MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ketogulonigenium vulgarum WSH-001 chromosome

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017384	CAGCGC	2	12	27428	27439	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017384	GATGCG	2	12	28293	28304	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017384	ACCAGC	2	12	28774	28785	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017384	CGCTGC	2	12	29485	29496	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017384	TCCAGA	2	12	89187	89198	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017384	CGGGCA	2	12	91167	91178	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017384	GCGGTG	2	12	91196	91207	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017384	GTTCTG	2	12	117537	117548	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017384	CTTTAC	2	12	158228	158239	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017384	CCATCG	2	12	158742	158753	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017384	ATCTTC	2	12	202590	202601	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017384	GGCCGA	2	12	205614	205625	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017384	TGATCC	2	12	219414	219425	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017384	GGCCGA	2	12	308234	308245	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017384	GGCGCG	2	12	308246	308257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017384	CGATGT	2	12	361741	361752	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017384	GACGGC	2	12	363495	363506	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017384	TGTCGA	2	12	363860	363871	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017384	CGCTGG	2	12	364189	364200	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017384	AGGCCG	2	12	370829	370840	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017384	CTGCGC	2	12	370991	371002	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017384	CATTGA	2	12	371127	371138	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017384	TCAAAG	2	12	406756	406767	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017384	CAGCGC	2	12	407688	407699	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017384	CCTCGG	2	12	409143	409154	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017384	TCGCTG	2	12	409268	409279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017384	CTTTGC	3	18	462776	462793	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017384	CGGCAC	2	12	465190	465201	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017384	CGCCAG	2	12	505748	505759	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017384	GCAAGC	2	12	507370	507381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017384	TCGACC	2	12	511184	511195	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017384	TGCGGG	2	12	548277	548288	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017384	TCGCTG	2	12	602424	602435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017384	GCGCTG	3	18	603595	603612	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017384	TTGCCA	2	12	645299	645310	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017384	TTGGCC	2	12	691653	691664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017384	AAGAAT	2	12	721232	721243	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017384	AGCGCA	2	12	725979	725990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017384	CAGCGC	2	12	726530	726541	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017384	GCTCAC	2	12	757005	757016	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017384	CTACAA	2	12	764757	764768	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017384	GGGCGG	2	12	784932	784943	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017384	TTTTCA	2	12	787047	787058	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017384	AAAGGC	2	12	791014	791025	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017384	TCAAGC	2	12	791076	791087	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017384	TGTCGA	2	12	793022	793033	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017384	ATCGAG	2	12	817167	817178	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017384	CGGTAT	2	12	820383	820394	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017384	CGCAGG	2	12	820485	820496	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017384	GGTGCT	2	12	820616	820627	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017384	CTTTCA	2	12	895974	895985	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017384	GCGCTG	2	12	912763	912774	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017384	TTTTGC	2	12	913500	913511	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017384	CAAGGG	2	12	937380	937391	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017384	CCTTCG	2	12	998033	998044	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017384	GGTTGA	2	12	1072731	1072742	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017384	CCCGTT	2	12	1102463	1102474	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017384	GAGACA	2	12	1133781	1133792	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017384	CCAGCA	2	12	1133989	1134000	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017384	ATGGCG	2	12	1139846	1139857	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017384	GGCGCT	2	12	1139901	1139912	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017384	CGCCTG	2	12	1141089	1141100	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017384	ACCCGC	2	12	1141166	1141177	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017384	GCATCG	2	12	1249658	1249669	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017384	GATTTC	2	12	1395231	1395242	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017384	CAGCCG	2	12	1396127	1396138	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017384	AAGCTG	2	12	1398431	1398442	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017384	TGCGCC	2	12	1399755	1399766	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017384	CTGGCG	2	12	1400027	1400038	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017384	TCGCAC	2	12	1400500	1400511	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017384	GAGCTG	2	12	1401163	1401174	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017384	TCGAGG	2	12	1477832	1477843	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017384	CCTTGA	2	12	1477845	1477856	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017384	GTCATG	2	12	1478391	1478402	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017384	TCATTC	2	12	1485003	1485014	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017384	CTTTCC	2	12	1519514	1519525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017384	CCGGAT	2	12	1546185	1546196	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017384	GCGGTC	2	12	1577922	1577933	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017384	CCGCGC	2	12	1580669	1580680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017384	GATCCA	2	12	1646979	1646990	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017384	ACCTGC	2	12	1647056	1647067	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017384	ACCTGA	2	12	1649779	1649790	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017384	GGGTTG	2	12	1674526	1674537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017384	GGATCA	2	12	1698191	1698202	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017384	GTTGGC	2	12	1741463	1741474	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017384	CGCATG	2	12	1836183	1836194	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017384	GAGGCG	2	12	1844148	1844159	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017384	AGGCGC	2	12	1883993	1884004	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017384	ATGCCG	2	12	1884050	1884061	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017384	ACCCTG	2	12	1884115	1884126	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017384	CAAGCG	2	12	1901512	1901523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017384	GGGCGC	2	12	1936179	1936190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017384	CGACCC	2	12	1965368	1965379	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017384	CCAAAG	2	12	1973762	1973773	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017384	GGCCTT	2	12	1982510	1982521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017384	CGCCTG	2	12	2059226	2059237	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017384	CGGCAG	2	12	2060836	2060847	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017384	AGCGTT	2	12	2100457	2100468	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017384	CCCTTG	2	12	2105229	2105240	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017384	AAAGCG	2	12	2148375	2148386	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017384	GGCGGG	2	12	2166284	2166295	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017384	GCGATG	2	12	2166697	2166708	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017384	TCGCCG	2	12	2267316	2267327	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017384	GGGTCG	2	12	2290412	2290423	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017384	CATCCA	2	12	2318460	2318471	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017384	GTGGCC	2	12	2318485	2318496	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017384	CGCAGG	2	12	2359441	2359452	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017384	CGTCGC	2	12	2361643	2361654	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017384	CGCAAG	2	12	2362227	2362238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017384	TGGCGC	2	12	2363095	2363106	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017384	GATAAA	2	12	2375150	2375161	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017384	AGGCGC	2	12	2376766	2376777	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017384	TCTCGT	2	12	2447722	2447733	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017384	GGTTCA	2	12	2451715	2451726	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017384	CCTCGC	2	12	2457938	2457949	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017384	CAAAGG	2	12	2461687	2461698	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017384	GGGCGC	2	12	2497715	2497726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017384	ATCCGG	2	12	2506799	2506810	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017384	TTGCGG	2	12	2563608	2563619	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017384	GTGCTG	2	12	2564696	2564707	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017384	ATCCGG	2	12	2613840	2613851	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017384	TTTGGC	2	12	2616548	2616559	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017384	CAGGCG	2	12	2616668	2616679	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017384	GGCGCT	2	12	2617874	2617885	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017384	ACGTTG	2	12	2624328	2624339	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017384	CGTGGG	2	12	2625619	2625630	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017384	CCTTGG	2	12	2625821	2625832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017384	CCGCGC	2	12	2627694	2627705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017384	GGCGGG	2	12	2645713	2645724	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017384	TGCGGT	2	12	2658248	2658259	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017384	GTCGCC	2	12	2679515	2679526	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017384	TGGGTC	2	12	2737927	2737938	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017384	GGCCAA	2	12	2748246	2748257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017384	CAAGGC	2	12	2748564	2748575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017384	CCGCCA	2	12	2758270	2758281	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017384	CGGGCG	2	12	2760063	2760074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017384	ATCCGG	2	12	2765407	2765418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.