MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ketogulonigenium vulgarum WSH-001 plasmid 1

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017386	GTTT	2	8	38	45	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017386	GGGA	2	8	1684	1691	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017386	CTTG	2	8	4931	4938	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017386	CGTC	2	8	13888	13895	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017386	GAAA	2	8	27528	27535	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017386	GCAC	2	8	27638	27645	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017386	CCGC	2	8	29109	29116	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_017386	TGCG	2	8	30407	30414	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017386	CAGG	2	8	35915	35922	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017386	CAAC	2	8	64220	64227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017386	CAGA	2	8	64513	64520	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017386	CGGC	2	8	74109	74116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017386	TGCA	2	8	75932	75939	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017386	TTTG	2	8	88171	88178	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017386	TTAA	2	8	90253	90260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017386	GCGT	2	8	90279	90286	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017386	TGAG	2	8	92446	92453	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017386	TGGA	2	8	100947	100954	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017386	CCGC	2	8	101349	101356	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_017386	TGCC	2	8	101371	101378	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017386	CGGC	2	8	102873	102880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017386	GGGA	2	8	111687	111694	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017386	CTTC	2	8	113763	113770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017386	GGTC	2	8	114278	114285	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017386	TGGA	2	8	122090	122097	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017386	ATCG	2	8	122176	122183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017386	ATCA	2	8	127889	127896	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017386	GGGC	2	8	132419	132426	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017386	AACA	2	8	138741	138748	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017386	CAAT	2	8	138800	138807	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017386	CGGG	2	8	143592	143599	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017386	AACA	2	8	145714	145721	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017386	CAAG	2	8	152736	152743	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017386	GGGA	2	8	156334	156341	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017386	CGCA	2	8	157389	157396	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017386	ACGG	2	8	157449	157456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017386	CCCG	2	8	158075	158082	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_017386	GACT	2	8	172838	172845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017386	TCTT	2	8	179184	179191	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017386	GCAC	2	8	186339	186346	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017386	GGCG	2	8	203054	203061	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017386	CTAT	2	8	204915	204922	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017386	CAAA	2	8	204982	204989	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017386	AAAT	2	8	208683	208690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017386	ACCG	2	8	208710	208717	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017386	ATCT	2	8	215625	215632	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017386	TAAA	2	8	220232	220239	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017386	TTAC	2	8	224058	224065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017386	GCAA	2	8	224123	224130	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017386	CGCC	2	8	242911	242918	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_017386	GGGC	2	8	254718	254725	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017386	TAAG	2	8	256323	256330	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017386	TTAC	2	8	256338	256345	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017386	CGGG	2	8	260658	260665	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017386	GGGC	2	8	260825	260832	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017386	TATC	2	8	260833	260840	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017386	CCAG	2	8	260850	260857	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017386	GAAC	2	8	262720	262727	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017386	GTGA	2	8	263065	263072	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017386	TTGC	2	8	263474	263481	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017386	TTCT	2	8	264550	264557	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017386	TATG	2	8	264724	264731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017386	GCGA	2	8	265121	265128	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017386	GGCC	2	8	265174	265181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017386	CAAG	2	8	265452	265459	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017386	CGTC	2	8	265817	265824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017386	GATT	2	8	266360	266367	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017386	AGCC	2	8	267118	267125	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.