MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ketogulonigenium vulgarum WSH-001 plasmid 1

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017386	CGCTG	2	10	1735	1744	0 %	20 %	40 %	40 %	385235308
2	NC_017386	GCTTC	2	10	5465	5474	0 %	40 %	20 %	40 %	385235313
3	NC_017386	CGCAA	2	10	5557	5566	40 %	0 %	20 %	40 %	385235313
4	NC_017386	CCCGA	2	10	5629	5638	20 %	0 %	20 %	60 %	385235313
5	NC_017386	CGCAG	2	10	5676	5685	20 %	0 %	40 %	40 %	385235313
6	NC_017386	TGATC	2	10	7746	7755	20 %	40 %	20 %	20 %	385235314
7	NC_017386	TTTCG	2	10	8299	8308	0 %	60 %	20 %	20 %	385235314
8	NC_017386	CTCCG	2	10	8629	8638	0 %	20 %	20 %	60 %	385235314
9	NC_017386	CCGTG	2	10	9548	9557	0 %	20 %	40 %	40 %	385235316
10	NC_017386	CCATG	2	10	14305	14314	20 %	20 %	20 %	40 %	385235320
11	NC_017386	CCGTC	2	10	19657	19666	0 %	20 %	20 %	60 %	385235326
12	NC_017386	TGGAC	2	10	20197	20206	20 %	20 %	40 %	20 %	385235326
13	NC_017386	GCGCC	2	10	20485	20494	0 %	0 %	40 %	60 %	385235326
14	NC_017386	GACGA	2	10	26427	26436	40 %	0 %	40 %	20 %	385235330
15	NC_017386	CATCT	2	10	29963	29972	20 %	40 %	0 %	40 %	385235335
16	NC_017386	GCAAG	2	10	32060	32069	40 %	0 %	40 %	20 %	385235338
17	NC_017386	TGCGC	2	10	32412	32421	0 %	20 %	40 %	40 %	385235338
18	NC_017386	GGCGT	2	10	32805	32814	0 %	20 %	60 %	20 %	385235339
19	NC_017386	CGACG	2	10	33686	33695	20 %	0 %	40 %	40 %	385235341
20	NC_017386	CACCG	2	10	33708	33717	20 %	0 %	20 %	60 %	385235341
21	NC_017386	CAGCA	2	10	36298	36307	40 %	0 %	20 %	40 %	385235346
22	NC_017386	CGAGG	2	10	38444	38453	20 %	0 %	60 %	20 %	385235347
23	NC_017386	GGCGA	2	10	38694	38703	20 %	0 %	60 %	20 %	385235347
24	NC_017386	CGCTG	2	10	39402	39411	0 %	20 %	40 %	40 %	385235348
25	NC_017386	GGCAT	2	10	42956	42965	20 %	20 %	40 %	20 %	385235351
26	NC_017386	TGTGC	2	10	43746	43755	0 %	40 %	40 %	20 %	385235352
27	NC_017386	GGAAA	2	10	44098	44107	60 %	0 %	40 %	0 %	385235352
28	NC_017386	CATCA	2	10	45927	45936	40 %	20 %	0 %	40 %	385235354
29	NC_017386	GCGCC	2	10	46491	46500	0 %	0 %	40 %	60 %	385235354
30	NC_017386	TGCGC	2	10	46693	46702	0 %	20 %	40 %	40 %	385235354
31	NC_017386	GCCTG	2	10	48258	48267	0 %	20 %	40 %	40 %	385235356
32	NC_017386	GGCTC	2	10	48656	48665	0 %	20 %	40 %	40 %	385235356
33	NC_017386	CGGAA	2	10	48761	48770	40 %	0 %	40 %	20 %	385235356
34	NC_017386	ATCGG	2	10	49418	49427	20 %	20 %	40 %	20 %	385235356
35	NC_017386	GAAGC	2	10	56665	56674	40 %	0 %	40 %	20 %	385235365
36	NC_017386	GCTAC	2	10	57459	57468	20 %	20 %	20 %	40 %	385235365
37	NC_017386	ACTGG	2	10	57567	57576	20 %	20 %	40 %	20 %	385235365
38	NC_017386	GGCCA	2	10	63755	63764	20 %	0 %	40 %	40 %	385235369
39	NC_017386	GGGCC	2	10	65789	65798	0 %	0 %	60 %	40 %	385235371
40	NC_017386	CTGCG	2	10	66634	66643	0 %	20 %	40 %	40 %	385235371
41	NC_017386	TGACC	2	10	70370	70379	20 %	20 %	20 %	40 %	385235371
42	NC_017386	TGCGC	2	10	70448	70457	0 %	20 %	40 %	40 %	385235371
43	NC_017386	CCTGA	2	10	70710	70719	20 %	20 %	20 %	40 %	385235371
44	NC_017386	GCGCC	2	10	71142	71151	0 %	0 %	40 %	60 %	385235371
45	NC_017386	CGACC	2	10	71414	71423	20 %	0 %	20 %	60 %	385235371
46	NC_017386	CGGCC	2	10	71476	71485	0 %	0 %	40 %	60 %	385235371
47	NC_017386	GATGG	2	10	72258	72267	20 %	20 %	60 %	0 %	385235371
48	NC_017386	TGGCT	2	10	72696	72705	0 %	40 %	40 %	20 %	385235371
49	NC_017386	ATGGG	2	10	72824	72833	20 %	20 %	60 %	0 %	385235371
50	NC_017386	CGCGG	2	10	76347	76356	0 %	0 %	60 %	40 %	385235374
51	NC_017386	GCCGA	2	10	79293	79302	20 %	0 %	40 %	40 %	385235377
52	NC_017386	TGATA	2	10	80199	80208	40 %	40 %	20 %	0 %	385235378
53	NC_017386	CGCGC	2	10	85795	85804	0 %	0 %	40 %	60 %	385235382
54	NC_017386	GCGGG	2	10	86126	86135	0 %	0 %	80 %	20 %	385235382
55	NC_017386	GGACA	2	10	86584	86593	40 %	0 %	40 %	20 %	385235383
56	NC_017386	GATCA	2	10	87717	87726	40 %	20 %	20 %	20 %	385235384
57	NC_017386	GCCGC	2	10	88403	88412	0 %	0 %	40 %	60 %	385235385
58	NC_017386	GATTG	2	10	89367	89376	20 %	40 %	40 %	0 %	385235386
59	NC_017386	TGAAA	2	10	90335	90344	60 %	20 %	20 %	0 %	385235388
60	NC_017386	GCGCC	2	10	90895	90904	0 %	0 %	40 %	60 %	385235388
61	NC_017386	CAATC	2	10	92591	92600	40 %	20 %	0 %	40 %	385235391
62	NC_017386	GTATC	2	10	93191	93200	20 %	40 %	20 %	20 %	385235391
63	NC_017386	GTCTC	2	10	95307	95316	0 %	40 %	20 %	40 %	385235394
64	NC_017386	AGCGC	2	10	97301	97310	20 %	0 %	40 %	40 %	385235395
65	NC_017386	AAAAG	2	10	100277	100286	80 %	0 %	20 %	0 %	385235398
66	NC_017386	AGGGT	2	10	102644	102653	20 %	20 %	60 %	0 %	385235401
67	NC_017386	CCGAT	2	10	103279	103288	20 %	20 %	20 %	40 %	385235403
68	NC_017386	CAATC	2	10	104611	104620	40 %	20 %	0 %	40 %	385235403
69	NC_017386	GCCGC	2	10	105547	105556	0 %	0 %	40 %	60 %	385235404
70	NC_017386	ATCCG	2	10	106578	106587	20 %	20 %	20 %	40 %	385235406
71	NC_017386	CGGCC	2	10	108054	108063	0 %	0 %	40 %	60 %	385235409
72	NC_017386	CTTGC	2	10	108649	108658	0 %	40 %	20 %	40 %	385235409
73	NC_017386	ATGCG	2	10	109529	109538	20 %	20 %	40 %	20 %	385235410
74	NC_017386	GATTA	2	10	110546	110555	40 %	40 %	20 %	0 %	385235411
75	NC_017386	GGTTG	2	10	111265	111274	0 %	40 %	60 %	0 %	385235413
76	NC_017386	CAGCG	2	10	111913	111922	20 %	0 %	40 %	40 %	385235415
77	NC_017386	GATCG	2	10	112978	112987	20 %	20 %	40 %	20 %	385235416
78	NC_017386	GCCGC	2	10	113035	113044	0 %	0 %	40 %	60 %	385235416
79	NC_017386	GCCGC	2	10	113660	113669	0 %	0 %	40 %	60 %	385235416
80	NC_017386	GATCT	2	10	114664	114673	20 %	40 %	20 %	20 %	385235418
81	NC_017386	TGATC	2	10	114849	114858	20 %	40 %	20 %	20 %	385235418
82	NC_017386	GGCGC	2	10	116604	116613	0 %	0 %	60 %	40 %	385235419
83	NC_017386	TGCGG	2	10	121254	121263	0 %	20 %	60 %	20 %	385235423
84	NC_017386	AAGGC	2	10	121324	121333	40 %	0 %	40 %	20 %	385235423
85	NC_017386	CAATC	2	10	121451	121460	40 %	20 %	0 %	40 %	385235423
86	NC_017386	CGGGC	2	10	122711	122720	0 %	0 %	60 %	40 %	385235424
87	NC_017386	GCGCG	2	10	124402	124411	0 %	0 %	60 %	40 %	385235426
88	NC_017386	GCATC	2	10	125576	125585	20 %	20 %	20 %	40 %	385235427
89	NC_017386	CGGCG	2	10	126873	126882	0 %	0 %	60 %	40 %	385235428
90	NC_017386	CTGCG	2	10	126980	126989	0 %	20 %	40 %	40 %	385235428
91	NC_017386	GATCT	2	10	127587	127596	20 %	40 %	20 %	20 %	385235429
92	NC_017386	GCCGT	2	10	127620	127629	0 %	20 %	40 %	40 %	385235429
93	NC_017386	GGTCA	2	10	129035	129044	20 %	20 %	40 %	20 %	385235430
94	NC_017386	GCAAC	2	10	129082	129091	40 %	0 %	20 %	40 %	385235430
95	NC_017386	CGCGG	2	10	130604	130613	0 %	0 %	60 %	40 %	385235432
96	NC_017386	CGTGC	2	10	130730	130739	0 %	20 %	40 %	40 %	385235432
97	NC_017386	GGCCG	2	10	131754	131763	0 %	0 %	60 %	40 %	385235434
98	NC_017386	CGATG	2	10	132709	132718	20 %	20 %	40 %	20 %	385235435
99	NC_017386	GACGC	2	10	133907	133916	20 %	0 %	40 %	40 %	385235438
100	NC_017386	GGGCA	2	10	134115	134124	20 %	0 %	60 %	20 %	385235438
101	NC_017386	CGCCC	2	10	137084	137093	0 %	0 %	20 %	80 %	385235442
102	NC_017386	CCGCC	2	10	137545	137554	0 %	0 %	20 %	80 %	385235442
103	NC_017386	AAAGA	2	10	139029	139038	80 %	0 %	20 %	0 %	385235444
104	NC_017386	CCGCA	2	10	139921	139930	20 %	0 %	20 %	60 %	385235445
105	NC_017386	CGGCG	2	10	142286	142295	0 %	0 %	60 %	40 %	385235448
106	NC_017386	CGCGC	2	10	142927	142936	0 %	0 %	40 %	60 %	385235449
107	NC_017386	GGGCC	2	10	143198	143207	0 %	0 %	60 %	40 %	385235449
108	NC_017386	CTGGT	2	10	144343	144352	0 %	40 %	40 %	20 %	385235450
109	NC_017386	CTGAT	2	10	146846	146855	20 %	40 %	20 %	20 %	385235451
110	NC_017386	GCGCC	2	10	146999	147008	0 %	0 %	40 %	60 %	385235452
111	NC_017386	CGCTG	2	10	147206	147215	0 %	20 %	40 %	40 %	385235452
112	NC_017386	GCCGC	2	10	147798	147807	0 %	0 %	40 %	60 %	385235452
113	NC_017386	GATCT	2	10	149633	149642	20 %	40 %	20 %	20 %	385235454
114	NC_017386	CGCGC	2	10	150066	150075	0 %	0 %	40 %	60 %	385235455
115	NC_017386	CGCAT	2	10	151119	151128	20 %	20 %	20 %	40 %	385235456
116	NC_017386	ATCGC	2	10	151689	151698	20 %	20 %	20 %	40 %	385235456
117	NC_017386	CTGCG	2	10	154341	154350	0 %	20 %	40 %	40 %	385235458
118	NC_017386	CCCCG	2	10	154802	154811	0 %	0 %	20 %	80 %	385235458
119	NC_017386	GCAGC	2	10	163527	163536	20 %	0 %	40 %	40 %	385235465
120	NC_017386	GCAAA	2	10	164491	164500	60 %	0 %	20 %	20 %	385235466
121	NC_017386	CAATC	2	10	165432	165441	40 %	20 %	0 %	40 %	385235467
122	NC_017386	CCAGC	2	10	165720	165729	20 %	0 %	20 %	60 %	385235467
123	NC_017386	CGCGG	2	10	166428	166437	0 %	0 %	60 %	40 %	385235468
124	NC_017386	ACGTC	2	10	167795	167804	20 %	20 %	20 %	40 %	385235468
125	NC_017386	CGGCG	2	10	169417	169426	0 %	0 %	60 %	40 %	385235469
126	NC_017386	GCGCA	2	10	170124	170133	20 %	0 %	40 %	40 %	385235470
127	NC_017386	CACGC	2	10	170306	170315	20 %	0 %	20 %	60 %	385235470
128	NC_017386	CGCGC	2	10	172309	172318	0 %	0 %	40 %	60 %	385235471
129	NC_017386	CCCGG	2	10	173793	173802	0 %	0 %	40 %	60 %	385235472
130	NC_017386	CGATG	2	10	174610	174619	20 %	20 %	40 %	20 %	385235473
131	NC_017386	ATGGC	2	10	175256	175265	20 %	20 %	40 %	20 %	385235474
132	NC_017386	ATCCA	2	10	175754	175763	40 %	20 %	0 %	40 %	385235474
133	NC_017386	CCATC	2	10	176205	176214	20 %	20 %	0 %	60 %	385235474
134	NC_017386	GCGCG	2	10	176939	176948	0 %	0 %	60 %	40 %	385235475
135	NC_017386	CATCC	2	10	177646	177655	20 %	20 %	0 %	60 %	385235475
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202	NC_017386	GCGAC	2	10	258731	258740	20 %	0 %	40 %	40 %	385235547
203	NC_017386	CACGG	2	10	260315	260324	20 %	0 %	40 %	40 %	385235548
204	NC_017386	CGCGC	2	10	261632	261641	0 %	0 %	40 %	60 %	385235549

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.