MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ketogulonigenium vulgarum WSH-001 plasmid 2

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017385	AGCC	2	8	6288	6295	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017385	GCAA	2	8	6886	6893	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017385	GAAT	2	8	12099	12106	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017385	GTTT	2	8	32378	32385	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017385	CTTT	2	8	36025	36032	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017385	TGGA	2	8	41571	41578	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017385	GGCA	2	8	51117	51124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017385	GCCA	2	8	58538	58545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017385	CGGG	2	8	62410	62417	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017385	ATAA	2	8	62487	62494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017385	GGGT	2	8	74576	74583	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017385	AATG	2	8	74604	74611	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017385	GGCG	2	8	76530	76537	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017385	TGAT	2	8	82643	82650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017385	TCCA	2	8	83818	83825	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017385	CCGG	2	8	84832	84839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017385	TGGC	2	8	88208	88215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017385	TAGC	2	8	89888	89895	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017385	GGTC	2	8	90660	90667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017385	CGGG	2	8	90714	90721	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017385	GCAA	2	8	101310	101317	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017385	CTGT	2	8	102120	102127	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017385	GACA	2	8	102276	102283	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017385	CCGT	2	8	102510	102517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017385	GCCG	2	8	112073	112080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017385	GGCC	2	8	116395	116402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017385	GGCG	2	8	116803	116810	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017385	ATAA	4	16	121946	121961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017385	ATTT	2	8	125137	125144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017385	CGCC	2	8	135886	135893	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_017385	TCGC	2	8	145701	145708	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017385	CCGC	2	8	153004	153011	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_017385	CTGC	2	8	163779	163786	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017385	GCAA	2	8	165517	165524	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017385	GATT	2	8	177838	177845	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017385	CAGA	2	8	177891	177898	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017385	ACAT	2	8	189683	189690	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017385	TTGG	2	8	195636	195643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017385	CCGC	3	12	196633	196644	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_017385	CAGA	2	8	202772	202779	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017385	ATTC	2	8	206302	206309	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017385	AAAC	2	8	217158	217165	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017385	GGAG	2	8	221900	221907	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017385	CGCC	2	8	233717	233724	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_017385	CAGC	2	8	235519	235526	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017385	CATT	2	8	236858	236865	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017385	GCCC	2	8	242340	242347	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_017385	CGCC	2	8	242566	242573	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_017385	CTGG	2	8	242590	242597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.