MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Ketogulonigenium vulgarum WSH-001 plasmid 2

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017385	GCCCGC	2	12	239	250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385235091
2	NC_017385	ATCGTC	2	12	527	538	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385235091
3	NC_017385	GCGCCT	2	12	634	645	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235091
4	NC_017385	CCAGCT	2	12	1263	1274	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385235092
5	NC_017385	GGTCGG	2	12	1722	1733	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385235092
6	NC_017385	TTGATC	2	12	3376	3387	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385235093
7	NC_017385	ATCAGC	2	12	10062	10073	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385235101
8	NC_017385	AGATCA	2	12	13727	13738	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385235105
9	NC_017385	CCTCGG	2	12	14543	14554	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235105
10	NC_017385	CTGGTC	2	12	14856	14867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385235106
11	NC_017385	TCCTGT	2	12	15265	15276	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385235106
12	NC_017385	TGCTGG	2	12	15364	15375	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385235106
13	NC_017385	CCTCGG	2	12	16395	16406	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235107
14	NC_017385	CGATGG	2	12	17074	17085	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385235108
15	NC_017385	GTCATG	2	12	18027	18038	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385235108
16	NC_017385	GGTGAT	2	12	18899	18910	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385235109
17	NC_017385	ACGGTG	2	12	19728	19739	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385235109
18	NC_017385	CGGCCT	2	12	22092	22103	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235112
19	NC_017385	GCCCAG	2	12	22673	22684	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235113
20	NC_017385	ACCTCG	2	12	25072	25083	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385235115
21	NC_017385	CGGGGG	2	12	27271	27282	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	385235117
22	NC_017385	GGGCCG	2	12	27921	27932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385235117
23	NC_017385	GACCTC	2	12	28664	28675	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385235118
24	NC_017385	CAAGGC	2	12	33154	33165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385235121
25	NC_017385	GGTGCG	2	12	38356	38367	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385235126
26	NC_017385	CGCCCA	2	12	40065	40076	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385235126
27	NC_017385	CCGATG	2	12	42724	42735	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385235128
28	NC_017385	CGGGTG	2	12	43440	43451	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385235129
29	NC_017385	CATCAC	3	18	43670	43687	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385235129
30	NC_017385	GTGCTG	2	12	43769	43780	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385235129
31	NC_017385	ACCGCC	2	12	45393	45404	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385235132
32	NC_017385	GCGGCA	2	12	47250	47261	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235133
33	NC_017385	TCGGCC	3	18	47357	47374	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235133
34	NC_017385	GGATGC	2	12	50245	50256	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385235134
35	NC_017385	GGCGAT	2	12	52620	52631	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385235137
36	NC_017385	AGAAAG	2	12	52980	52991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385235138
37	NC_017385	TGTCAT	2	12	54666	54677	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385235139
38	NC_017385	AGGGTC	2	12	54848	54859	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385235139
39	NC_017385	CAGCGC	2	12	57402	57413	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235141
40	NC_017385	GAATGA	2	12	62529	62540	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385235147
41	NC_017385	GGTGCC	2	12	63744	63755	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385235148
42	NC_017385	GTGGCC	2	12	64631	64642	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385235149
43	NC_017385	CTTTGC	2	12	64766	64777	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385235149
44	NC_017385	GGCAAA	2	12	65612	65623	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385235149
45	NC_017385	CGGCAC	2	12	70116	70127	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235154
46	NC_017385	GCGCCT	2	12	70295	70306	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235154
47	NC_017385	GACAAA	2	12	72089	72100	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385235156
48	NC_017385	CGCGGG	2	12	72313	72324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385235156
49	NC_017385	TGAAGG	2	12	72895	72906	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385235156
50	NC_017385	CGGCGC	2	12	73819	73830	0 %	0 %	50 %	50 %	385235157
51	NC_017385	CAGCGA	2	12	77613	77624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385235160
52	NC_017385	TGGCAA	2	12	77930	77941	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385235160
53	NC_017385	GGTCGC	2	12	77942	77953	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385235160
54	NC_017385	CCTCGG	2	12	79802	79813	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235162
55	NC_017385	GCAGCG	2	12	80579	80590	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235162
56	NC_017385	GTCGAC	2	12	81033	81044	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385235162
57	NC_017385	CAGTTC	2	12	87576	87587	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385235170
58	NC_017385	AACCTG	2	12	90995	91006	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385235174
59	NC_017385	GCCGTC	2	12	94848	94859	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235177
60	NC_017385	CTGCCG	2	12	95226	95237	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235177
61	NC_017385	TCGAAG	2	12	96487	96498	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385235178
62	NC_017385	AAAGCC	2	12	97129	97140	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385235178
63	NC_017385	ACAGGC	2	12	99928	99939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385235179
64	NC_017385	CGCCGG	2	12	109619	109630	0 %	0 %	50 %	50 %	385235186
65	NC_017385	CCTCGG	2	12	111689	111700	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235188
66	NC_017385	CCCGAA	2	12	111910	111921	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385235188
67	NC_017385	CAGCGC	2	12	113852	113863	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235191
68	NC_017385	GAACAG	2	12	117387	117398	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385235195
69	NC_017385	GCGACC	2	12	118626	118637	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235196
70	NC_017385	TTCCGG	2	12	118706	118717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385235196
71	NC_017385	CGGCTT	2	12	118754	118765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385235196
72	NC_017385	GCCGAG	2	12	121118	121129	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235201
73	NC_017385	GGCGCG	2	12	124770	124781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385235205
74	NC_017385	GACTTT	2	12	130237	130248	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385235208
75	NC_017385	GCCGGT	2	12	130328	130339	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385235208
76	NC_017385	CACGGC	2	12	134740	134751	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235211
77	NC_017385	CCGCGA	2	12	134789	134800	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235211
78	NC_017385	AGGCCA	2	12	135176	135187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385235211
79	NC_017385	GACCGA	2	12	135279	135290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385235211
80	NC_017385	CGATGT	2	12	136699	136710	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385235212
81	NC_017385	CTGGAT	2	12	136985	136996	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385235212
82	NC_017385	GCAGGC	2	12	142599	142610	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235218
83	NC_017385	ACCGGC	2	12	143739	143750	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235219
84	NC_017385	CAGGTG	2	12	144324	144335	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385235219
85	NC_017385	TGGCGC	2	12	147799	147810	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385235222
86	NC_017385	CGCTGG	2	12	147904	147915	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385235222
87	NC_017385	GCACCC	2	12	148210	148221	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385235222
88	NC_017385	CGGCAT	2	12	148582	148593	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385235223
89	NC_017385	ACCCTC	2	12	149673	149684	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	385235224
90	NC_017385	GACCTC	2	12	150315	150326	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385235224
91	NC_017385	AGGCCG	2	12	151476	151487	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235225
92	NC_017385	GGCGCG	2	12	152171	152182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385235226
93	NC_017385	CGAGGC	3	18	156221	156238	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235229
94	NC_017385	CCGAGA	2	12	157205	157216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385235230
95	NC_017385	GCGCCT	2	12	158145	158156	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235230
96	NC_017385	CTGGCG	2	12	159012	159023	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385235231
97	NC_017385	CGCTGG	2	12	167950	167961	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385235237
98	NC_017385	AAGCCC	2	12	171653	171664	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385235240
99	NC_017385	TGATGC	2	12	172032	172043	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385235240
100	NC_017385	CCCGAC	2	12	175541	175552	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385235242
101	NC_017385	CGCCTG	2	12	176398	176409	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235243
102	NC_017385	GCACCT	2	12	179817	179828	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385235246
103	NC_017385	GCCAGC	2	12	180872	180883	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235246
104	NC_017385	GGGCTT	2	12	181767	181778	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385235248
105	NC_017385	CGCGCC	2	12	184070	184081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385235250
106	NC_017385	ACGCTG	2	12	184932	184943	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385235251
107	NC_017385	CAGCGC	2	12	187799	187810	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235253
108	NC_017385	CCTGAA	2	12	188453	188464	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385235254
109	NC_017385	ACGGCG	2	12	189034	189045	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235254
110	NC_017385	CGCTGC	2	12	190476	190487	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235256
111	NC_017385	AAGCTG	2	12	190691	190702	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385235256
112	NC_017385	CGATGA	2	12	190716	190727	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385235256
113	NC_017385	GCCTTG	2	12	190809	190820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385235256
114	NC_017385	CTCGGC	2	12	193153	193164	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235258
115	NC_017385	CGAGGC	2	12	194269	194280	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235258
116	NC_017385	CAATAC	2	12	194526	194537	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385235258
117	NC_017385	CGCAGG	2	12	194628	194639	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235259
118	NC_017385	CGCCAG	2	12	196429	196440	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235260
119	NC_017385	GTTGCC	2	12	196936	196947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385235261
120	NC_017385	TGCGTC	2	12	203343	203354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385235266
121	NC_017385	ATAGGG	2	12	204357	204368	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385235267
122	NC_017385	GGCATC	2	12	204582	204593	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385235267
123	NC_017385	TAAAGG	2	12	206005	206016	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385235268
124	NC_017385	GGGCAT	2	12	207247	207258	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385235269
125	NC_017385	GGCCTC	2	12	208066	208077	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235270
126	NC_017385	CCTTGG	2	12	209495	209506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385235271
127	NC_017385	GCCAGC	2	12	213659	213670	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385235276
128	NC_017385	ACCAGC	2	12	213899	213910	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385235276
129	NC_017385	ACCCGC	2	12	215358	215369	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385235278
130	NC_017385	GATCGA	2	12	221038	221049	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385235283
131	NC_017385	GGTGCG	2	12	224633	224644	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385235286
132	NC_017385	TGCTGG	2	12	224797	224808	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385235286
133	NC_017385	GCCTTG	2	12	225992	226003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385235288
134	NC_017385	TTTTGC	2	12	229878	229889	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385235292
135	NC_017385	GCCCCT	2	12	230101	230112	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385235292
136	NC_017385	ATCGCG	2	12	232031	232042	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385235294
137	NC_017385	TGCCGC	2	12	236316	236327	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385235299
138	NC_017385	CCGAGG	2	12	237420	237431	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385235300
139	NC_017385	GCTGGC	2	12	241589	241600	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385235305

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.