	105556	0 %	0 %	40 %	60 %	385235404
78	NC_017386	ATCCG	2	10	106578	106587	20 %	20 %	20 %	40 %	385235406
79	NC_017386	CGGCC	2	10	108054	108063	0 %	0 %	40 %	60 %	385235409
80	NC_017386	CTTGC	2	10	108649	108658	0 %	40 %	20 %	40 %	385235409
81	NC_017386	ATGCG	2	10	109529	109538	20 %	20 %	40 %	20 %	385235410
82	NC_017386	GATTA	2	10	110546	110555	40 %	40 %	20 %	0 %	385235411
83	NC_017386	GGCGC	2	10	111112	111121	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017386	GGTTG	2	10	111265	111274	0 %	40 %	60 %	0 %	385235413
85	NC_017386	CAGCG	2	10	111913	111922	20 %	0 %	40 %	40 %	385235415
86	NC_017386	GATCG	2	10	112978	112987	20 %	20 %	40 %	20 %	385235416
87	NC_017386	GCCGC	2	10	113035	113044	0 %	0 %	40 %	60 %	385235416
88	NC_017386	GCCGC	2	10	113660	113669	0 %	0 %	40 %	60 %	385235416
89	NC_017386	GATCT	2	10	114664	114673	20 %	40 %	20 %	20 %	385235418
90	NC_017386	TGATC	2	10	114849	114858	20 %	40 %	20 %	20 %	385235418
91	NC_017386	GGCGC	2	10	116604	116613	0 %	0 %	60 %	40 %	385235419
92	NC_017386	TGCGG	2	10	121254	121263	0 %	20 %	60 %	20 %	385235423
93	NC_017386	AAGGC	2	10	121324	121333	40 %	0 %	40 %	20 %	385235423
94	NC_017386	CAATC	2	10	121451	121460	40 %	20 %	0 %	40 %	385235423
95	NC_017386	CGGGC	2	10	122711	122720	0 %	0 %	60 %	40 %	385235424
96	NC_017386	GCGCG	2	10	124402	124411	0 %	0 %	60 %	40 %	385235426
97	NC_017386	GCATC	2	10	125576	125585	20 %	20 %	20 %	40 %	385235427
98	NC_017386	CGGCG	2	10	126873	126882	0 %	0 %	60 %	40 %	385235428
99	NC_017386	CTGCG	2	10	126980	126989	0 %	20 %	40 %	40 %	385235428
100	NC_017386	GATCT	2	10	127587	127596	20 %	40 %	20 %	20 %	385235429
101	NC_017386	GCCGT	2	10	127620	127629	0 %	20 %	40 %	40 %	385235429
102	NC_017386	GGTCA	2	10	129035	129044	20 %	20 %	40 %	20 %	385235430
103	NC_017386	GCAAC	2	10	129082	129091	40 %	0 %	20 %	40 %	385235430
104	NC_017386	GCCGG	2	10	129184	129193	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017386	CGCGG	2	10	130604	130613	0 %	0 %	60 %	40 %	385235432
106	NC_017386	CGTGC	2	10	130730	130739	0 %	20 %	40 %	40 %	385235432
107	NC_017386	GGCCG	2	10	131754	131763	0 %	0 %	60 %	40 %	385235434
108	NC_017386	CGATG	2	10	132709	132718	20 %	20 %	40 %	20 %	385235435
109	NC_017386	GACGC	2	10	133907	133916	20 %	0 %	40 %	40 %	385235438
110	NC_017386	GGGCA	2	10	134115	134124	20 %	0 %	60 %	20 %	385235438
111	NC_017386	AAAGC	2	10	135457	135466	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017386	CGCCC	2	10	137084	137093	0 %	0 %	20 %	80 %	385235442
113	NC_017386	CCGCC	2	10	137545	137554	0 %	0 %	20 %	80 %	385235442
114	NC_017386	AAAGA	2	10	139029	139038	80 %	0 %	20 %	0 %	385235444
115	NC_017386	CCGCA	2	10	139921	139930	20 %	0 %	20 %	60 %	385235445
116	NC_017386	GCGGG	2	10	141112	141121	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017386	CGGCG	2	10	142286	142295	0 %	0 %	60 %	40 %	385235448
118	NC_017386	CGCGC	2	10	142927	142936	0 %	0 %	40 %	60 %	385235449
119	NC_017386	GGGCC	2	10	143198	143207	0 %	0 %	60 %	40 %	385235449
120	NC_017386	CTGGT	2	10	144343	144352	0 %	40 %	40 %	20 %	385235450
121	NC_017386	CTGAT	2	10	146846	146855	20 %	40 %	20 %	20 %	385235451
122	NC_017386	GCGCC	2	10	146999	147008	0 %	0 %	40 %	60 %	385235452
123	NC_017386	CGCTG	2	10	147206	147215	0 %	20 %	40 %	40 %	385235452
124	NC_017386	GCCGC	2	10	147798	147807	0 %	0 %	40 %	60 %	385235452
125	NC_017386	GATCT	2	10	149633	149642	20 %	40 %	20 %	20 %	385235454
126	NC_017386	CGCGC	2	10	150066	150075	0 %	0 %	40 %	60 %	385235455
127	NC_017386	CGCAT	2	10	151119	151128	20 %	20 %	20 %	40 %	385235456
128	NC_017386	ATCGC	2	10	151689	151698	20 %	20 %	20 %	40 %	385235456
129	NC_017386	CTGCG	2	10	154341	154350	0 %	20 %	40 %	40 %	385235458
130	NC_017386	CCCCG	2	10	154802	154811	0 %	0 %	20 %	80 %	385235458
131	NC_017386	GCAGC	2	10	163527	163536	20 %	0 %	40 %	40 %	385235465
132	NC_017386	GCAAA	2	10	164491	164500	60 %	0 %	20 %	20 %	385235466
133	NC_017386	CAATC	2	10	165432	165441	40 %	20 %	0 %	40 %	385235467
134	NC_017386	CCAGC	2	10	165720	165729	20 %	0 %	20 %	60 %	385235467
135	NC_017386	CGCGG	2	10	166428	166437	0 %	0 %	60 %	40 %	385235468
136	NC_017386	ACGTC	2	10	167795	167804	20 %	20 %	20 %	40 %	385235468
137	NC_017386	CGGCG	2	10	169417	169426	0 %	0 %	60 %	40 %	385235469
138	NC_017386	GCGCA	2	10	170124	170133	20 %	0 %	40 %	40 %	385235470
139	NC_017386	CACGC	2	10	170306	170315	20 %	0 %	20 %	60 %	385235470
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172	NC_017386	TCGAT	2	10	210184	210193	20 %	40 %	20 %	20 %	385235506
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192	NC_017386	GGGCG	2	10	231977	231986	0 %	0 %	80 %	20 %	385235526
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217	NC_017386	CACGG	2	10	260315	260324	20 %	0 %	40 %	40 %	385235548
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219	NC_017386	TCGTG	2	10	263705	263714	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
220	NC_017386	CAACA	2	10	264477	264486	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
221	NC_017386	CAAGT	2	10	264672	264681	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
222	NC_017386	ATCAA	2	10	264828	264837	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
223	NC_017386	TTGAA	2	10	266663	266672	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
224	NC_017386	TTGCT	2	10	266962	266971	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
225	NC_017386	CTCAT	2	10	267292	267301	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.